Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469039
• Subject: XM_006723347.3
• Aligned Length: 1593
• Identities: 1560
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAAGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAAGCT  74

Query   75  GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC  148

Query  149  CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC  222

Query  223  CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG  296

Query  297  TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC  370

Query  371  AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC  444

Query  445  GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC  518

Query  519  CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG  592

Query  593  GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC  666

Query  667  TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG  740

Query  741  CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA  814

Query  815  TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC  888

Query  889  GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC  962

Query  963  TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG  1036

Query 1037  GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT  1110

Query 1111  CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA  1184

Query 1185  CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA  1258

Query 1259  ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG  1332

Query 1333  TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG  1406

Query 1407  GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACC---------------------------------  1447
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 1407  GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCGTGAGCTCCTGGAAACCAGTTTAGCCGGGCCAG  1480

Query 1448  AAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGC  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGC  1554

Query 1522  CCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGTTTCAAT  1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGTTTCAAT  1593