Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469039
• Subject: XM_024451682.1
• Aligned Length: 1560
• Identities: 1494
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAAGCT  74
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGAGGCTGCAGAAGCT  17

Query   75  GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  GGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCAATC  91

Query  149  CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||
Sbjct   92  CTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTT---------AGGCCTTGGGAAC  156

Query  223  CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  157  CCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAGCTG  230

Query  297  TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  231  TGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTCTCC  304

Query  371  AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305  AGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGTTCC  378

Query  445  GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  379  GTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGGGAC  452

Query  519  CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  453  CCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACCCTG  526

Query  593  GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  527  GAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAGGCC  600

Query  667  TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  TCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGGTGG  674

Query  741  CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  675  CACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGGACA  748

Query  815  TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  TGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCACGGC  822

Query  889  GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  GTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCTGGC  896

Query  963  TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  TGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGGACG  970

Query 1037  GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  GGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTGAAT  1044

Query 1111  CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  CCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCCCAA  1118

Query 1185  CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  CGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAATCA  1192

Query 1259  ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193  ATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTTTTG  1266

Query 1333  TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  TTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCACTCG  1340

Query 1407  GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  GGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAGTGG  1414

Query 1481  GCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415  GCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCCAGT  1488

Query 1555  TTCAAT  1560
            ||||||
Sbjct 1489  TTCAAT  1494