Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469039
- Subject:
- XR_935852.2
- Aligned Length:
- 1908
- Identities:
- 1346
- Gaps:
- 562
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TTTGTTGGAAGTGGAGAGTGGAGGGTCAGAAGGGAGTGGACCAGTTCAGGTCCCAGAGGGAATCCTCCCTCCCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGAGCCGTCTTTCTTCTCCTCCCTATTTCGCAGATATCCCGAGATTAGGTCCCCAGCTTCCAAAGAGAGGATC 148
Query 1 ---ATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAA 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAATGTCTCAGGATAATGACACATTGATGAGAGACATCCTGGGGCATGAGCTCGCTGCTATGAGGCTGCAGAA 222
Query 72 GCTGGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCA 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTGGAACAGCAGCGGCGGCTGTTTGAAAAGAAGCAGCGACAGAAGCGCCAGGAGCTCCTCATGGTTCAGGCCA 296
Query 146 ATCCTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGG 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCCTGACGCTTCCCCGTGGCTTTGGCGCTCTTGTCTGCGGGAGGAGCGCCTTTTAGGTGACAGAGGCCTTGGG 370
Query 220 AACCCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAG 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACCCTTTCCTCCGGAAGAAAGTGTCAGAGGCACATCTGCCCTCTGGCATCCACAGTGCCCTGGGCACCGTGAG 444
Query 294 CTGTGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGTGGTGGAGACGGCAGGGGCGAGCGCGGCCTCCCGACACCGCGGACAGAAGCAGTGTTCAGGAATCTCGGTC 518
Query 368 TCCAGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGT 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCAGTCCCCTTTCTTATCCTGGCTCCCAGACAATTCCGATGCAGAATTGGAGGAAGTCTCCGTGGAGAATGGT 592
Query 442 TCCGTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGG 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCGTCTCTCCCCCACCTTTTAAACAGTCTCCGAGAATCCGACGCAAGGGTTGGCAAGCCCACCAACGACCTGG 666
Query 516 GACCCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACC 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACCCGTGCAGAGGGTGAGAGTGACTCCCAGGATATGGGAGATGCACACAAGTCACCCAATATGGGACCAAACC 740
Query 590 CTGGAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAG 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGGAATGGATGGTGACTGTGTATATGAAAACTTGGCCTTCCAAAAGGAAGAAGACTTGGAAAAGAAGAGAGAG 814
Query 664 GCCTCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGG 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCTCTGAGTCTACAGGGACGAACTCCTCAGCAGCACACAACGAAGAGTTGTCCAAGGCCCTGAAAGGCGAGGG 888
Query 738 TGGCACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGG 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGGCACGGACAGCGACCATATGAGGCACGAAGCCTCCTTGGCAATCCGCTCCCCCTGCCCTGGGCTGGAGGAGG 962
Query 812 ACATGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCAC 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACATGGAAGCCTACGTGCTGCGGCCAGCGCTCCCGGGCACCATGATGCAGTGCTACCTCACCCGTGACAAGCAC 1036
Query 886 GGCGTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGCGTGGACAAGGGCTTGTTCCCCCTCTACTACCTCTACCTGGAGACCTCTGACAGCCTGCAGCGCTTCCTCCT 1110
Query 960 GGCTGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGCTGGGCGAAAGAGAAGAAGGAGCAAAACTTCTAATTACCTCATCTCCCTGGATCCTACACACCTATCTCGGG 1184
Query 1034 ACGGGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAGATCCAATGTCTTCAGCACCAAGTTCACCATCTTTGACAATGGGGTG 1107
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACGGGGACAATTTCGTGGGCAAAGTCAG---------------------------------------------- 1212
Query 1108 AATCCTGACCGGGAGCATTTAACCAGGAATACTGCCCGGATCAGACAGGAGCTGGGGGCTGTGTGTTATGAGCC 1181
Sbjct 1213 -------------------------------------------------------------------------- 1212
Query 1182 CAACGTCTTAGGATACCTGGGGCCTCGGAAAATGACTGTGATTCTCCCAGGAACCAACAGCCAGAACCAGCGAA 1255
Sbjct 1213 -------------------------------------------------------------------------- 1212
Query 1256 TCAATGTCCAGCCACTAAATGAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTT 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 --------------------GAACAGGAGTCGCTACTGAGTCGTTACCAACGTGGGGACAAACAAGGGTTGCTT 1266
Query 1330 TTGTTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCAC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 TTGTTGCACAACAAAACCCCGTCGTGGGACAAGGAGAACGGTGTCTACACGCTCAATTTCCATGGTCGAGTCAC 1340
Query 1404 TCGGGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAG 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 TCGGGCTTCGGTGAAGAACTTCCAAATCGTGGATCCCAAACACCAAGAACATCTGGTGCTCCAGTTCGGCCGAG 1414
Query 1478 TGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCC 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 TGGGCCCAGACACATTCACCATGGACTTCTGCTTTCCATTTAGCCCGCTCCAGGCCTTCAGCATCTGCTTGTCC 1488
Query 1552 AGTTTCAAT----------------------------------------------------------------- 1560
|||||||||
Sbjct 1489 AGTTTCAATTAGAAGCTGGCTGTTGAATAACTCAATAAAATACCATACCCTTGCCAGCTTCTGTGCCTCCTCAT 1562
Query 1561 -------------------------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1563 TTGGAGGAAGGGCCCCGACATGCCTTCTTTTGCACCACCTTAATAACCAACACTGACCGGGCAAGGTGGCTCAC 1636
Query 1561 ---------------------------------------------------------- 1560
Sbjct 1637 GCCTGTAATCCCAACACTTTGGCAGGCTGAAGCTGGTGCATCACCTGAAGTCAGGAGA 1694