Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000469068
Subject:
NM_001350129.2
Aligned Length:
1450
Identities:
1004
Gaps:
446

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGT  444
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGAGACTGTGCACAGT  17

Query  445  TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTG-------------------AGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCT  499
            |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGTCCTAGTCTCACCCTTAAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCT  91

Query  500  GCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAG  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  GCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAG  165

Query  574  CAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCAT  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  CAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCAT  239

Query  648  TCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTG  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  TCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTG  313

Query  722  AAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAA  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  AAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAA  387

Query  796  GGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  GGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGT  461

Query  870  GCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  GCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAG  535

Query  944  CTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAA  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  CTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAA  609

Query 1018  GATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAG  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  GATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAG  683

Query 1092  AGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGT  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  AGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGT  757

Query 1166  TTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCAT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  TTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCAT  831

Query 1240  CTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAATTCCTGAC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  CTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAATTCCTGAC  905

Query 1314  TGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTG  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  TGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTG  979

Query 1388  GGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  GGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC  1023