Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469068
• Subject: NM_008911.2
• Aligned Length: 1441
• Identities: 1228
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74
            |||||||||||.|||.|.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||||.|||.|.|||
Sbjct    1  ATGGGCCGGACTGTGATAGTACTTGGCGGAGGTATCAGTGGATTGGCCGCAAGTTATCATCTGATCCGAGGCCC  74

Query   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148
            |.|.||.|||||||||.||.||||||||.||||..|||||.|||||||.|||||.|||||..|.|||||..|..
Sbjct   75  CAGTCCTCCTAAGGTGATCTTAGTGGAGGGCAGCAAGCGTTTGGGAGGATGGATCCGCTCAATCCGAGGATCAG  148

Query  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTG  222
            |||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||||
Sbjct  149  ATGGTGCGATCTTTGAACTTGGACCTCGAGGGATTAGGCCGGCTGGAGCCCTGGGAGCCCGGACCCTGCTCCTG  222

Query  223  GTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT  296
            ||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTTCTGAACTTGGCTTGGAGTCTGAAGTCTTGCCTGTCCGAGGGGATCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT  296

Query  297  CTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCA  370
            .||.||.||||||.|||||||..|.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  297  GTATGTAGGCGGTACCCTGCACCCTCTACCCTCCGGCCTCAGGGGGCTACTCCGTCCTTCACCCCCCTTCTCAA  370

Query  371  AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||.||...||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGTTGCTGAAGCCCAGGGGCAAAGAGCCTGATGAAACTGTGCACAGT  444

Query  445  TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCATCTTTAGCCATGGACAGTCTTTGCCGAGGAGTATTTGCTGG  518

Query  519  CAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATAT  592
            |||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  CAACAGCCGGGAGCTCAGCATCCGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAACAAACCCACCGGTCCATAT  592

Query  593  TACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAG  666
            |.|||||.|||||||||||.|||||.|.||..||.|||||.||.||..||||.|||||.||||||..|||||||
Sbjct  593  TGCTGGGGCTGCTGCTGGGCGCAGGACAGAGTCCCCAGCCGGATTCCTCACTAATTCGTCAGGCCCGGGCTGAG  666

Query  667  CGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAG  740
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||.|||||||.|||||.|||.|.|..|||||..|.||||.
Sbjct  667  CGATGGAGCCAGTGGTCACTCCGTGGAGGGCTGGAGGTGTTGCCCCAGGCTCTTCACAATCACCTAGCAAGTAA  740

Query  741  GGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTC  814
            .|||||||.|||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  AGGGGTCACTGTCCTCAGTGGGCAGCCAGTCTGTGGGCTCAGCCTTCAGCCAGAAGGGCGCTGGAAGGTGTCTC  814

Query  815  TAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCT  888
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||..|||||||||||
Sbjct  815  TAGGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACATTATAAGTGCCATTCCAGCTTCAGAGCTCAGCAAGCTGCTCCCT  888

Query  889  GCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTA  962
            ||.||||||||.|||||.|||||...|||||||.||||||..|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCGAGGCTGCACCTCTAGCTCGAATCCTGAGTACCATCAAGGCAGTGTCTGTTGCTGTGGTGAATCTGCAGTA  962

Query  963  CCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGA--GTCCTGGG  1034
            ||.||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||  ||  ||||||||
Sbjct  963  CCGAGGAGCTTGTCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCGTCAGAAGACCC--GACTGTCCTGGG  1034

Query 1035  AATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGG  1108
            |||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||.||||||..||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1035  AATTGTGTACGACTCGGTGGCTTTTCCTGAACAGGATGGGAACCCCCCAAGCCTCAGAGTGACTGTGATGTTGG  1108

Query 1109  GAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGG--------CTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGC  1174
            ||||||.||||.||||||..||..|.||| |.||        |||       ||||..||||||||.||.||.|
Sbjct 1109  GAGGTTACTGGCTACAGAAGCTAAAAGCT-GCGGGCCACCAACTG-------TCTCCAGAGCTGTTCCAGCAAC  1174

Query 1175  GGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAG  1248
            ..||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||....|||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1175  AAGCCCAGGAGGCAGCCGCCACACAGTTAGGACTGAAAGAACCACCGAGTCACTGCCTGGTCCATCTACACAAG  1248

Query 1249  AACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAATTCCTGACTGCTCACAG  1322
            |||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1249  AACTGTATCCCTCAGTATACAATAGGCCACTGGCAAAAACTAGACTCAGCTATGCAATTCCTGACGGCCCAGAG  1322

Query 1323  GTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGG  1396
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  GTTGCCCCTGACTTTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGGGTTGCTGTCAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGG  1396

Query 1397  CAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC  1431
            |||||||...||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1397  CAGCAGTTGCTGTCCTGGGCACAGAATCTAACAGC  1431