Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469068
• Subject: XM_006711404.4
• Aligned Length: 1560
• Identities: 1431
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCGCCTCCCCGTGGACTGGCCTTAAGTGTCCCTATCTATTCTCCCTACGACCAAAGCTCCTGCGGCCT  74

Query    1  ----------------------------------------ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCCTCTAGGGTTGTCACCCTAGCTGGACCTGGTTTCCGCATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  148

Query   35  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  222

Query  109  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  296

Query  183  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT---------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGG  241
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTGGCATGTGGAGAGCAGGTTTCTGAGCTTGGCTTGG  370

Query  242  ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG  444

Query  316  CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG  518

Query  390  GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG  592

Query  464  GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC  666

Query  538  ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG  740

Query  612  GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC  814

Query  686  TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA  888

Query  760  GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA  962

Query  834  GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG  1036

Query  908  CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT  1110

Query  982  GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC  1184

Query 1056  TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC  1258

Query 1130  TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA  1332

Query 1204  GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCA  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCA  1406

Query 1278  CTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAATTCCTGACTGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCT  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAATTCCTGACTGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCT  1480

Query 1352  ATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCT  1425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCT  1554

Query 1426  AACAGC  1431
            ||||||
Sbjct 1555  AACAGC  1560