Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469068
• Subject: XM_011509670.2
• Aligned Length: 1751
• Identities: 1238
• Gaps: 484

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCGCCTCCCCGTGGACTGGCCTTAAGTGTCCCTATCTATTCTCCCTACGACCAAAGCTCCTGCGGCCT  74

Query    1  ----------------------------------------ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCCTCTAGGGTTGTCACCCTAGCTGGACCTGGTTTCCGCATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  148

Query   35  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  222

Query  109  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  296

Query  183  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT---------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGG  241
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTGGCATGTGGAGAGCAGGTTTCTGAGCTTGGCTTGG  370

Query  242  ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG  444

Query  316  CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG  389
            ||||||||||||||||||||||  |..|||.||      |||||                              
Sbjct  445  CATGCCCTACCCACTGGCCTCA--GTCCTAGTC------TCACC------------------------------  480

Query  390  GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG  463
                                                                                      
Sbjct  481  --------------------------------------------------------------------------  480

Query  464  GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC  537
              |.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  --CTTAAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC  552

Query  538  ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG  626

Query  612  GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC  700

Query  686  TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA  774

Query  760  GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA  848

Query  834  GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG  922

Query  908  CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT  996

Query  982  GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC  1070

Query 1056  TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC  1144

Query 1130  TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA  1218

Query 1204  GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCC-----CCAGT--------  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||     |||||        
Sbjct 1219  GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGA--------CCAAGAACCAGTTGAAGTGG  1284

Query 1265  --ATACACT------AGGTC-----ACTGGCAAAAACTA--GAGT---CAG------CTAGGCAA---------  1305
              |.|.|.|      |||.|     |.||||     |||  ||||   |||      .||||.||         
Sbjct 1285  CGACAGAGTCATGACAGGACCGTGGAGTGGC-----CTAAGGAGTACCCAGGGCGAAGTAGGAAACAGGCTCCT  1353

Query 1306  -------TTCCTG-------------ACTGCTCA----CAGGTTGCCCCTGAC--TCTGGCTGGAGCCTCCTAT  1353
                   |||.||             |||.||||    ||||  |.||.||||  .||||..|..||||||   
Sbjct 1354  TCTATTCTTCATGTGCCTGGGTGCCAACTCCTCAGGTGCAGG--GACCGTGACCACCTGGGGGCTGCCTCC---  1422

Query 1354  GAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCG-----CCAG-GCAGCA------GTCAGTGT-----C  1410
                                         |.||.|.||     |||| ||| ||      |||  |.|     |
Sbjct 1423  -----------------------------GTGTCGACGCATTCCCAGCGCA-CATACCTGGTC--TTTTGCTGC  1464

Query 1411  CTG--GGCACAG--AACCTAACAGC-------------------------------------------------  1431
            |||  |.|||.|  |.||.||||||                                                 
Sbjct 1465  CTGTCGTCACCGCCACCCCAACAGCCGGGCAGGCATCGCTGCCGCCATCTTGGAAGCGGGCGCTGCGGGGGCGG  1538

Query 1432  -------------------------------------------------  1431
                                                             
Sbjct 1539  GGTCTCGCGTCATGGGGCGGGGCCTCGGGGCGGAGCCACCCGGGCTGAC  1587