Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469068
• Subject: XM_011509671.1
• Aligned Length: 1545
• Identities: 1431
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCGCCTCCCCGTGGACTGGCCTTAAGTGTCCCTATCTATTCTCCCTACGACCAAAGCTCCTGCGGCCT  74

Query    1  ----------------------------------------ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCCTCTAGGGTTGTCACCCTAGCTGGACCTGGTTTCCGCATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  148

Query   35  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  222

Query  109  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  296

Query  183  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTGGTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGC  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTGGTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGC  370

Query  257  CTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACT  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACT  444

Query  331  GGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGAC  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGAC  518

Query  405  CAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGT  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGT  592

Query  479  CTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTT  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTT  666

Query  553  CCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCC  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCC  740

Query  627  ACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAG  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAG  814

Query  701  AGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGT  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGT  888

Query  775  GGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTAT  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTAT  962

Query  849  TAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTG  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTG  1036

Query  923  CCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGA  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGA  1110

Query  997  CATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGA  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGA  1184

Query 1071  CGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCT  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCT  1258

Query 1145  GTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATG  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATG  1332

Query 1219  CCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGA  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGA  1406

Query 1293  GTCAGCTAGGCAATTCCTGACTGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTG  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCAGCTAGGCAATTCCTGACTGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTG  1480

Query 1367  TTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC  1431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC  1545