Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469104
• Subject: XM_006502766.3
• Aligned Length: 909
• Identities: 753
• Gaps: 69

Alignment

Query   1  ------------------------------------------ATGAGCGAGTCATTTGACTGTGCAAAATGCAA  32
                                                     |||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGGCTTCTTGAGTTTGAGGGCTCACTGGGCACCGCCACCATGAGCGAGGCATTTGACTGTGCAAAATGCAA  74

Query  33  CGAGTCCCTGTATGGACGCAAGTACATCCAGACAGACAGCGGCCCCTACTGTGTGCCCTGCTATGACAATACCT  106
           |||||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  75  CGAGTCCTTGTACGGCCGCAAATACATCCAGACAGACAGTGGCCCCTACTGCGTTCCGTGCTATGACAACACCT  148

Query 107  TTGCCAACACCTGTGCTGAGTGCCAGCAGCTTATCGGGCATGACTCGAGGGAGCTGTTCTATGAAGACCGCCAT  180
           |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 149  TCGCCAACACCTGTGCTGAGTGCCAGCAGCTCATTGGGCATGATTCAAGGGAACTGTTCTATGAGGACCGCCAC  222

Query 181  TTCCACGAGGGCTGCTTCCGCTGCTGCCGCTGCCAGCGCTCACTAGCCGATGAACCCTTCACCTGCCAGGACAG  254
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 223  TTCCACGAGGGCTGCTTCCGCTGCTGCCGATGCCAGCGCTCCCTTGCCGATGAGCCCTTCACCTGTCAGGACAG  296

Query 255  TGAGCTGCTCTGCAATGACTGCTACTGCAGTGCGTTTTCCTCGCAGTGCTCCGCTTGTGGGGAGACTGTCATGC  328
           ||||||.||.||.|||||.||.|||||||..||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 297  TGAGCTTCTGTGTAATGAGTGTTACTGCACAGCCTTCTCGTCCCAGTGTTCTGCCTGCGGGGAGACTGTCATGC  370

Query 329  CTGGGTCCCGGAAGCTGGAATATGGAGGCCAGACATGGCATGAGCACTGCTTCCTGTGCAGTGGCTGTGAACAG  402
           |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 371  CTGGGTCCCGGAAGCTGGAGTATGGAGGCCAGACGTGGCATGAACACTGCTTTCTGTGCAGTGGCTGTGAGCAG  444

Query 403  CCACTGGGCTCCCGTTCTTTTGTGCCCGACAAGGGTGCTCACTACTGCGTGCCCTGCTATGAGAACAAGTTTGC  476
           ||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 445  CCGCTGGGCTCCCGCTCCTTCGTGCCTGACAAGGGTGCCCACTACTGCGTGCCTTGCTATGAGAACAAATTTGC  518

Query 477  TCCTCGCTGCGCCCGCTGCAGCAAGACGCTGACACAGGGTGGAGTGACATACCGTGATCAGCCGTGGCATCGAG  550
           ||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519  TCCTCGGTGTGCCCGCTGCAGCAAGACGCTGACCCAGGGTGGAGTGACATATCGTGATCAGCCCTGGCACCGAG  592

Query 551  AATGTCTGGTCTGTACCGGATGCCAGACGCCCCTGGCAGGGCAGCAGTTCACCTCCCGGGATGAAGATCCCTAC  624
           |.||.||||||||.||.||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 593  AGTGCCTGGTCTGCACTGGGTGCAAGACGCCCCTTGCAGGGCAGCAGTTCACATCTCGGGATGATGATCCTTAC  666

Query 625  TGTGTGGCCTGTTTTGGAGAACTCTTTGCACCTAAGTGCAGCAGCTGCAAGCGCCCCAT---------------  683
           |||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 667  TGTGTGGCCTGCTTTGGAGAACTCTTTGCACCCAAGTGCAGCAGCTGCAAGCGCCCCATCACAGGTGGGAGCGG  740

Query 684  ------------CGTAGGACTCGGTGGAGGCAAGTATGTGTCCTTTGAAGACCGACACTGGCACCACAACTGCT  745
                       ||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 741  CGGCGGCGAGGGCGCAGGACTCGGTGGAGGCAAGTATGTGTCCTTCGAAGACCGACATTGGCACCACAGCTGCT  814

Query 746  TCTCCTGCGCCCGCTGCTCTACCTCCCTGGTGGGCCAGGGCTTCGTACCGGATGGAGACCAAGTGCTCTGCCAG  819
           |.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 815  TTTCCTGTGCCCGCTGCTCCACCTCCCTGGTGGGCCAAGGCTTTGTACCAGACGGAGATCAAGTTCTATGCCAG  888

Query 820  GGCTGTAGCCAGGCAGGGCCC  840
           |||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 889  GGCTGCAGCCAAGCAGGCCCC  909