Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469111
• Subject: NM_001033124.1
• Aligned Length: 2410
• Identities: 2028
• Gaps: 53

Alignment

Query    1  ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTG  74
            ||||||||||||...||||.|||||||||.||||||||..||..|||.|||||||..|||||.|||.||.|||.
Sbjct    1  ATGCTGCGAGGCCAGCGGCTCGGGCAGCTGGGCTGGCATCGCCCGGCCGCGGGGCTAGGCAGTCTGATGACTTC  74

Query   75  GCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGAT  148
            |.||||.|||||.|.|||...|||||||.||||.|.|||.|.||||||.|||...|||.|||||||.|||||.|
Sbjct   75  GTTGATGCTGGCCTGTGCCTCCGCCGCATCCTGTCGCGAGGTCTGCTGTCCCGTGGGCCCCTCGGGGCTGCGCT  148

Query  149  GCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACATCGAG  222
            |||||.|||..|||.|||||||||.|||||.|..|||||..|||||.|.|||||||||.|||||||||.|.||.
Sbjct  149  GCACCAGGGCAGGGTCCCTGGATACCCTCCGCGGCCTGCGGGGCGCCGGGAACCTGACGGAGCTCTACGTGGAA  222

Query  223  AACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCATCGT  296
            |||||||||||.|||||.|...|||||.|....||.|||..|||||||||||||.||||||.|||.||||||||
Sbjct  223  AACCAGCAGCACCTGCAACGCTTGGAGTTTGAGGACCTGCAGGGCCTGGGGGAGTTGAGAAGCCTAACCATCGT  296

Query  297  GAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTCTCCT  370
            |||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  297  GAAGAGTGGCCTCCGCTTTGTGGCCCCAGATGCCTTCCGTTTCACCCCTCGGCTCAGTCACCTGAATCTGTCCT  370

Query  371  TCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGGGAAC  444
            .|||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||.||||||
Sbjct  371  CCAATGCGTTGGAGTCCCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCCTACAGGACCTGACCCTGTCAGGGAAC  444

Query  445  CCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTGAACA  518
            ||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.|.||.||||.|..|||
Sbjct  445  CCACTGCATTGTTCCTGTGCCCTGTTCTGGCTCCAGCGTTGGGAGCAGGAAGGGCTGTGTGGTGTGCATACACA  518

Query  519  GAAGCTGCAGTG--TCATGGGCAAGGGCCCCTGG------------CCCACATG---CCCAATGCCAGCTGTGG  575
            ||.|||.|| ||  || ||||        |||||            ||||| ||   |.|||..||||.|||||
Sbjct  519  GACGCTTCA-TGACTC-TGGG--------CCTGGAGACCAGTTCCTCCCAC-TGGGACACAACACCAGTTGTGG  581

Query  576  TGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGG  649
            |||.|||||..|||||.|||||.|||||||||.|||.|||||.|||||.||.||||||.|.||||.||||||||
Sbjct  582  TGTACCCACAGTGAAGATCCAGATGCCCAATGACTCTGTGGAAGTGGGCGATGACGTGTTTCTGCAGTGCCAGG  655

Query  650  TGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCT  723
            |||||||||.||.|||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||...|.|||||||.||||.|||||.|
Sbjct  656  TGGAGGGGCTGGCCCTACAGCAGGCTGACTGGATCCTCACAGAGCTGGAAGGGGCAGCCACCGTGAAGAAATTT  729

Query  724  GGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCTG  797
            ||.|.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  730  GGAGATCTGCCATCCCTGGGGCTGATTCTGGTCAATGTCACCAGTGATCTCAACAAGAAGAATGTGACGTGCTG  803

Query  798  GGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGC  871
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||.|||.
Sbjct  804  GGCAGAGAATGATGTGGGCCGGGCCGAGGTCTCTGTCCAAGTCAGCGTCTCCTTCCCAGCCAGTGTGCACCTGG  877

Query  872  ACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGG  945
            .|...|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  878  GCCTAGCGGTGGAGCAGCATCATTGGTGCATCCCCTTCTCGGTGGACGGGCAGCCAGCACCGTCTCTGCGCTGG  951

Query  946  CTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAG----CCAATG  1015
            .|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|.|| |    |.||||
Sbjct  952  TTGTTCAACGGCTCTGTGCTCAACGAGACCAGTTTCATCTTCACTCAGTTCTTGGAGTCTGC-GCTGACTAATG  1024

Query 1016  AGACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCT  1089
            |||||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1025  AGACCATGCGGCACGGCTGCCTGCGCCTCAATCAGCCCACGCATGTCAACAACGGGAACTACACCCTGCTGGCG  1098

Query 1090  GCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGA  1163
            ||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1099  GCCAACCCCTACGGCCAGGCTGCCGCCTCCGTCATGGCTGCTTTTATGGACAACCCTTTTGAGTTCAACCCTGA  1172

Query 1164  GGACCCCATCCCT------------------GACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACG  1219
            |||||||||||||                  |||..||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1173  GGACCCCATCCCTGTCTCCTTCTCGCCAGTGGACGGTAACAGCACATCAAGAGACCCAGTGGAGAAGAAAGATG  1246

Query 1220  AAACACCTTTTGGGGTCTCGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTT  1293
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||..|||||||||||||.|.||.||.|||
Sbjct 1247  AAACCCCTTTTGGGGTCTCTGTGGCTGTGGGCCTAGCCGTCTCTGCCGCCCTCTTCCTTTCTGCCCTCCTTCTT  1320

Query 1294  GTGCTCAACAAATGTGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCT  1367
            |||||||||||||||||||.|||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 1321  GTGCTCAACAAATGTGGACAGAGGAGCAAATTTGGGATCAACCGCCCTGCTGTATTAGCTCCAGAGGATGGGCT  1394

Query 1368  GGCCATGTCCCTGCATTTCATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCC  1441
            ||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1395  GGCCATGTCCCTACACTTCATGACACTGGGTGGCAGTTCTCTTTCCCCTACTGAGGGCAAAGGCTCCGGACTCC  1468

Query 1442  AAGGCCACATCATCGAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTG  1515
            |.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||.|||||||.|.
Sbjct 1469  AGGGCCACATCATGGAGAACCCACAGTACTTCAGTGATACCTGTGTCCATCACATCAAGCGCCAGGACATCATT  1542

Query 1516  CTCAAGTGGGAGCTGGGGGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCA  1589
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||..|||.||
Sbjct 1543  CTCAAGTGGGAGCTAGGGGAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTTCTCGCTGAGTGCTACAACCTTCTGAATGATCA  1616

Query 1590  GGACAAGATGCTGGTGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGG  1663
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1617  GGACAAGATGCTCGTGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCATCCGAGAATGCTCGGCAGGACTTTCAGCGTGAGG  1690

Query 1664  CTGAGCTGCTCACCATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTG  1737
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||..||
Sbjct 1691  CCGAGCTGCTCACCATGCTACAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTTGGAGTCTGCACCGAGGGTGGCCCGTTG  1764

Query 1738  CTCATGGTCTTTGAGTATATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCT  1811
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1765  CTCATGGTCTTTGAGTACATGCGCCACGGGGACCTCAACCGTTTCCTCCGGTCCCACGGACCTGATGCAAAGCT  1838

Query 1812  GCTGGCTGGTGGGGAGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCG  1885
            ||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1839  GCTGGCTGGTGGTGAGGATGTGGCTCCTGGTCCTCTGGGCCTTGGGCAGCTTCTGGCTGTGGCTAGCCAGGTGG  1912

Query 1886  CTGCGGGGATGGTGTACCTGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGC  1959
            ||||.||.|||||.||.||.||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1913  CTGCTGGTATGGTATATCTAGCCAGCCTGCACTTTGTGCACCGGGATCTGGCCACACGCAACTGTCTGGTGGGT  1986

Query 1960  CAGGGACTGGTGGTCAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGG  2033
            ||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1987  CAGGGACTAGTGGTGAAGATTGGAGACTTTGGCATGAGCAGAGACATCTATAGCACAGACTATTACCGAGTGGG  2060

Query 2034  AGGCCGCACCATGCTGCCCATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCG  2107
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 2061  AGGTCGGACCATGCTGCCCATCCGCTGGATGCCACCCGAGAGCATCCTCTACCGCAAGTTCAGCACCGAGAGCG  2134

Query 2108  ACGTGTGGAGCTTCGGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAAC  2181
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135  ATGTGTGGAGCTTTGGGGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAAC  2208

Query 2182  ACGGAGGCAATCGACTGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGC  2255
            ||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 2209  ACTGAGGCGATCGAGTGTATCACGCAGGGCCGGGAGCTGGAGCGGCCGCGCGCCTGCCCTCCTGATGTCTACGC  2282

Query 2256  CATCATGCGGGGCTGCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAG  2329
            |||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||.||||||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2283  CATCATGCGAGGCTGCTGGCAGCGAGAACCGCAGCAACGCCTCAGCATGAAGGATGTGCACGCGCGTCTGCAGG  2356

Query 2330  CCCTGGCCCAGGCACC-TCCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC  2370
            |||||||.|||||.|| .||.|| ||||||||.||.||||||
Sbjct 2357  CCCTGGCACAGGCGCCACCCAGT-TACCTGGACGTTCTGGGC  2397