Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469111
- Subject:
- XM_006501124.2
- Aligned Length:
- 2392
- Identities:
- 2028
- Gaps:
- 35
Alignment
Query 1 ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTG 74
||||||||||||...||||.|||||||||.||||||||..||..|||.|||||||..|||||.|||.||.|||.
Sbjct 1 ATGCTGCGAGGCCAGCGGCTCGGGCAGCTGGGCTGGCATCGCCCGGCCGCGGGGCTAGGCAGTCTGATGACTTC 74
Query 75 GCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGAT 148
|.||||.|||||.|.|||...|||||||.||||.|.|||.|.||||||.|||...|||.|||||||.|||||.|
Sbjct 75 GTTGATGCTGGCCTGTGCCTCCGCCGCATCCTGTCGCGAGGTCTGCTGTCCCGTGGGCCCCTCGGGGCTGCGCT 148
Query 149 GCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACATCGAG 222
|||||.|||..|||.|||||||||.|||||.|..|||||..|||||.|.|||||||||.|||||||||.|.||.
Sbjct 149 GCACCAGGGCAGGGTCCCTGGATACCCTCCGCGGCCTGCGGGGCGCCGGGAACCTGACGGAGCTCTACGTGGAA 222
Query 223 AACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCATCGT 296
|||||||||||.|||||.|...|||||.|....||.|||..|||||||||||||.||||||.|||.||||||||
Sbjct 223 AACCAGCAGCACCTGCAACGCTTGGAGTTTGAGGACCTGCAGGGCCTGGGGGAGTTGAGAAGCCTAACCATCGT 296
Query 297 GAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTCTCCT 370
|||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 297 GAAGAGTGGCCTCCGCTTTGTGGCCCCAGATGCCTTCCGTTTCACCCCTCGGCTCAGTCACCTGAATCTGTCCT 370
Query 371 TCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGGGAAC 444
.|||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||.||||||
Sbjct 371 CCAATGCGTTGGAGTCCCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCCTACAGGACCTGACCCTGTCAGGGAAC 444
Query 445 CCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTGAACA 518
||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.|.||.||||.|..|||
Sbjct 445 CCACTGCATTGTTCCTGTGCCCTGTTCTGGCTCCAGCGTTGGGAGCAGGAAGGGCTGTGTGGTGTGCATACACA 518
Query 519 GAAGCTGCAGTG--TCATGGGCAAGGGCCCCTGG------------CCCACATG---CCCAATGCCAGCTGTGG 575
||.|||.|| || || |||| ||||| ||||| || |.|||..||||.|||||
Sbjct 519 GACGCTTCA-TGACTC-TGGG--------CCTGGAGACCAGTTCCTCCCAC-TGGGACACAACACCAGTTGTGG 581
Query 576 TGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGG 649
|||.|||||..|||||.|||||.|||||||||.|||.|||||.|||||.||.||||||.|.||||.||||||||
Sbjct 582 TGTACCCACAGTGAAGATCCAGATGCCCAATGACTCTGTGGAAGTGGGCGATGACGTGTTTCTGCAGTGCCAGG 655
Query 650 TGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCT 723
|||||||||.||.|||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||...|.|||||||.||||.|||||.|
Sbjct 656 TGGAGGGGCTGGCCCTACAGCAGGCTGACTGGATCCTCACAGAGCTGGAAGGGGCAGCCACCGTGAAGAAATTT 729
Query 724 GGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCTG 797
||.|.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 730 GGAGATCTGCCATCCCTGGGGCTGATTCTGGTCAATGTCACCAGTGATCTCAACAAGAAGAATGTGACGTGCTG 803
Query 798 GGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGC 871
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||.|||.
Sbjct 804 GGCAGAGAATGATGTGGGCCGGGCCGAGGTCTCTGTCCAAGTCAGCGTCTCCTTCCCAGCCAGTGTGCACCTGG 877
Query 872 ACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGG 945
.|...|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 878 GCCTAGCGGTGGAGCAGCATCATTGGTGCATCCCCTTCTCGGTGGACGGGCAGCCAGCACCGTCTCTGCGCTGG 951
Query 946 CTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAG----CCAATG 1015
.|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|.|| | |.||||
Sbjct 952 TTGTTCAACGGCTCTGTGCTCAACGAGACCAGTTTCATCTTCACTCAGTTCTTGGAGTCTGC-GCTGACTAATG 1024
Query 1016 AGACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCT 1089
|||||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1025 AGACCATGCGGCACGGCTGCCTGCGCCTCAATCAGCCCACGCATGTCAACAACGGGAACTACACCCTGCTGGCG 1098
Query 1090 GCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGA 1163
||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1099 GCCAACCCCTACGGCCAGGCTGCCGCCTCCGTCATGGCTGCTTTTATGGACAACCCTTTTGAGTTCAACCCTGA 1172
Query 1164 GGACCCCATCCCTGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTCT 1237
||||||||||||||||..||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1173 GGACCCCATCCCTGACGGTAACAGCACATCAAGAGACCCAGTGGAGAAGAAAGATGAAACCCCTTTTGGGGTCT 1246
Query 1238 CGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGGA 1311
|.||||||||||||||.|||||||.||||..|||||||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 CTGTGGCTGTGGGCCTAGCCGTCTCTGCCGCCCTCTTCCTTTCTGCCCTCCTTCTTGTGCTCAACAAATGTGGA 1320
Query 1312 CGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTT 1385
|.|||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1321 CAGAGGAGCAAATTTGGGATCAACCGCCCTGCTGTATTAGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTACACTT 1394
Query 1386 CATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAGA 1459
|||||||.||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1395 CATGACACTGGGTGGCAGTTCTCTTTCCCCTACTGAGGGCAAAGGCTCCGGACTCCAGGGCCACATCATGGAGA 1468
Query 1460 ACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGGG 1533
|||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct 1469 ACCCACAGTACTTCAGTGATACCTGTGTCCATCACATCAAGCGCCAGGACATCATTCTCAAGTGGGAGCTAGGG 1542
Query 1534 GAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGC 1607
|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||..|||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1543 GAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTTCTCGCTGAGTGCTACAACCTTCTGAATGATCAGGACAAGATGCTCGTGGC 1616
Query 1608 TGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATGC 1681
|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1617 TGTCAAGGCACTGAAGGAGGCATCCGAGAATGCTCGGCAGGACTTTCAGCGTGAGGCCGAGCTGCTCACCATGC 1690
Query 1682 TGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTAT 1755
|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct 1691 TACAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTTGGAGTCTGCACCGAGGGTGGCCCGTTGCTCATGGTCTTTGAGTAC 1764
Query 1756 ATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGGA 1829
|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1765 ATGCGCCACGGGGACCTCAACCGTTTCCTCCGGTCCCACGGACCTGATGCAAAGCTGCTGGCTGGTGGTGAGGA 1838
Query 1830 TGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACC 1903
|||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1839 TGTGGCTCCTGGTCCTCTGGGCCTTGGGCAGCTTCTGGCTGTGGCTAGCCAGGTGGCTGCTGGTATGGTATATC 1912
Query 1904 TGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAAG 1977
|.||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1913 TAGCCAGCCTGCACTTTGTGCACCGGGATCTGGCCACACGCAACTGTCTGGTGGGTCAGGGACTAGTGGTGAAG 1986
Query 1978 ATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCC 2051
|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1987 ATTGGAGACTTTGGCATGAGCAGAGACATCTATAGCACAGACTATTACCGAGTGGGAGGTCGGACCATGCTGCC 2060
Query 2052 CATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGCG 2125
|||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 2061 CATCCGCTGGATGCCACCCGAGAGCATCCTCTACCGCAAGTTCAGCACCGAGAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGG 2134
Query 2126 TGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTGC 2199
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 2135 TGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACTGAGGCGATCGAGTGT 2208
Query 2200 ATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTG 2273
|||||||||||.||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2209 ATCACGCAGGGCCGGGAGCTGGAGCGGCCGCGCGCCTGCCCTCCTGATGTCTACGCCATCATGCGAGGCTGCTG 2282
Query 2274 GCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACC-T 2346
||||||.||.||.||||||||||.||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|| .
Sbjct 2283 GCAGCGAGAACCGCAGCAACGCCTCAGCATGAAGGATGTGCACGCGCGTCTGCAGGCCCTGGCACAGGCGCCAC 2356
Query 2347 CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC 2370
||.|| ||||||||.||.||||||
Sbjct 2357 CCAGT-TACCTGGACGTTCTGGGC 2379