Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469219
• Subject: NM_001312914.1
• Aligned Length: 2854
• Identities: 2209
• Gaps: 368

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATGAGGAAAACATGACGAAAAGCGAAGAGCAGCAACCTCTGAGTTTGCAAAAAGCCTTGCAGCAGTGCGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTTGGTTCAGAACATGATCGACCTGAGCATCTCCAATCTGGAAGGGCTTAGGACCAAGTGTGCAGCTTCCAACG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACCTCACGCAGAAGGAGATCAGGACCCTGGAGAGCAAGCTGGTGAAGTACTTCAGCCGACAGCTGTCCTGCAAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAGAAGGTGGCTCTGCAGGAACGCAATGCTGAACTGGACGGCTTCCCCCAGCTCCGCCACTGGTTCCGGATCGT  296

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGACGG  7
                                                                               |||||.|
Sbjct  297  GGATGTCCGAAAGGAAGTCCTGGAGGAGATCTCCCCTGACCAGCTGAGCTTGGAGGACCTCCTGGAGATGACCG  370

Query    8  ATGAACAGGTGTGCGAGACTGTGGAGAAATACGGAGCCAACCGGGAGGAGTGTGCCCGCCTCAACGCCTCCCTC  81
            |.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  371  ACGAGCAGGTGTGTGAGACCGTGGAGAAGTATGGAGCCAACCAGGAAGAGTGCGCCCGGCTCAACGCCTCACTC  444

Query   82  TCCTGCCTCAGGAATGTCCACATGTCAGGAGGCAACCTTTCCAAACAAGACTGGACCATCCAGTGGCCCACCAC  155
            |||||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCTGCCTCAGGAATGTGCACAAATCAGGAGGGAATCTCTCCAAACAAGATTGGATCATCCAGTGGCCCACCAC  518

Query  156  AGAGACGGGGAAGGAGAACAATCCCGTGTGCCCCCCGGAGCCCACCCCGTGGATCCGCACCCATCTCTCCCAGA  229
            .|||.|.|||.||||||.|||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  GGAGCCAGGGCAGGAGAGCAACCCTGTGTGCCCCCCGGAGCCCAGCCCGTGGATCCGAACCCACCTCTCCCAGA  592

Query  230  GCCCCAGGGTCCCGTCCAAGTGCGTCCAGCACTATTGTCACACCAGCCCCACTCCCGGGGCCCCTGTGTACACC  303
            ||||||||||||.|.|||||||...||||||||..||||..||||||||.||.||.|||.||||||||||||||
Sbjct  593  GCCCCAGGGTCCAGACCAAGTGTCCCCAGCACTTCTGTCCTACCAGCCCTACGCCTGGGACCCCTGTGTACACC  666

Query  304  CACGTGGACAGGCTTACCGTGGACGCCTACCCGGGCTTGTGCCCGCCCCCGCCA---CTGGAGTCGGGCCACCG  374
            ||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||..||||||||||||.||||||   |||||.||.||||||||
Sbjct  667  CAAGTGGACAGACTCACTGTAGATGCCTACCCGAACTTGTGCCCGCCGCCGCCACCCCTGGAATCAGGCCACCG  740

Query  375  TTCCCTGCCCCCATCGCCCCGGCAGCGGCACGCGGTCCGCACCCCGCCGCGCACCCCCAACATCGTCACCACCG  448
            .||.||||||||.||.||||||||||||||||..|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  741  CTCTCTGCCCCCGTCTCCCCGGCAGCGGCACGTAGTCCGCACCCCACCTCGCACCCCAAATATTGTCACCACCG  814

Query  449  TGACCCCGCCGGGCACGCCGCCCATGAGGAAGAAGAACAAGCTGAAGCCCCCGGGGACCCCACCGCCCTCCTCC  522
            |||||||.||.||||||||.||||||||||..||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct  815  TGACCCCACCTGGCACGCCACCCATGAGGAGAAAAAACAAGCTGAAGCCTCCCGGGACGCCACCCCCCTCCTCT  888

Query  523  CGAAAACTGATACACTTGATCCCGGGATTCACCGCGCTGCATCGGAGCAAATCCCACGAGTTCCAGCTGGGGCA  596
            ||.||.||.||.||..|||||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  889  CGGAAGCTCATCCATCTGATCCCTGGCTTCACAGCGCTGCACAGGAGCAAATCCCACGAGTTCCAGCTCGGGAA  962

Query  597  CCGCGTGGACGAGGCCCACACGCCCAAAGCCAAGAAG-AGAGCAAACCCTTGAACCTCAAGATCCACAGCAGCG  669
            |||.||.|||||||||.||||.||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  963  CCGTGTAGACGAGGCCAACACACCCAAAGCCAAGAAGAAGAGCAAACCCTTGAACCTCAAGATCCACAGCGGCG  1036

Query  670  TAGGCAGCTGCGAGAACATCCCCTCTCAGCAGCGCTTCCCGCTGCTGTCCGAGCGCTCCCTCCGCTCCTTCTTT  743
            |.|||||||||||||||||||||.|.|||||.||||..|||||.|||||||||||||||.|.||.|||||||||
Sbjct 1037  TGGGCAGCTGCGAGAACATCCCCGCCCAGCAACGCTCTCCGCTCCTGTCCGAGCGCTCCTTGCGGTCCTTCTTT  1110

Query  744  GTGGGACACGCACCTTTCCTGCCTTCCACCCCTCCTGTTCACACTGAGGCCAACTTCTCTGCAAACACACTGTC  817
            |||||.||||..||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  GTGGGCCACGGGCCCTTCCTGCCCTCCACCCCACCTGTCCACACTGAAGCCAATTTCTCTGCAAACACACTCTC  1184

Query  818  AGTGCCACGCTGGTCCCCGCAGATCCCTCGCAGAGATCTCGGCAACTCCATCAAGCACAGGTTTTCCACCAAGT  891
            .||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTACCTCGCTGGTCACCACAGATCCCACGCAGAGACCTTGGCAATTCCATCAAGCACAGGTTTTCCACCAAGT  1258

Query  892  ACTGGATGTCTCAGACGTGCACAGTCTGTGGGAAAGGGATGCTTTTTGGCCTCAAGTGTAAAAACTGCAAGTTA  965
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTGGATGTCTCAGACGTGCACGGTCTGCGGGAAAGGGATGCTTTTTGGCCTCAAGTGTAAAAACTGCAAGTTA  1332

Query  966  AAGTGCCACAACAAATGCACCAAAGAAGCCCCACCCTGTCATCTTCTGATCATCCACCGAGGAGATCCAGCAAG  1039
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  AAGTGCCACAATAAATGCACCAAAGAAGCCCCGCCCTGTCACCTCCTGATTATCCACCGAGGAGACCCAGCAAG  1406

Query 1040  GTTAGTCCGGACAGAGTCCGTTCCGTGTGACATCAACAACCCTCTACGGAAGCCACCTCGCTATTCAGACCTGC  1113
            ||||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||..|.||||||||..|.||.||||||||.||.|
Sbjct 1407  GTTAGTGCGAACGGAGTCGGTGCCCTGTGACATCAACAACCCGGTCCGGAAGCCTGCCCGATATTCAGATCTCC  1480

Query 1114  ACATCAGTCAGACGCTCCCCAAAACCAACAAAATCAACAAGGACCACATCCCTGTCCCTTACCAGCCAGACTCC  1187
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACATCAGTCAGACTCTCCCCAAAACCAACAAAATCAACAAGGACCACATCCCTGTCCCTTACCAGCCAGACTCC  1554

Query 1188  AGCAGCAACCCCTCCTCCACGACGTCCTCCACGCCCTCCTCGCCAGCACCCCCCCTCCCTCCTAGTGCCACGCC  1261
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1555  AGCAGCAATCCCTCCTCCACGACGTCCTCCACGCCCTCCTCACCGGCACCCCCCCTCCCTCCCAGCGCCACGCC  1628

Query 1262  GCCTTCTCCCCTACACCCTTCCCCACAGTGCACACGGCAGCAGAAGAACTTCAACCTGCCAGCATCCCACTACT  1335
            ||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|..|.|||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629  GCCTTCTCCCCTGCACCCCTCCCCGCAGTGCCCGAGACAGAAAAAGAACTTCAACCTGCCAGCTTCCCACTACT  1702

Query 1336  ACAAATACAAGCAGCAGTTCATCTTCCCAGATGTGGTGCCGGTGCCGGAGACGCCGACCCGGGCGCCCCAGGTC  1409
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1703  ACAAATACAAGCAACAGTTCATCTTCCCAGATGTGGTGCCTGTACCAGAGACACCCACCCGGGCACCCCAAGTC  1776

Query 1410  ATCCTGCATCCGGTGACCTCGAATCCAATCTTGGAAGGAAATCCATTACTTCAAATTGAAGTGGAGCCAACGTC  1483
            |||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1777  ATCCTGCATCCTGTCACCTCAAATACAATCTTGGAAGGAAACCCATTACTTCAAATTGAAGTGGAACCAACCTC  1850

Query 1484  GGAGAATGAAGAGGTCCATGATGAGGCCGAAGAGTCAGAGGATGACTTCGAGGAGATGAACCTGTCCCTCCTCT  1557
            .|||||.||||||..|||..||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1851  CGAGAACGAAGAGAGCCACAATGAAGCAGAGGAGTCCGAGGACGAGTTTGAAGAGATGAACCTATCCCTCCTCT  1924

Query 1558  CGGCCCGGAGCTTCCCACGCAAGGCCAGCCAGACCAGCATCTTCCTTCAGGAGTGGGACATCCCCTTTGAGCAG  1631
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1925  CAGCCCGGAGCTTCCCACGCAAAGCCAGCCAGACCAGCATCTTCCTTCAGGAGTGGGACATCCCGTTTGAACAG  1998

Query 1632  CTGGAGATCGGCGAGCTCATTGGAAAGGGCCGCTTTGGGCAAGTGTACCACGGCCGCTGGCATGGCGAGGTGGC  1705
            ||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1999  CTAGAGATTGGCGAGCTCATCGGGAAGGGTCGCTTCGGGCAGGTTTACCACGGACGCTGGCACGGCGAGGTGGC  2072

Query 1706  CATCCGGCTGATTGACATTGAGAGGGACAACGAGGACCAGCTCAAGGCCTTCAAGCGGGAGGTGATGGCCTACA  1779
            |||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2073  CATCCGGTTGATTGACATAGAGAGGGACAATGAGGACCAGCTTAAGGCCTTCAAGCGGGAAGTGATGGCCTACA  2146

Query 1780  GGCAGACACGGCATGAGAACGTGGTGCTTTTCATGGGTGCCTGCATGAGCCCGCCTCACCTGGCCCATCATCAC  1853
            |||||||..||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||.||| ||||||||||
Sbjct 2147  GGCAGACGAGGCACGAGAACGTGGTGCTCTTCATGGGAGCCTGCATGAGCCCACCCCACTTGG-CCATCATCAC  2219

Query 1854  CAGCCTCTGTAAGGGACGGACGCTCTATTCCGTTGTGAGGGATGCCAAAATCGTTTTGGATGTCAACAAAACCA  1927
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2220  CAGCCTCTGTAAGGGACGGACACTCTACTCTGTGGTGAGGGACGCCAAGATTGTCTTGGATGTCAACAAAACCA  2293

Query 1928  GGCAGATTGCTCAAGAAATTGTGAAGGGCATGGGCTACCTCCACGCCAAGGGAATCCTACACAAGGACCTCAAG  2001
            |||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct 2294  GGCAGATCGCGCAAGAGATTGTAAAGGGCATGGGCTACCTCCACGCCAAGGGGATCCTTCATAAGGACCTCAAA  2367

Query 2002  TCAAAGAACGTCTTCTATGACAACGGCAAAGTGGTCATCACGGACTTTGGACTCTTCAGCATTTCTGGGGTGCT  2075
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2368  TCGAAGAACGTCTTCTATGACAACGGCAAAGTGGTCATCACAGACTTTGGGCTCTTCAGCATTTCCGGGGTGCT  2441

Query 2076  GCAGGCTGGCAGGCGGGAGGACAAACTGCGCATCCAGAATGGCTGGCTATGCCACCTGGCACCAGAGATCATCC  2149
            ||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2442  GCAGGCTGGCCGGCGGGACGACAAACTGCGGATCCAGAACGGCTGGCTGTGTCACCTGGCCCCAGAAATCATCC  2515

Query 2150  GCCAGCTGTCCCCCGACACAGAGGAGGATAAGCTCCCCTTCTCCAAGCACTCTGACGTCTTTGCCCTTGGCACA  2223
            |||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 2516  GCCAGCTGTCCCCTGACACAGAAGAGGACAAGCTCCCATTCTCCAAGCACTCGGATGTCTTTGCGCTTGGCACC  2589

Query 2224  ATCTGGTATGAACTCCACGCCAGGGAATGGCCTTTCAAGACCCAACCAGCAGAGGCAATAATCTGGCAAATGGG  2297
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2590  ATCTGGTATGAGCTCCACGCCAGGGAGTGGCCATTCAAGACCCAACCAGCAGAGGCAATCATTTGGCAGATGGG  2663

Query 2298  CACAGGCATGAAACCCAACCTCAGCCAGATTGGCATGGGAAAAGAAATCTCGGACATTCTTCTCTTCTGCTGGG  2371
            |||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 2664  CACGGGAATGAAGCCCAACCTCAGCCAGATTGGCATGGGAAAAGAAATCTCGGACATACTGCTCTTCTGCTGGG  2737

Query 2372  CCTTTGAACAAGAAGAGAGACCTACCTTCACCAAGCTCATGGACATGCTGGAGAAACTGCCAAAGCGAAACCGT  2445
            ||||.||.||.||||||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2738  CCTTCGAGCAGGAAGAGCGGCCCACCTTTACCAAGCTCATGGACATGCTAGAGAAACTGCCAAAGCGAAACCGC  2811

Query 2446  CGCCTGTCTCACCCTGGACATTTCTGGAAGTCTGCAGAGCTG  2487
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812  CGCCTGTCGCACCCCGGACATTTCTGGAAGTCTGCAGAGCTG  2853