Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469293
• Subject: NR_136344.2
• Aligned Length: 1427
• Identities: 1155
• Gaps: 272

Alignment

Query    1  ----------------------------ATGGCGGCATTGAGCGGAGTCCGCTGGCTGACCCGAGCGCTGGTCT  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ACTTCCCACGCGACTTCCTGCGGGAAACATGGCGGCATTGAGCGGAGTCCGCTGGCTGACCCGAGCGCTGGTCT  74

Query   47  CCGCCGGGAACCCTGGGGCATGGAGAGGTCTGAGTACCTCGGCCGCGGCGCACGCTGCATCGCGGAGCCAGGCC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCCGGGAACCCTGGGGCATGGAGAGGTCTGAGTACCTCGGCCGCGGCGCACGCTGCATCGCGGAGCCAGGCC  148

Query  121  GAGGACGTGAGGGTGGAGGGCTCCTTTCCCGTGACCATGCTTCCGGGAGACGGTGTGGGGCCTGAGCTGATGCA  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGGACGTGAGGGTGGAGGGCTCCTTTCCCGTGACCATGCTTCCGGGAGACGGTGTGGGGCCTGAGCTGATGCA  222

Query  195  CGCCGTCAAGGAGGTGTTCAAGGCTGCCGCTGTCCCAGTGGAGTTCCAGGAGCACCACCTGAGTGAGGTGCAGA  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCGTCAAGGAGGTGTTCAAGGCTGCCGCTGTCCCAGTGGAGTTCCAGGAGCACCACCTGAGTGAGGTGCAGA  296

Query  269  ATATGGCATCTGAGGAGAAGCTGGAGCAGGTGCTGAGTTCCATGAAGGAGAACAAAGTGGCCATCATTGGAAAG  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATATGGCATCTGAGGAGAAGCTGGAGCAGGTGCTGAGTTCCATGAAGGAGAACAAAGTGGCCATCATTGGAAAG  370

Query  343  ATTCATACCCCGATGGAGTATAAGGGGGAGCTAGCCTCCTATGATATGCGGCTGAGGCGTAAGTTGGACTTATT  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCATACCCCGATGGAGTATAAGGGGGAGCTAGCCTCCTATGATATGCGGCTGAGGCGTAAGTTGGACTTATT  444

Query  417  TGCCAACGTAGTCCATGTGAAGTCACTTCCTGGGTATATGACTCGGCACAACAATCTAGACCTGGTGATCATTC  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCAACGTAGTCCATGTGAAGTCACTTCCTGGGTATATGACTCGGCACAACAATCTAGACCTGGTGATCATTC  518

Query  491  GAGAGCAGACAGAAGGGGAGTACAGCTCTCTGGAACATGAGAGTGCAAGGGGTGTGATTGAGTGTTTGAAGATT  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGAGCAGACAGAAGGGGAGTACAGCTCTCTGGAACATGAGAGTGCAAGGGGTGTGATTGAGTGTTTGAAGATT  592

Query  565  GTCACACGAGCCAAGTCTCAGCGGATTGCAAAGTTCGCCTTTGACTATGCCACCAAGAAGGGGCGGGGCAAGGT  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCACACGAGCCAAGTCTCAGCGGATTGCAAAGTTCGCCTTTGACTATGCCACCAAGAAGGGGCGGGGCAAGGT  666

Query  639  CACTGCTGTCCACAAGGCCAACATCATGAAACTTGGGGATGGGTTGTTCCTGCAGTGCTGTGAGGAAGTTGCTG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACTGCTGTCCACAAGGCCAACATCATGAAACTTGGGGATGGGTTGTTCCTGCAGTGCTGTGAGGAAGTTGCTG  740

Query  713  AACTGTACCCCAAAATCAAATTTGAGACAATGATCATAGACAACTGCTGCATGCAGCTGGTGCAGAATCCTTAC  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACTGTACCCCAAAATCAAATTTGAGACAATGATCATAGACAACTGCTGCATGCAGCTGGTGCAGAATCCTTAC  814

Query  787  CAGTTTGATGTGCTTGTGATGCCCAATCTCTATGGGAACATTATTGACAATCTGGCTGCTGGCCTGGTTGGGGG  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGTTTGATGTGCTTGTGATGCCCAATCTCTATGGGAACATTATTGACAATCTGGCTGCTGGCCTGGTTGGGGG  888

Query  861  AGCTGGTGTGGTCCCTGGTGAGAGCTATAGTGCAGAATACGCAGTCTTTGAGACGGGTGCCCGGCACCCATTTG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCTGGTGTGGTCCCTGGTGAGAGCTATAGTGCAGAATACGCAGTCTTTGAGACGGGTGCCCGGCACCCATTTG  962

Query  935  CCCAGGCAGTGGGCAGGAATATAGCCAATCCCACGGCCATGCTGCTGTCGGCTTCCAACATGCTGCGGCATCTT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCAGGCAGTGGGCAGGAATATAGCCAATCCCACGGCCATGCTGCTGTCGGCTTCCAACATGCTGCGGCATCTT  1036

Query 1009  AATCTTGAGTATCACTCCAGCATGATCGCAGATGCGGTGAAGAAGGTGATCAAAGTTGGCAAGGTGCGGACTCG  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATCTTGAGTATCACTCCAGCATGATCGCAGATGCGGTGAAGAAGGTGATCAAAGTTGGCAAGGTGCGGACTCG  1110

Query 1083  AGACATGGGCGGCTACAGCACCACAACCGACTTCATCAAGTCTGTCATCGGTCACCTGCAGACTAAAGGGAGC-  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1111  AGACATGGGCGGCTACAGCACCACAACCGACTTCATCAAGTCTGTCATCGGTCACCTGCAGACTAAAGGGAGCT  1184

Query 1156  --------------------------------------------------------------------------  1155
                                                                                      
Sbjct 1185  AGAGCCCTTTATTTCTTCCAACCTTGCAAGGACCACACTCCCCATACCCTTCAGTGCAGTGTACCAGGGAAGAG  1258

Query 1156  --------------------------------------------------------------------------  1155
                                                                                      
Sbjct 1259  ACCTTGTGCCTCTAAGCAGTGGACCATGGTCACCTTGCTGGGTTCGAACCTCTGACATGGGTGGCTATGCTACT  1332

Query 1156  --------------------------------------------------------------------------  1155
                                                                                      
Sbjct 1333  TGCCATGACTTCACTGAGGCTGTCATTGCTGCCTTGCCCCACCCATAGGCCCTGTCCATACCCATGTAAGGTGT  1406

Query 1156  ---------------------  1155
                                 
Sbjct 1407  TCAATAAAGAACATGAACCAA  1427