Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469293
• Subject: XM_006498824.3
• Aligned Length: 1168
• Identities: 1004
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGGCGGCATTGAGCGGAGTCCGCTGGCTGACCCGAGCGCTGGTCTCCGCCGGGAACCCTGGGGCATGGAGAGG  74
            |||||.||..|||||...|||||||||||||||||||||.||.||.||||..|||||.|.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGCTGAGCAATGTCCGCTGGCTGACCCGAGCGGTGCTCGCCGCTCGGAACTCCGGGGCATGGAGAGG  74

Query   75  TCTGAGTACCTCGGCCGCGGCGCACGCTGCATCGCGGAGCCAGGCCGAGGACGTGAGGGTGGAGGGCTCCTTTC  148
            |||..|.||.|   |..||||.|||||.||.||.|.|||||||||..|.||.||||||||||||||..||||||
Sbjct   75  TCTCGGAACAT---CTACGGCTCACGCCGCTTCCCAGAGCCAGGCACAAGATGTGAGGGTGGAGGGTGCCTTTC  145

Query  149  CCGTGACCATGCTTCCGGGAGACGGTGTGGGGCCTGAGCTGATGCACGCCGTCAAGGAGGTGTTCAAGGCTGCC  222
            |.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  146  CTGTGACCATGCTGCCTGGAGACGGCGTGGGGCCAGAGCTCATGCATGCTGTCAAGGAAGTGTTCAAGGCTGCT  219

Query  223  GCTGTCCCAGTGGAGTTCCAGGAGCACCACCTGAGTGAGGTGCAGAATATGGCATCTGAGGAGAAGCTGGAGCA  296
            ||||||||.|||||.||..|||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GCTGTCCCTGTGGAATTTAAGGAGCATCATCTGAGCGAGGTGCAGAATATGGCTTCTGAGGAGAAGCTGGAGCA  293

Query  297  GGTGCTGAGTTCCATGAAGGAGAACAAAGTGGCCATCATTGGAAAGATTCATACCCCGATGGAGTATAAGGGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  294  GGTGCTGAGTTCCATGAAGGAGAACAAAGTTGCCATCATTGGAAAGATCTATACCCCAATGGAGTATAAGGGTG  367

Query  371  AGCTAGCCTCCTATGATATGCGGCTGAGGCGTAAGTTGGACTTATTTGCCAACGTAGTCCATGTGAAGTCACTT  444
            |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  368  AACTAGCCTCCTATGATATGCAGCTGAGGCGTAAGTTGGATTTGTTTGCCAACGTAGTCCACGTGAAGTCACTT  441

Query  445  CCTGGGTATATGACTCGGCACAACAATCTAGACCTGGTGATCATTCGAGAGCAGACAGAAGGGGAGTACAGCTC  518
            |||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  442  CCTGGATACAAGACTCGGCACAACAATCTAGACCTGGTTATCATTCGAGAGCAGACAGAAGGGGAGTATAGCTC  515

Query  519  TCTGGAACATGAGAGTGCAAGGGGTGTGATTGAGTGTTTGAAGATTGTCACACGAGCCAAGTCTCAGCGGATTG  592
            |||||||||||||||.||.|.||||||.||||||||..|||||||.|||||.||..|||||||||||.||||||
Sbjct  516  TCTGGAACATGAGAGCGCCAAGGGTGTCATTGAGTGCCTGAAGATCGTCACTCGCACCAAGTCTCAGAGGATTG  589

Query  593  CAAAGTTCGCCTTTGACTATGCCACCAAGAAGGGGCGGGGCAAGGTCACTGCTGTCCACAAGGCCAACATCATG  666
            |||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  590  CAAAGTTTGCGTTCGACTATGCCACCAAGAAAGGGCGGAGCAAGGTCACAGCCGTCCATAAAGCCAACATCATG  663

Query  667  AAACTTGGGGATGGGTTGTTCCTGCAGTGCTGTGAGGAAGTTGCTGAACTGTACCCCAAAATCAAATTTGAGAC  740
            |||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  664  AAACTAGGGGATGGCTTGTTCTTGCAGTGCTGTGAGGAAGTTGCTGAACTGTACCCTAAAATCAAGTTTGAAAC  737

Query  741  AATGATCATAGACAACTGCTGCATGCAGCTGGTGCAGAATCCTTACCAGTTTGATGTGCTTGTGATGCCCAATC  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  738  CATGATCATAGACAACTGCTGCATGCAGCTGGTGCAGAACCCTTACCAGTTTGATGTGCTCGTGATGCCCAATC  811

Query  815  TCTATGGGAACATTATTGACAATCTGGCTGCTGGCCTGGTTGGGGGAGCTGGTGTGGTCCCTGGTGAGAGCTAT  888
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct  812  TCTATGGCAACATAATTGACAATCTGGCTGCTGGCCTTGTTGGGGGAGCTGGCGTGGTTCCTGGGGAGAGCTAC  885

Query  889  AGTGCAGAATACGCAGTCTTTGAGACGGGTGCCCGGCACCCATTTGCCCAGGCAGTGGGCAGGAATATAGCCAA  962
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AGTGCAGAGTATGCAGTTTTTGAGACGGGTGCTCGGCACCCATTTGCCCAGGCAGTGGGCAGGAATATAGCCAA  959

Query  963  TCCCACGGCCATGCTGCTGTCGGCTTCCAACATGCTGCGGCATCTTAATCTTGAGTATCACTCCAGCATGATCG  1036
            .|||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  960  CCCCACAGCCATGCTGCTGTCGGCCACCAACATGCTGCGGCATCTCAATCTTGAGTATCACTCCAGCATGATTG  1033

Query 1037  CAGATGCGGTGAAGAAGGTGATCAAAGTTGGCAAGGTGCGGA-CTCGAGACATGGGCGGCTACAGCAC----CA  1105
            |||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||.||.| ||| |||.|||||.||.||...|||    ||
Sbjct 1034  CAGATGCAGTGAAGAAAGTGATCAAAGCTGGCAAGGTTCGAACCTC-AGATATGGGTGGTTATGCCACATGTCA  1106

Query 1106  CAACCGACTTCA-TCAAGTCTGTCAT-------CGGTCACCTGCAGACTAAAGGGAGC  1155
                .||||||| |.||| |||||||       |.||||                   
Sbjct 1107  ----TGACTTCACTGAAG-CTGTCATTACTGCCCTGTCA-------------------  1140