Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469293
• Subject: XR_001754267.1
• Aligned Length: 1235
• Identities: 1093
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ----------------------------ATGGCGGCATTGAGCGGAGTCCGCTGGCTGACCCGAGCGCTGGTCT  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ACTTCCCACGCGACTTCCTGCGGGAAACATGGCGGCATTGAGCGGAGTCCGCTGGCTGACCCGAGCGCTGGTCT  74

Query   47  CCGCCGGGAACCCTGGGGCATGGAGAGGTCTGAGTACCTCGGCCGCGGCGCACGCTGCATCGCGGAGCCAGGCC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCCGGGAACCCTGGGGCATGGAGAGGTCTGAGTACCTCGGCCGCGGCGCACGCTGCATCGCGGAGCCAGGCC  148

Query  121  GAGGACGTGAGGGTGGAGGGCTCCTTTCCCGTGACCATGCTTCCGGGAGACGGTGTGGGGCCTGAGCTGATGCA  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGGACGTGAGGGTGGAGGGCTCCTTTCCCGTGACCATGCTTCCGGGAGACGGTGTGGGGCCTGAGCTGATGCA  222

Query  195  CGCCGTCAAGGAGGTGTTCAAGGCTGCCGCTGTCCCAGTGGAGTTCCAGGAGCACCACCTGAGTGAGGTGCAGA  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCGTCAAGGAGGTGTTCAAGGCTGCCGCTGTCCCAGTGGAGTTCCAGGAGCACCACCTGAGTGAGGTGCAGA  296

Query  269  ATATGGCATCTGAGGAGAAGCTGGAGCAGGTGCTGAGTTCCATGAAGGAGAACAAAGTGGCCATCATTGGAAAG  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATATGGCATCTGAGGAGAAGCTGGAGCAGGTGCTGAGTTCCATGAAGGAGAACAAAGTGGCCATCATTGGAAAG  370

Query  343  ATTCATACCCCGATGGAGTATAAGGGGGAGCTAGCCTCCTATGATATGCGGCTGAGGCGTAAGTTGGACTTATT  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCATACCCCGATGGAGTATAAGGGGGAGCTAGCCTCCTATGATATGCGGCTGAGGCGTAAGTTGGACTTATT  444

Query  417  TGCCAACGTAGTCCATGTGAAGTCACTTCCTGGGTATATGACTCGGCACAACAATCTAGACCTGGTGATCATTC  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCAACGTAGTCCATGTGAAGTCACTTCCTGGGTATATGACTCGGCACAACAATCTAGACCTGGTGATCATTC  518

Query  491  GAGAGCAGACAGAAGGGGAGTACAGCTCTCTGGAACATGAGAGTGCAAGGGGTGTGATTGAGTGTTTGAAGATT  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGAGCAGACAGAAGGGGAGTACAGCTCTCTGGAACATGAGAGTGCAAGGGGTGTGATTGAGTGTTTGAAGATT  592

Query  565  GTCACACGAGCCAAGTCTCAGCGGATTGCAAAGTTCGCCTTTGACTATGCCACCAAGAAGGGGCGGGGCAAGGT  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCACACGAGCCAAGTCTCAGCGGATTGCAAAGTTCGCCTTTGACTATGCCACCAAGAAGGGGCGGGGCAAGGT  666

Query  639  CACTGCTGTCCACAAGGCCAACATCATGAAACTTGGGGATGGGTTGTTCCTGCAGTGCTGTGAGGAAGTTGCTG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACTGCTGTCCACAAGGCCAACATCATGAAACTTGGGGATGGGTTGTTCCTGCAGTGCTGTGAGGAAGTTGCTG  740

Query  713  AACTGTACCCCAAAATCAAATTTGAGACAATGATCATAGACAACTGCTGCATGCAGCTGGTGCAGAATCCTTAC  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACTGTACCCCAAAATCAAATTTGAGACAATGATCATAGACAACTGCTGCATGCAGCTGGTGCAGAATCCTTAC  814

Query  787  CAGTTTGATGTGCTTGTGATGCCCAATCTCTATGGGAACATTATTGACAATCTGGCTGCTGGCCTGGTTGGGGG  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGTTTGATGTGCTTGTGATGCCCAATCTCTATGGGAACATTATTGACAATCTGGCTGCTGGCCTGGTTGGGGG  888

Query  861  AGCTGGTGTGGTCCCTGGTGAGAGCTATAGTGCAGAATACGCAGTCTTTGAGACGGGTGCCCGGCACCCATTTG  934
            ||||||||||||||||                                      ||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCTGGTGTGGTCCCT--------------------------------------GGGTGCCCGGCACCCATTTG  924

Query  935  CCCAGGCAGTGGGCAGGAATATAGCCAATCCCACGGCCATGCTGCTGTCGGCTTCCAACATGCTGCGGCATCTT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  CCCAGGCAGTGGGCAGGAATATAGCCAATCCCACGGCCATGCTGCTGTCGGCTTCCAACATGCTGCGGCATCTT  998

Query 1009  AATCTTGAGTATCACTCCAGCATGATCGCAGATGCGGTGAAGAAGGTGATCAAAGTTGGCAAGGTGCGGA-CTC  1081
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.| |||
Sbjct  999  AATCTTGAGTATCACTCCAGCATGATCGCAGATGCGGTGAAGAAGGTGATCAAAGTTGGCAAGGTTCGAACCTC  1072

Query 1082  GAGACATGGGCGGCTACAGC-----ACCACAACCGACTTCATCAAGTCTGTCATCGGT---------CACC---  1138
             .||||||||.||||| .||     .|||    .|||||||...||.|||||||.|.|         ||||   
Sbjct 1073  -TGACATGGGTGGCTA-TGCTACTTGCCA----TGACTTCACTGAGGCTGTCATTGCTGCCTTGCCCCACCCAT  1140

Query 1139  --------TGCAGAC-----------------TAAAGGGAGC---------  1155
                    |.||.||                 ||||  ||.|         
Sbjct 1141  AGGCCCTGTCCATACCCATGTAAGGTGTTCAATAAA--GAACATGAACCAA  1189