Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469306
• Subject: XM_011532176.2
• Aligned Length: 2271
• Identities: 2199
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT  74

Query   75  CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG  148

Query  149  TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA  222

Query  223  TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATATCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTTTGGTCGGTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATATCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTTTGGTCGGTTC  296

Query  297  TGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATCGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATCGG  370

Query  371  TTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGAAT  444

Query  445  TATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATGCTTTCAGAGGACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATGCTTTCAGAGGACT  518

Query  519  GAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATCTTC  592

Query  593  ACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGGACTAAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGGACTAAAT  666

Query  667  TCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAACACATGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAACACATGCC  740

Query  741  AAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCAGTA  814
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  741  AAGACTACATTGGC------------------------------------------------------------  754

Query  815  ATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAGAAA  888
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  ------------TAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAGAAA  816

Query  889  CTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGAAGGAGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  CTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGAAGGAGCT  890

Query  963  GTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAACTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  GTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAACTCA  964

Query 1037  AGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAATCTCTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  AGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAATCTCTCT  1038

Query 1111  CACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACACTGATGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  CACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACACTGATGG  1112

Query 1185  AATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTACCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  AATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTACCT  1186

Query 1259  GCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCATGTCAATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  GCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCATGTCAATC  1260

Query 1333  ATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTTTCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  ATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTTTCG  1334

Query 1407  TGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTGGCCATTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335  TGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTGGCCATTC  1408

Query 1481  TGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCTTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409  TGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCTTTT  1482

Query 1555  AGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTATAGTGGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483  AGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTATAGTGGC  1556

Query 1629  TTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTTCATT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557  TTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTTCATT  1630

Query 1703  CAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGCCGCATTT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1631  CAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGCCGCATTT  1704

Query 1777  ATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAATACG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705  ATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAATACG  1778

Query 1851  GAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTATGCTGGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1779  GAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTATGCTGGA  1852

Query 1925  TACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTGGGTAGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853  TACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTGGGTAGTG  1926

Query 1999  ATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTAAAGAAAT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1927  ATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTAAAGAAAT  2000

Query 2073  GATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATATGCTCCAT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2001  GATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATATGCTCCAT  2074

Query 2147  CATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTTCACATAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2075  CATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTTCACATAC  2148

Query 2221  CCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA  2271
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149  CCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA  2199