Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469355
• Subject: NM_053105.2
• Aligned Length: 2253
• Identities: 2007
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGTCAGGCTCTGGGCGAAAAGACTTCGATGTGAAGCACATTCTGCGACTCCGCTGGAAACTCTTCAGCCACCC  74
            |||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGTCCGGCTCCGGGAGAAAAGACTTCGATGTGAAGCACATCCTGCGACTCCGCTGGAAACTCTTCAGCCATCC  74

Query   75  GTCTCCTTCCACCGGCGGCCCGGCGGGGGGAGGCTGCCTGCAACAGGA---CGGCAGTGGCAGCTTTGAGCACT  145
            .||.||..||.||.|..||||.||||||||..||||||||||||||||   |||..|.||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCGCCGGCCTCCAGTAGCCCAGCGGGGGGCAGCTGCCTGCAACAGGACAGCGGAGGAGGCAGCTTTGAGCACT  148

Query  146  GGGGACCCAGCCAGAGTCGCCTGCTCAAAAGCCAAGAGAGAAGCGGTGTGAGCACTTTCTGGAAGAAGC---CT  216
            ||||.||.|||||||||||.||||||||||.|||.||.|...||.||||||||.||||||||||.||||   ||
Sbjct  149  GGGGTCCTAGCCAGAGTCGGCTGCTCAAAAACCAGGAAAAGGGCAGTGTGAGCGCTTTCTGGAAAAAGCCTTCT  222

Query  217  TCCTCCTCTTCCTCTTCATCGTCCTCCCCGTCCT---CTTCCTCCTCTTCCTTCAATCCGCTGAATGGCACCCT  287
            ||||||||||||||.||.||.||||||.||||.|   ||||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct  223  TCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCGTCTTCTGCTTCATCTTCTCCTTTCAATCCGCTGAATGGCACCTT  296

Query  288  GCTTCCAGTTGCCACGAGGCTGCAGCAAGGGGCTCCTGGGCAGGGCACTCAGCAGCCAGCCAGGACTCTCTTCT  361
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  ACTACCAGTTGCCACGAGGCTGCAGCAAGGGGCTCCCGGGCAGGGCACCCAGCAGCCCGCCAGGACTCTTTTCT  370

Query  362  ACGTGGAGTCACTAGAGGAGGAGGTGGTGCCAGGCATGGACTTTCCTGGACCACACGAAAAAGGGCTGGTTCTG  435
            ||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||.|.||.|||||..|||..|||
Sbjct  371  ACGTGGAGTCCCTAGAGGAGGAGGTAGTGACAGGCATGGACTTTTCTGGACCAGAGGACAAAGGATTGGCCCTG  444

Query  436  CAAGAGCTCAAAGTGGAGCCAGACAACTCTAGCCAGGCAACAGGTGAAGGATGTGGACACAGGCTGTCATCAAC  509
            .||||||||.|||.||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||
Sbjct  445  AAAGAGCTCCAAGCGGAGCCTGCCAGCTCTATCCAGGCAACAGGTGAAGGATGTGGACACAGGTTGACATCGAC  518

Query  510  CGGCCATTCAATGACACCTCAAAGTGATTTGGACTCCAGTAGCTCTGAAGAATTCTATCAAGCTGTTCATCATG  583
            |...||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  CAATCATTCACTGACACCTCAAAGTGATTTGGATTCCAGCAGCTCCGAAGAATTCTATCAAGCTGTTCACCATG  592

Query  584  CTGAGCAAACCTTCAGAAAGATGGAAAGTTATTTGAAGCAGCAGCAACTTTGTGATGTTATCCTGATTGTTGGG  657
            ||||||||.|.||.|||||||||||.|.||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  593  CTGAGCAATCATTTAGAAAGATGGAGAATTATTTAAAGCAACAGCAGCTCTGTGATGTCATCCTGATAGTTGGA  666

Query  658  AACCGAAAGATACCTGCACATAGGCTTGTTCTGAGTTCAGTCTCCGACTATTTTGCGGCCATGTTTACAAGTGA  731
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  AATCGAAAGATACCTGCTCATAGGCTTGTTCTGAGTTCTGTCTCTGACTATTTTGCTGCCATGTTTACAAGTGA  740

Query  732  TGTTTGTGAAGCCAAGCAAGAGGAGATCAAAATGGAAGGCATAGACCCCAATGCTCTCTGGGACCTTGTCCAAT  805
            |||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  TGTCTGTGAAGCCAAGCAAGAGGAGATCAAGATGGAAGGCATAGACCCAAATGCACTCTGGGATCTTGTTCAAT  814

Query  806  TTGCATATACAGGCTGCTTGGAATTAAAAGAGGACACCATTGAGAACCTTCTTGCTGCAGCGTGCCTTCTTCAG  879
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct  815  TTGCATATACAGGTTGCTTGGAATTAAAAGAAGACACTATTGAAAACCTTCTTGCAGCTGCTTGCCTTCTCCAG  888

Query  880  CTTCCACAGGTGGTGGAAGTGTGCTGCCACTTCCTCATGAAGCTTTTGCATCCATCTAACTGTTTAGGAATTCG  953
            ||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||..|
Sbjct  889  CTCCCTCAAGTGGTCGAAGTGTGTTGTCACTTCCTCATGAAACTTCTGCATCCATCCAACTGTTTAGGAATAAG  962

Query  954  AGCCTTCGCAGATGCTCAAGGATGCATTGAGTTAATGAAGGTGGCCCACAGCTACACAATGGAAAACATAATGG  1027
            .||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCATTTGCTGATGCTCAAGGATGCATTGAATTAATGAAGGTGGCACACAGCTACACCATGGAAAACATAATGG  1036

Query 1028  AAGTTATCAGAAATCAAGAGTTTTTACTCCTTCCAGCTGAGGAGCTCCATAAACTACTGGCCAGTGATGATGTC  1101
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  AAGTAATCAGAAATCAAGAGTTTTTACTCCTTCCAGCTGAAGAGCTCCATAAACTACTGGCCAGTGATGATGTA  1110

Query 1102  AATGTTCCTGATGAAGAAACCATCTTCCATGCATTGATGATGTGGGTCAAGTATGACATGCAGAGTAGGTGCAA  1175
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.|.
Sbjct 1111  AATGTTCCTGATGAAGAGACCATTTTCCATGCACTGATGATGTGGGTCAAGTATGACATGCAGCGGAGATGTAG  1184

Query 1176  TGACCTGAGCATGCTTCTTGCCTTTATAAGACTGCCACTGCTTCCGCCACAGATATTGGCTGACCTAGAAAATC  1249
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||.|
Sbjct 1185  TGACCTGAGTATGCTCCTTGCCTTCATAAGATTACCACTGCTTCCACCACAGATACTGGCTGACCTTGAAAACC  1258

Query 1250  ATGCATTATTTAAGAATGATGTGGAATGTCAAAAGCTGATTCTAGAAGCAATGAAATACCATCTATTGCCAGAA  1323
            |||||.||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1259  ATGCACTATTCAAGAATGATTTGGAATGTCAAAAACTGATTCTGGAAGCAATGAAATATCATCTATTGCCCGAA  1332

Query 1324  AGAAGAACTTTAATGCAAAGTCCGAGAACTAAACCCAGAAAATCTACAGTCGGAACTTTGTATGCTGTAGGAGG  1397
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||.||.||
Sbjct 1333  AGAAGAACTTTAATGCAAAGTCCAAGAACTAAGCCCAGAAAATCTACAGTTGGAACTCTTTATGCAGTGGGGGG  1406

Query 1398  AATGGATAACAACAAAGGAGCTACAACTATAGAGAAATATGATCTGAGAACAAATCTGTGGATCCAGGCAGGGA  1471
            |||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1407  AATGGATAATAACAAAGGGGCTACAACCATAGAGAAGTATGACCTCCGAACAAATCTGTGGATTCAGGCTGGAA  1480

Query 1472  TGATGAATGGCAGAAGGCTGCAGTTTGGTGTGGCTGTTATTGATGACAAACTCTTTGTAATTGGAGGTCGAGAT  1545
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGATGAATGGCAGAAGGCTTCAGTTCGGTGTGGCTGTCATTGATGACAAGCTCTTTGTAATTGGAGGTCGAGAT  1554

Query 1546  GGCTTAAAGACATTGAACACTGTTGAATGTTACAATCCCAAAACCAAGACATGGACTGTCTTACCACCAATGTC  1619
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1555  GGCTTAAAGACTTTGAACACTGTTGAATGTTACAATCCCAAAACCAAGACATGGACTGTTTTGCCACCAATGTC  1628

Query 1620  AACACACAGACATGGTCTAGGTGTAACAGTACTTGAAGGCCCTATTTATGCTGTGGGAGGCCATGATGGCTGGA  1693
            ||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  AACACATAGGCATGGTCTAGGAGTAACTGTACTGGAAGGGCCTATCTATGCAGTGGGAGGCCATGACGGCTGGA  1702

Query 1694  GCTATCTGAATACAGTGGAAAGGTGGGATCCACAGAGTCAACAATGGACATTTGTAGCCAGTATGTCAATTGCT  1767
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  GCTATCTGAACACAGTGGAAAGGTGGGATCCCCAGAGCCAGCAGTGGACATATGTAGCCAGTATGTCCATTGCT  1776

Query 1768  CGGAGCACAGTTGGTGTAGCAGCATTGAATGGCAAGTTGTATTCAGTTGGAGGTCGTGATGGAAGTTCCTGTTT  1841
            ||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1777  CGGAGCACGGTTGGAGTAGCAGCACTGAATGGAAAGTTGTACTCCGTTGGGGGTCGAGATGGAAGTTCCTGTCT  1850

Query 1842  GAGTTCAATGGAATATTATGATCCTCATACAAATAAGTGGAACATGTGTGCTCCCATGTGTAAGAGGAGAGGGG  1915
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAGTTCAATGGAATACTATGATCCTCATACAAATAAGTGGAGCATGTGCGCACCGATGTGTAAGAGGAGAGGGG  1924

Query 1916  GTGTCGGAGTGGCCACATGTGACGGTTTTCTTTATGCAGTAGGAGGTCATGATGCTCCTGCTTCAAATCACTGT  1989
            ||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1925  GTGTTGGAGTGGCCACCTGTGATGGTTTCCTGTATGCAGTGGGTGGCCATGATGCTCCTGCTTCAAACCACTGT  1998

Query 1990  TCCCGGCTACTGGATTATGTAGAAAGATATGATCCCAAAACAGACACTTGGACCATGGTGGCTCCTTTGAGTAT  2063
            |||.||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCCAGGCTCCTGGACTACGTGGAAAGGTATGATCCAAAAACAGATACATGGACCATGGTGGCTCCTTTGAGTAT  2072

Query 2064  GCCCAGAGATGCTGTTGGGGTCTGTCTCCTTGGTGACAGATTATATGCTGTTGGTGGCTATGATGGACAGACAT  2137
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 2073  GCCTAGAGATGCTGTTGGTGTCTGTCTCCTTGGTGACAGGCTATATGCTGTTGGGGGCTATGATGGGCAGACTT  2146

Query 2138  ACCTCAACACTATGGAATCCTATGACCCACAAACTAATGAGTGGACACAGATGGCTTCCTTGAATATTGGGAGA  2211
            ||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2147  ACCTCAACACCATGGAGTCCTATGATCCACAAACTAATGAGTGGACACAGATGGCTTCATTGAATATTGGGAGA  2220

Query 2212  GCAGGTGCCTGTGTGGTAGTCATCAAGCAACCT  2244
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2221  GCAGGTGCCTGTGTGGTTGTCATCAAGCAACCT  2253