Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469374
• Subject: XM_024446739.1
• Aligned Length: 915
• Identities: 620
• Gaps: 240

Alignment

Query   1  ATGGGTCGGCCCCTGCTGCTGCCCCTGCTGCTCCTGCTGCAGCCGCCAGCATTTCTGCAGCCTGGTGGCTCCAC  74
           ||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   1  ATGGGTCGGCCCCTGCTGCTGCCCCTACTGCCCTTGCTGCTGCCGCCAGCATTTCTGCAGCCTAGTGGCTCCAC  74

Query  75  AGGATCTGGTCCAAGCTACCTTTATGGGGTCACTCAACCAAAACACCTCTCAGCCTCCATGGGTGGCTCTGTGG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGGATCTGGTCCAAGCTACCTTTATGGGGTCACTCAACCAAAACACCTCTCAGCCTCCATGGGTGGCTCTGTGG  148

Query 149  AAATCCCCTTCTCCTTCTATTACCCCTGGGAGTTAGCCATAGTTCCCAACGTGAGAATATCCTGGAGACGGGGC  222
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AAATCCCCTTCTCCTTCTATTACCCCTGGGAGTTAGCCACAGCTCCCGACGTGAGAATATCCTGGAGACGGGGC  222

Query 223  CACTTCCACGGGCAGTCCTTCTACAGCACAAGGCCGCCTTCCATTCACAAGGATTATGTGAACCGGCTCTTTCT  296
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CACTTCCACAGGCAGTCCTTCTACAGCACAAGGCCGCCTTCCATTCACAAGGATTATGTGAACCGGCTCTTTCT  296

Query 297  GAACTGGACAGAGGGTCAGGAGAGCGGCTTCCTCAGGATCTCAAACCTGCGGAAGGAGGACCAGTCTGTGTATT  370
           |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 297  GAACTGGACAGAGGGTCAGAAGAGCGGCTTCCTCAGGATCTCCAACCTGCAGAAGCAGGACCAGTCTGTGTATT  370

Query 371  TCTGCCGAGTCGAGCTGGACACCCGGAGATCAGGGAGGCAGCAGTTGCAGTCCATCAAGGGGACCAAACTCACC  444
           ||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 371  TCTGCCGAGTTGAGCTGGACACACGGAGCTCAGGGAGGCAGCAGTGGCAGTCCATCGAGGGGACCAAACTCTCC  444

Query 445  ATCACCCAGGCTGTCACAACCACC------------------------ACCACCTGGAGGCCCAGCAGCACAAC  494
           |||||||||||||||||.||||||                        |||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 445  ATCACCCAGGCTGTCACGACCACCACCCAGAGGCCCAGCAGCATGACTACCACCTGGAGGCTCAGTAGCACAAC  518

Query 495  CACCATAGCCGGCCTCAGGGTCACAGAAAGCAAAGGGCACTCAGAATCATGGCACCTAAGTCTGGACACTGCCA  568
           |||||.|.|||||||||||||||||.|..|||||.|.|.||||||.||.||||||.||||||||||.|||||..
Sbjct 519  CACCACAACCGGCCTCAGGGTCACACAGGGCAAACGACGCTCAGACTCTTGGCACATAAGTCTGGAGACTGCTG  592

Query 569  TCAGGGTTGCATTGGCTGTCGCTGTGCTCAAAACTGTCATTTTGGGACTGCTGTGCCTCCTCCTCCTGTGGTGG  642
           |..||||.|||.||||||||.||||||||..||...|.||||||||||||.|.|||||||||      .|||||
Sbjct 593  TGGGGGTGGCAGTGGCTGTCACTGTGCTCGGAATCATGATTTTGGGACTGATCTGCCTCCTC------AGGTGG  660

Query 643  AGGAGAAGGAAAGGT-AGCAGGG--------------CGCCAAGCAGTGA---CTTC-----------------  681
           ||||||||||||||| |||||.|              |.|||..|||.||   ||||                 
Sbjct 661  AGGAGAAGGAAAGGTCAGCAGCGGACTAAAGCCACAACCCCAGCCAGGGAACCCTTCCAAAACACAGAGGAGCC  734

Query 682  --------------------------------------------------------------------------  681
                                                                                     
Sbjct 735  ATATGAGAATATCAGGAATGAAGGACAAAATACAGATCCCAAGCTAAATCCCAAGGATGACGGCATCGTCTATG  808

Query 682  --------------------------------------------------------------------------  681
                                                                                     
Sbjct 809  CTTCCCTTGCCCTCTCCAGCTCCACCTCACCCAGAGCACCTCCCAGCCACCGTCCCCTCAAGAGCCCCCAGAAC  882

Query 682  ---------------------------  681
                                      
Sbjct 883  GAGACCCTGTACTCTGTCTTAAAGGCC  909