Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469377
- Subject:
- NM_001290216.2
- Aligned Length:
- 1410
- Identities:
- 1278
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ATGTTTGACTGTAT----------------GGATGTTCTGT-----CAGTGA------------------GTCC 35
|| |.||||.|.|| |||||| .|||
Sbjct 1 ------------ATGACCACCAGCGGCCACGCATGTCCGGTCCCAGCAGTGAACGGACACATGACTCACTATCC 62
Query 36 TGGGCAAATCCTGGA----------TTTCTACACTG-----CGAGTCCGTCTT--CCTGCATGCTCCAGGAGAA 92
.|.||.|.||| | ||||.|| ||| .||| |.||| ||||| ||||
Sbjct 63 -AGCCACACCCT--ACCCGTTACTCTTTCCAC-CTGTCATCGGAG---GACTTTCCCTGC---CTCC------- 119
Query 93 AGCTCTCAAAGCATG--CTTCAGTGG--ATTGACCCAAACCGAATGGCAGCATCGGCACACTGCT------CAA 156
.||| |||| ||||| ||| || ||....||||.|||..||| ||||.|.| | |||
Sbjct 120 -CCTC------CATGGCCTTCA-TGGACAT---CCGCCTCCGAGTGGATGCA---GCACCCCG-TCGCCGGCAA 178
Query 157 TCAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCTCCCCCTCGAGT 230
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 -CAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCTCCCCCTCGAGT 251
Query 231 GTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGATGTA 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 GTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGATGTA 325
Query 305 AGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGTGTTATTAAT 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 AGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGTGTTATTAAT 399
Query 379 AAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAAAGAATCTGT 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 AAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAAAGAATCTGT 473
Query 453 CAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAATGACAGCTG 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 CAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAATGACAGCTG 547
Query 527 AGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAGCTGGGTAAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 AGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAGCTGGGTAAA 621
Query 601 TACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAGTGAACTGGC 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 TACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAGTGAACTGGC 695
Query 675 CACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCATCGCAGACC 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 CACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCATCGCAGACC 769
Query 749 AAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATACCCCAGAACAA 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 AAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATACCCCAGAACAA 843
Query 823 GACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTTGGTCCTCTGAC 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 GACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTTGGTCCTCTGAC 917
Query 897 TGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCCTTCTCAGTG 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 TGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCCTTCTCAGTG 991
Query 971 CCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAAGAACCATTG 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 CCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAAGAACCATTG 1065
Query 1045 CTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGATCTTAATGAA 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 CTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGATCTTAATGAA 1139
Query 1119 AATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAATTCCTGGAT 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAATTCCTGGAT 1213
Query 1193 CAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGTTCAAGTGGG 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 CAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGTTCAAGTGGG 1287
Query 1267 AACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTCACCACTCGT 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 AACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTCACCACTCGT 1361
Query 1341 GCAA 1344
||||
Sbjct 1362 GCAA 1365