Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469377
• Subject: NM_001290266.1
• Aligned Length: 1345
• Identities: 1193
• Gaps: 149

Alignment

Query    1  ATGTTTGACTGTATGGATGTTCTGTCAGTGAGTCCTGGGCAAATCCTGGATTTCTACACTGCGAGTCCGTCTTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCATGCTCCAGGAGAAAGCTCTCAAAGCATGCTTCAGTGGATTGACCCAAACCGAATGGCAGCATCGGCACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGCTCAAT-CAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCTCC  221
            |||...||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  CTGGAAAATGCAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCTCC  74

Query  222  CCCTCGAGTGTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTG  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCTCGAGTGTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTG  148

Query  296  AGGGATGTAAGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGT  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGATGTAAGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGT  222

Query  370  GTTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAA  296

Query  444  AGAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAA  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAA  370

Query  518  TGACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAG  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAG  444

Query  592  CTGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAG  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAG  518

Query  666  TGAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCA  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCA  592

Query  740  TCGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATACC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATACC  666

Query  814  CCAGAACAAGACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTTGG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGAACAAGACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTTGG  740

Query  888  TCCTCTGACTGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCC  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTCTGACTGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCC  814

Query  962  TTCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAA  888

Query 1036  GAACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGAT  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGAT  962

Query 1110  CTTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAA  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAA  1036

Query 1184  TTCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGT  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGT  1110

Query 1258  TCAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTC  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTC  1184

Query 1332  ACCACTCGTGCAA  1344
            |||||||||||||
Sbjct 1185  ACCACTCGTGCAA  1197