Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000469377
Subject:
NM_001290277.1
Aligned Length:
1344
Identities:
1206
Gaps:
138

Alignment

Query    1  ATGTTTGACTGTATGGATGTTCTGTCAGTGAGTCCTGGGCAAATCCTGGATTTCTACACTGCGAGTCCGTCTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGACTGTATGGATGTTCTGTCAGTGAGTCCTGGGCAAATCCTGGATTTCTACACTGCGAGTCCGTCTTC  74

Query   75  CTGCATGCTCCAGGAGAAAGCTCTCAAAGCATGCTTCAGTGGATTGACCCAAACCGAATGGCAGCATCGGCACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCATGCTCCAGGAGAAAGCTCTCAAAGCATGCTTCAGTGGATTGACCCAAACCGAATGGCAGCATCGGCACA  148

Query  149  CTGCTCAATCAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCTCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCTCAATCAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCTCCC  222

Query  223  CCTCGAGTGTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCGAGTGTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGA  296

Query  297  GGGATGTAAGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGATGTAAGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACTGTG  370

Query  371  TTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCCAAA  444

Query  445  GAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGAAAT  518

Query  519  GACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCCAGC  592

Query  593  TGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTCAGT  666

Query  667  GAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGACCAT  740

Query  741  CGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATACCC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct  741  CGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCT-----------------------------  785

Query  815  CAGAACAAGACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTTGGT  888
                                                                                      
Sbjct  786  --------------------------------------------------------------------------  785

Query  889  CCTCTGACTGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCCT  962
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  -----------------------------------GCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGGCCT  824

Query  963  TCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  TCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTACAAG  898

Query 1037  AACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  AACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAGATC  972

Query 1111  TTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  TTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGAAAT  1046

Query 1185  TCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  TCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAAGTT  1120

Query 1259  CAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  CAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAGTCA  1194

Query 1333  CCACTCGTGCAA  1344
            ||||||||||||
Sbjct 1195  CCACTCGTGCAA  1206