Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469418
- Subject:
- XM_011530042.3
- Aligned Length:
- 1721
- Identities:
- 1574
- Gaps:
- 142
Alignment
Query 1 ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA 74
Query 75 GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG 148
Query 149 TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG 222
Query 223 ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG 296
Query 297 GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA 370
Query 371 ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG 444
Query 445 CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA 518
Query 519 TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA 592
Query 593 AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA 666
Query 667 GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAATGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAACGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG 740
Query 741 CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC 814
Query 815 GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC 888
Query 889 TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT 962
Query 963 CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT 1036
Query 1037 GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC 1110
Query 1111 TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATAC 1184
Query 1185 CATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACTG 1258
Query 1259 ACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATGCCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCCCAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATGCCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCCCAG 1332
Query 1333 ATTGCGCAGGAGCGGAAGACACAGCTCAAGGTAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCCAGGCAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATTGCGCAGGAGCGGAAGACACAGCTCAAGGTAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCCAGGCAGG 1406
Query 1407 GAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACCGAGCAGCAGAGGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACCGAGCAGCAGAGGA 1480
Query 1481 AGAGCCCTCAACCAGTGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGGGGACTTCAGCTCCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGAGCCCTCAACCAGTGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGGGGACTTCAGCTCCT 1554
Query 1555 GGTAGCAGCAG------GCTGCCTGATGACCAC----------------------------------------- 1581
||||||||||| ||.|.||| .|||.|
Sbjct 1555 GGTAGCAGCAGCAACTTGCAGGCTG--TACCTCTGCCCTTCCTTTTCTCATCAATCACTGATGCTGAAGCTGCA 1626
Query 1582 -------------------------------------------------------------------------- 1581
Sbjct 1627 GGCCTGAGCCCTTTGTCTCCCTGGATGCTGGGTGGCGCCTCATCTGCATCTCTGCCTCACCCCATCCACTGCCA 1700
Query 1582 ------------------- 1581
Sbjct 1701 CAGGCTGCCTGATGACCAC 1719