Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469418
- Subject:
- XM_024452193.1
- Aligned Length:
- 1585
- Identities:
- 1225
- Gaps:
- 344
Alignment
Query 1 ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA 74
Query 75 GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG 148
Query 149 TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG 222
Query 223 ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG 296
Query 297 GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA 370
Query 371 ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG 444
Query 445 CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA 518
Query 519 TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA 592
Query 593 AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA 666
Query 667 GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAATGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAACGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG 740
Query 741 CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC 814
Query 815 GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC 888
Query 889 TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT 962
Query 963 CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT 1036
Query 1037 GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC 1110
Query 1111 TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATAC 1184
|||||||||||||||||||||||||||||.|| || |.||.||.|..|
Sbjct 1111 TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTATT-------TT---------------------CCAGGAGGAGGC 1156
Query 1185 CATCTTTGGACG-GGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACT 1257
|| |.|| ||| |||| ||||
Sbjct 1157 CA------GGCGCGGT-------GGCT----------------CATG--------------------------- 1174
Query 1258 GACCGCCCTA-AGGAGGAGATCCGCATTGATGCCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCCC 1330
|||| | |||| ||| |.||.|| |||||||||.| |
Sbjct 1175 ------CCTATA-------ATCC---------------CAG-----------CACTTTG-GGAGGCCGAGG--C 1206
Query 1331 AGATTGCGCAGGAGCGGAAGACACAGCTCA--AGGTAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCCAGG 1402
|| ||||| ||| |||| |.|||||.| ||| .|||.||.| |
Sbjct 1207 AG-----------GCGGA---------TCACGAGGT----CAGGAGATC--------GAG--ACCATCCTC--G 1244
Query 1403 CAGGGAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACCGAGCAGCAG 1476
|
Sbjct 1245 C------------------------------------------------------------------------- 1245
Query 1477 AGGAAGAGCCCTCAACCAGTGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGGGGACTTCAGC 1550
Sbjct 1246 -------------------------------------------------------------------------- 1245
Query 1551 TCCTGGTAGCAGCAGGCTGCCTGATGACCAC 1581
Sbjct 1246 ------------------------------- 1245