Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469428
• Subject: XM_006517155.2
• Aligned Length: 2259
• Identities: 1999
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCGAAGAGCCTGGAGTCTGCAGTGCACTGCTTTCGTCCTCTTTTGCGCTTGGTGTGCACTGAACAGTGC  74
            |||||||.|||||..||||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct    1  ATGGAGCAAAGAGGTTGGACTCTGCAGTGTACTGCTTTCGCCTTCTTTTGCGTTTGGTGTGCACTAAACAGTGT  74

Query   75  AAAAGCGAAAAGGCAATTTGTCAATGAATGGGCAGCGGAGATCCCCGGGGGCCCGGAAGCAGCCTCGGCCATCG  148
            ||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|..|||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  AAAAGCAAAGAGGCAGTTTGTTAATGAATGGGCGGCGGAGATCCCCGGAGGGCAAGAAGCTGCCTCTGCCATCG  148

Query  149  CCGAGGAGCTGGGCTATGACCTTTTGGGTCAGATTGGTTCACTTGAAAATCACTACTTATTCAAACATAAAAAC  222
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|
Sbjct  149  CCGAAGAACTGGGGTATGACCTTTTGGGTCAGATTGGATCACTTGAAAATCACTATTTATTCAAACACAAAAGC  222

Query  223  CACCCCAGAAGGTCTCGAAGGAGTGCCTTTCATATCACTAAGAGATTATCTGATGATGATCGTGTGATATGGGC  296
            ||.||..|.|||||.|||||.||.||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  223  CATCCTCGGAGGTCCCGAAGAAGCGCTCTTCATATCACTAAGAGGTTATCTGATGATGATCGTGTGACGTGGGC  296

Query  297  TGAACAACAGTATGAAAAAGAAAGAAGTAAACGTTCAGCTCTAAGGGACTCAGCACTAAATCTCTTCAATGATC  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||..|||||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct  297  TGAACAACAGTATGAAAAAGAGAGAAGTAAACGTTCAGTTCAAAAAGACTCAGCATTGGATCTCTTCAATGATC  370

Query  371  CCATGTGGAATCAGCAATGGTACTTGCAAGATACCAGGATGACGGCAGCCCTGCCCAAGCTGGACCTTCATGTG  444
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CAATGTGGAATCAGCAGTGGTACTTGCAAGATACCAGAATGACTGCAGCTCTGCCCAAGCTGGACCTTCATGTA  444

Query  445  ATACCTGTTTGGCAAAAAGGCATTACGGGCAAAGGAGTTGTTATCACCGTACTGGATGATGGTTTGGAGTGGAA  518
            ||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  ATACCTGTTTGGGAAAAGGGTATTACTGGCAAAGGAGTTGTTATTACTGTACTGGATGATGGCTTGGAGTGGAA  518

Query  519  TCACACGGACATTTATGCCAACTATGATCCAGAGGCTAGCTATGATTTTAATGATAATGACCATGATCCATTTC  592
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  TCACACAGACATTTATGCCAATTATGATCCAGAGGCTAGCTATGATTTTAACGATAATGATCATGATCCATTTC  592

Query  593  CCCGATATGATCCCACAAACGAGAACAAACACGGGACCAGATGTGCAGGAGAAATTGCCATGCAAGCAAATAAT  666
            ||||||||||||.||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCGATATGATCTCACAAATGAAAACAAACATGGAACAAGATGTGCAGGTGAAATTGCCATGCAAGCAAATAAT  666

Query  667  CACAAATGCGGGGTTGGAGTTGCATACAATTCCAAAGTTGGAGGCATAAGAATGCTGGATGGCATTGTGACGGA  740
            |||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  667  CACAAGTGTGGGGTTGGAGTTGCATATAATTCCAAAGTTGGAGGCATAAGAATGCTGGATGGCATTGTAACTGA  740

Query  741  TGCTATTGAGGCCAGTTCAATTGGATTCAATCCTGGACACGTGGATATTTACAGTGCAAGCTGGGGCCCTAATG  814
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCATTGAGGCTAGTTCAATTGGATTCAACCCTGGCCATGTGGATATTTACAGTGCAAGCTGGGGCCCTAATG  814

Query  815  ATGATGGGAAAACTGTGGAGGGGCCTGGCCGGCTAGCCCAGAAGGCTTTTGAATATGGTGTCAAACAGGGGAGA  888
            |||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGATGGAAAAACTGTGGAGGGGCCTGGCAGACTAGCCCAGAAGGCATTTGAATATGGTGTCAAACAGGGGAGA  888

Query  889  CAGGGGAAGGGGTCCATCTTCGTCTGGGCTTCGGGAAACGGGGGGCGTCAGGGAGATAATTGTGACTGTGATGG  962
            ||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGGGAAAGGCTCCATCTTTGTCTGGGCTTCAGGGAATGGGGGTCGTCAGGGAGATAACTGTGACTGTGATGG  962

Query  963  CTACACAGACAGCATCTACACCATCTCCATCAGCAGTGCCTCCCAGCAAGGCCTATCCCCCTGGTACGCTGAGA  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct  963  CTACACAGACAGCATTTACACCATCTCTATCAGCAGTGCCTCCCAGCAAGGCCTGTCACCTTGGTATGCAGAGA  1036

Query 1037  AGTGCTCCTCCACACTGGCCACCTCTTACAGCAGCGGAGATTACACCGACCAGAGAATCACGAGCGCTGACCTG  1110
            ||||.||.||||||.||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  AGTGTTCTTCCACATTGGCTACCTCCTACAGCAGTGGTGATTACACAGACCAGCGAATAACAAGCGCTGACCTG  1110

Query 1111  CACAATGACTGCACGGAGACGCACACAGGCACCTCGGCCTCTGCACCTCTGGCTGCTGGCATCTTCGCTCTGGC  1184
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  CACAATGACTGCACAGAGACCCACACAGGCACCTCGGCTTCAGCACCCCTGGCTGCTGGTATCTTTGCTCTGGC  1184

Query 1185  CCTGGAAGCAAACCCAAATCTCACCTGGCGAGATATGCAGCACCTGGTTGTCTGGACCTCTGAGTATGACCCGC  1258
            |.||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..
Sbjct 1185  CTTGGAGGCAAACCCAAATCTTACCTGGAGAGATATGCAGCATCTGGTTGTCTGGACCTCTGAGTACGACCCAT  1258

Query 1259  TGGCCAATAACCCTGGATGGAAAAAGAATGGAGCAGGCTTGATGGTGAATAGTCGATTTGGATTTGGCTTGCTA  1332
            ||||||.||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCCAGTAACCCAGGTTGGAAAAAGAATGGGGCAGGCTTGATGGTGAACAGCCGATTTGGATTTGGCTTGCTA  1332

Query 1333  AATGCCAAAGCTCTGGTGGATTTAGCTGACCCCAGGACCTGGAGGAGCGTGCCTGAGAAGAAAGAGTGTGTTGT  1406
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|..|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  AATGCCAAAGCTCTGGTGGATTTGGCTGATCCTAGGACCTGGAGAAATGTGCCTGAGAAGAAAGAATGTGTTGT  1406

Query 1407  AAAGGACAATGACTTTGAGCCCAGAGCCCTGAAAGCTAATGGAGAAGTTATCATTGAAATTCCAACAAGAGCTT  1480
            |||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  AAAAGACAATAACTTTGAGCCTAGAGCCCTGAAAGCTAATGGAGAAGTAATTGTTGAAATCCCAACAAGAGCTT  1480

Query 1481  GTGAAGGACAAGAAAATGCTATCAAGTCCCTGGAGCATGTACAATTTGAAGCAACAATTGAATATTCCCGAAGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1481  GTGAAGGACAAGAAAATGCTATCAAGTCTCTGGAACATGTGCAATTTGAAGCAACAATTGAATATTCTCGTAGA  1554

Query 1555  GGAGACCTTCATGTCACACTTACTTCTGCTGCTGGAACTAGCACTGTGCTCTTGGCTGAAAGAGAACGGGATAC  1628
            ||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||
Sbjct 1555  GGAGACCTTCATGTCACACTCACTTCTGCTGTTGGAACCAGCACTGTACTGTTGGCTGAAAGGGAAAGAGATAC  1628

Query 1629  ATCTCCTAATGGCTTTAAGAATTGGGACTTCATGTCTGTTCACACATGGGGAGAGAACCCTATAGGTACTTGGA  1702
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||.||||
Sbjct 1629  ATCCCCCAATGGCTTTAAGAATTGGGACTTCATGTCTGTTCATACATGGGGAGAGAATCCTGTAGGCACCTGGA  1702

Query 1703  CTTTGAGAATTACAGACATGTCTGGAAGAATTCAAAATGAAGGAAGAATTGTGAACTGGAAGCTGATTTTGCAC  1776
            |.||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1703  CATTGAAAATTACAGACATGTCTGGAAGAATGCAAAATGAAGGAAGGATTGTGAACTGGAAGTTGATTTTGCAT  1776

Query 1777  GGGACCTCTTCTCAGCCAGAGCATATGAAGCAGCCTCGTGTGTACACGTCCTACAACACTGTTCAGAATGACAG  1850
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1777  GGGACATCTTCTCAACCAGAGCACATGAAGCAGCCTCGTGTGTACACATCCTACAATACAGTCCAGAATGACAG  1850

Query 1851  AAGAGGGGTGGAGAAGATGGTGGATCCAGGGGAGGAGCAGCCCACACAAGAGAACCCTAAGGAGAACACCCTGG  1924
            .|||||.|||||.|||||||||.||...|.||||.|||.||||||||||.|||.||..||.|..||...|||||
Sbjct 1851  GAGAGGAGTGGAAAAGATGGTGAATGTTGTGGAGAAGCGGCCCACACAAAAGAGCCTGAATGGCAATCTCCTGG  1924

Query 1925  TGTCCAAAAGCCCCAGCAGCAGCAGCGTAGGGGGCCGGAGGGATGAGTTGGAGGAGGGAGCCCCTTCCGAGGCC  1998
            |..||||||.|.||||||||||||..||.|.|||..|.|||||||||..||...|.|||.|.|||||..|||||
Sbjct 1925  TACCCAAAAACTCCAGCAGCAGCAATGTGGAGGGTAGAAGGGATGAGCAGGTACAAGGAACTCCTTCAAAGGCC  1998

Query 1999  ATGCTGCGACTCCTGCAAAGTGCTTTCAGTAAAAACTCACCGCCAAAGCAATCACCAAAGAAGTCCCCAACTGC  2072
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||..|||...||||.|||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1999  ATGCTGCGACTCCTACAAAGTGCTTTTAGCAAGAATGCACTTTCAAAACAATCACCAAAGAAGTCTCCAAGTGC  2072

Query 2073  AAAGCTCAACATCCCTTATGAAAACTTCTACGAAGCCCTGGAAAAGCTGAACAAACCTTCCCAGCTTAAAGACT  2146
            ||||||||.||||||||||||||..|||||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||.|||||.|||.||
Sbjct 2073  AAAGCTCAGCATCCCTTATGAAAGTTTCTATGAAGCCTTGGAAAAGCTCAACAAGCCCTCCAAGCTTGAAGGCT  2146

Query 2147  CTGAAGACAGTCTGTATAATGACTATGTTGATGTTTTTTATAACACTAAACCTTACAAGCACAGAGACGACCGG  2220
            ||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||.||
Sbjct 2147  CTGAAGACAGTCTGTACAGTGACTATGTTGATGTATTCTATAACACAAAACCTTATAAGCATAGAGATGACAGG  2220

Query 2221  CTGCTTCAAGCTCTGGTGGACATTCTGAATGAGGAAAAT  2259
            |||||.||||||||..|||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 2221  CTGCTGCAAGCTCTCATGGACATCCTAAATGAGGAGAAT  2259