Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469479
- Subject:
- XM_017005557.2
- Aligned Length:
- 1849
- Identities:
- 1733
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ---ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA 74
Query 72 CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT 148
Query 146 GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA 219
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCG--------------------------------------------- 177
Query 220 GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 ----------------GGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA 235
Query 294 TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAAC--------------------------------- 334
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGCCTAAAGAAGTAATTCAGAAGAACACACAA 309
Query 335 -------------------AAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGA 389
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 TCCAGTGATGTTTGCAACAAAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGA 383
Query 390 AGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCC 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 AGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCC 457
Query 464 CGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGC 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 CGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGC 531
Query 538 CACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGT 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 CACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGT 605
Query 612 TGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCC 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 TGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCC 679
Query 686 ATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCA 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 ATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCA 753
Query 760 TGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAAT 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 TGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAAT 827
Query 834 CTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAA 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 CTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAA 901
Query 908 CAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAG 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 CAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAG 975
Query 982 GGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATAT 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 GGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATAT 1049
Query 1056 GCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGAC 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 GCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGAC 1123
Query 1130 TGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCAC 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 TGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCAC 1197
Query 1204 TCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCA 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCA 1271
Query 1278 GGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAAC 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272 GGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAAC 1345
Query 1352 AGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTC 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 AGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTC 1419
Query 1426 ATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTT 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420 ATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTT 1493
Query 1500 CTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTG 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 CTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTG 1567
Query 1574 GCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACG 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568 GCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACG 1641
Query 1648 CCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGAT 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642 CCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGAT 1715
Query 1722 CAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG 1794
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 CAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG 1788