Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469479
• Subject: XM_017005560.2
• Aligned Length: 1812
• Identities: 1593
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGACAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACTGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCAGTC  222
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------ATGGAAGTTGATTACTCAGTC  21

Query  223  TCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   22  TCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGATGG  95

Query  297  ACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACA------------------AGTCAACACAGACACAG  352
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||
Sbjct   96  ACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTTTTTGCCTTTTCCCTAGTCAACACAGACACAG  169

Query  353  AAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCAT  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  AAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCAT  243

Query  427  CAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCG  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  CAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCG  317

Query  501  AGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  AGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTG  391

Query  575  ATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAG  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  ATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAG  465

Query  649  AACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGT  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  AACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGT  539

Query  723  CACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAG  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  CACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAG  613

Query  797  ATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGA  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  ATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGA  687

Query  871  AAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  AAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTT  761

Query  945  GAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  GAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGA  835

Query 1019  TTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGG  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  TTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGG  909

Query 1093  TTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGC  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  TTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGC  983

Query 1167  TCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGT  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  TCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGT  1057

Query 1241  TTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTG  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058  TTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTG  1131

Query 1315  GGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGC  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132  GGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGC  1205

Query 1389  CCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCC  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206  CCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCC  1279

Query 1463  AGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCAT  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280  AGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCAT  1353

Query 1537  ATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTT  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354  ATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTT  1427

Query 1611  AACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCG  1684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428  AACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCG  1501

Query 1685  GGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAG  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502  GGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAG  1575

Query 1759  AAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1576  AAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1611