Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469531
• Subject: NM_001161580.2
• Aligned Length: 1221
• Identities: 948
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGCGCCCTGCGCGGAGGACCCCTCGCTGGAAAGGCATTTTAAGGGCCACCGAGATGCAGTTACCTGTGT  74

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGTCTGGCACATGAAGC  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACTTCAGTATCAACACAAAGCAGCTGGCCAGTGGCTCCATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGC  148

Query   20  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  222

Query   94  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  296

Query  168  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  370

Query  242  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  444

Query  316  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  518

Query  390  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  592

Query  464  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  666

Query  538  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  740

Query  612  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  814

Query  686  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATG  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATG  888

Query  760  GTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAGTCACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGGC  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAGTCACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGGC  962

Query  834  CAGCTCCATGGGGAATCTGCCAGAAGTGGACTTCCCTGTCCCCCCAGGCAGAGGCAGGAGTGTGGAGTCTGTGC  907
            ||||||||||||||||||                                                        
Sbjct  963  CAGCTCCATGGGGAATCT--------------------------------------------------------  980

Query  908  AGAGCCAGCCCCAGGAGCCCGTGAGTGTGCCCCAGACACTGACTAGCACGCTGGAGCACATTGTGGGCCAGCTG  981
                                                                                      
Sbjct  981  --------------------------------------------------------------------------  980

Query  982  GATGTCCTCACTCAGACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  1055
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  981  --------------GACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  1040

Query 1056  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1092
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1077