Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469531
• Subject: XM_011533560.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 993
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGCGCCCTGCGCGGAGGACCCCTCGCTGGAAAGGCATTTTAAGGGCCACCGAGATGCAGTTACCTGTGT  74

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGTCTGGCACATGAAGC  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACTTCAGTATCAACACAAAGCAGCTGGCCAGTGGCTCCATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGC  148

Query   20  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  222

Query   94  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  296

Query  168  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  370

Query  242  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  444

Query  316  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  518

Query  390  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  592

Query  464  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  666

Query  538  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  740

Query  612  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  814

Query  686  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATG  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  815  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAA------  882

Query  760  GTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAGTCACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGGC  833
                                                                                      
Sbjct  883  --------------------------------------------------------------------------  882

Query  834  CAGCTCCATGGGGAATCTGCCAGAAGTGGACTTCCCTGTCCCCCCAGGCAGAGGCAGGAGTGTGGAGTCTGTGC  907
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  -------------------CCAGAAGTGGACTTCCCTGTCCCCCCAGGCAGAGGCAGGAGTGTGGAGTCTGTGC  937

Query  908  AGAGCCAGCCCCAGGAGCCCGTGAGTGTGCCCCAGACACTGACTAGCACGCTGGAGCACATTGTGGGCCAGCTG  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  AGAGCCAGCCCCAGGAGCCCGTGAGTGTGCCCCAGACACTGACTAGCACGCTGGAGCACATTGTGGGCCAGCTG  1011

Query  982  GATGTCCTCACTCAGACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012  GATGTCCTCACTCAGACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  1085

Query 1056  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1092
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1122