Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469531
• Subject: XM_011533561.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 849
• Gaps: 372

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGCGCCCTGCGCGGAGGACCCCTCGCTGGAAAGGCATTTTAAGGGCCACCGAGATGCAGTTACCTGTGT  74

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGTCTGGCACATGAAGC  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACTTCAGTATCAACACAAAGCAGCTGGCCAGTGGCTCCATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGC  148

Query   20  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  222

Query   94  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  296

Query  168  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  370

Query  242  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  444

Query  316  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  518

Query  390  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  592

Query  464  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  666

Query  538  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  740

Query  612  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  814

Query  686  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATG  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  815  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAA------  882

Query  760  GTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAGTCACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGGC  833
                                                                                      
Sbjct  883  --------------------------------------------------------------------------  882

Query  834  CAGCTCCATGGGGAATCTGCCAGAAGTGGACTTCCCTGTCCCCCCAGGCAGAGGCAGGAGTGTGGAGTCTGTGC  907
                                                                                      
Sbjct  883  --------------------------------------------------------------------------  882

Query  908  AGAGCCAGCCCCAGGAGCCCGTGAGTGTGCCCCAGACACTGACTAGCACGCTGGAGCACATTGTGGGCCAGCTG  981
                                                                                      
Sbjct  883  --------------------------------------------------------------------------  882

Query  982  GATGTCCTCACTCAGACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  1055
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  ---------------ACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  941

Query 1056  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1092
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  978