Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469531
• Subject: XM_017006104.1
• Aligned Length: 1107
• Identities: 948
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ---------------ATGGTCTGGCACATGAAGCCGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGC  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGCCGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGC  74

Query   60  CGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACACCTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCT  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACACCTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCT  148

Query  134  GGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTTTCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGC  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTTTCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGC  222

Query  208  AGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACGACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATT  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACGACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATT  296

Query  282  CCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTCCGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGT  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTCCGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGT  370

Query  356  CTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGACAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCAT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGACAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCAT  444

Query  430  GGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCAGTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGT  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCAGTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGT  518

Query  504  GAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTGCAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCT  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTGCAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCT  592

Query  578  CTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGCCTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAG  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGCCTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAG  666

Query  652  GGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGGGACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTA  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGGGACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTA  740

Query  726  TTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATGGTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAG  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATGGTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAG  814

Query  800  TCACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGGCCAGCTCCATGGGGAATCTGCCAGAAGTGGACTTCCCTGTC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct  815  TCACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGGCCAGCTCCATGGGGAATCT----------------------  866

Query  874  CCCCCAGGCAGAGGCAGGAGTGTGGAGTCTGTGCAGAGCCAGCCCCAGGAGCCCGTGAGTGTGCCCCAGACACT  947
                                                                                      
Sbjct  867  --------------------------------------------------------------------------  866

Query  948  GACTAGCACGCTGGAGCACATTGTGGGCCAGCTGGATGTCCTCACTCAGACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGT  1021
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  ------------------------------------------------GACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGT  892

Query 1022  TGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCTGGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1092
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  TGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCTGGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  963