Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469534
• Subject: NM_014513.2
• Aligned Length: 1332
• Identities: 822
• Gaps: 420

Alignment

Query    1  ATGTCGCTCATGGTCGTCAGCATGGCGTGTGTTGGGTTGTTCTTGGTCCAGAGGGCCGGTCCACACATGGGTGG  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||.|.|||.||                    
Sbjct    1  ATGTCGCTCATGGTCATCAGCATGGCGTGTGTTGCGTTCTTCTTGCTGCAGGGG--------------------  54

Query   75  TCAGGACAAGCCCTTCCTGTCTGCCTGGCCCAGCGCTGTGGTGCCTCGCGGAGGACACGTGACTCTTCGGTGTC  148
                                  ||||||||                                            
Sbjct   55  ----------------------GCCTGGCC--------------------------------------------  62

Query  149  ACTATCGTCATAGGTTTAACAATTTCATGCTATACAAAGAAGACAGAATCCACGTTCCCATCTTCCATGGCAGA  222
                                                                                      
Sbjct   63  --------------------------------------------------------------------------  62

Query  223  ATATTCCAGGAGGGCTTCAACATGAGCCCTGTGACCACAGCACATGCAGGGAACTACACATGTCGGGGTTCACA  296
                               |||||||                                                
Sbjct   63  -------------------ACATGAG------------------------------------------------  69

Query  297  CCCACACTCCCCCACTGGGTGGTCGGCACCCAGCAACCCCATGGTGATCATGGTCACAGGAAACCACAGAAAAC  370
                                                                      |||..||.||||||||
Sbjct   70  ----------------------------------------------------------GGATTCCGCAGAAAAC  85

Query  371  CTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGGAGAGAGAGTCATCCTGCAATGTTGGTCAGATATC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   86  CTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGAAGAGACAGTCATCCTGCAATGTTGGTCAGATGTC  159

Query  445  ATGTTTGAGCACTTCTTTCTGCACAAAGAGGGGATCTCTAAGGACCCCTCACGCCTCGTTGGACAGATCCATGA  518
            |||||||||||||||.|||||||||.||||||||..|.|||..||.|.|..||||||.|||||.||..|..|||
Sbjct  160  ATGTTTGAGCACTTCCTTCTGCACAGAGAGGGGACGTTTAACCACACTTTGCGCCTCATTGGAGAGCACATTGA  233

Query  519  TGGGGTCTCCAAGGCCAATTTCTCCATCGGTCCCATGATGCTTGCCCTTGCAGGGACCTACAGATGCTACGGTT  592
            ||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||..|..|.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  TGGGGTCTCCAAGGGCAACTTCTCCATCGGTCGCATGACACAAGACCTGGCAGGGACCTACAGATGCTACGGTT  307

Query  593  CTGTTACTCACACCCCCTATCAGTTGTCAGCTCCCAGTGATCCCCTGGACATCGTGGTCACAGGTCCATATGAG  666
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  308  CTGTTACTCACTCCCCCTATCAGTTGTCAGCGCCCAGTGACCCTCTGGACATCGTGATCACAGGTCTATATGAG  381

Query  667  AAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCAAGGTTCAGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCCTGTAGCTCCCG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  382  AAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCACGGTTCTGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCCTGCAGCTCCCG  455

Query  741  GAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAGGGGGGAGCCCATGAACGTAGGCTCCCTGCAGTGCGCAAGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  456  GAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAAGGGGAGGCCCATGAACGTAGGCTCCCTGCAGGGCCCAAGG  529

Query  815  TCAACAGAACATTCCAGGCAGATTTCCCTCTGGGCCCTGCCACCCACGGAGGGACCTACAGATGCTTCGGCTCT  888
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  TCAACAGAACATTCCAGGCCGACTTTCCTCTGGACCCTGCCACCCACGGAGGGACCTACAGATGCTTCGGCTCT  603

Query  889  TTCCGTCACTCTCCCTACGAGTGGTCAGACCCGAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGAAACCCTTCAAG  962
            ||||||.|||||||.||||||||||||.|..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct  604  TTCCGTGACTCTCCATACGAGTGGTCAAAGTCAAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGAAACTCTTCAAA  677

Query  963  TAGTTGGCCTTCACCCACAGAACCAAGCTCCAAATCTGGTAACCCCAGACACCTGCACATTCTGATTGGGACCT  1036
            ||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct  678  TAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTCCGAAACCGGTAACCCCAGACACCTACACGTTCTGATTGGGACCT  751

Query 1037  CAGTGGTCATCATCCTCTTCATCCTCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCTCTGGTGCTCCAACAAAAAAAATGCT  1110
            |||||||||...|||..||||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  752  CAGTGGTCAAACTCCCTTTCACCATCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGTGCTCCAACAAAAAAAATGCA  825

Query 1111  GCTGTAATGGACCAAGAGCCTGCAGGGAACAGAACAGCCAACAGCGAGGACTCTGATGAACAAGACCCTGAGGA  1184
            .|||||||||||||||.||||||.|||||||||||||..|||||.|||||.|||||||||||.||||.|.||||
Sbjct  826  TCTGTAATGGACCAAGGGCCTGCGGGGAACAGAACAGTGAACAGGGAGGATTCTGATGAACAGGACCATCAGGA  899

Query 1185  GGTGACATACGCACAGTTGGATCACTGCGTTTTCACACAGAGAAAAATCACTCGCCCTTCTCAGAGGCCCAAGA  1258
            ||||.||||||||                                                             
Sbjct  900  GGTGTCATACGCA-------------------------------------------------------------  912

Query 1259  CACCCCCTACAGATACCATCTTGTACACGGAACTTCCAAATGCTAAGCCCAGATCCAAAGTTGTCTCCTGCCCA  1332
                                                                                      
Sbjct  913  --------------------------------------------------------------------------  912