Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469605
• Subject: NM_001287045.1
• Aligned Length: 1212
• Identities: 1184
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74

Query   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148

Query  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222

Query  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296

Query  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370

Query  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444

Query  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518

Query  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACG------------ACGGTGCCTGACTTTCAGG  580
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACGTGTGAGGGAGATACGGTGCCTGACTTTCAGG  592

Query  581  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAG  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAG  666

Query  655  CAGGAGCTCCGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAG  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGAGCTCCGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAG  740

Query  729  TAGCACTCACGTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCT  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGCACTCACGTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCT  814

Query  803  ACCGCCACATGCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAG---------------ATTTCCCGGCACCTTCGTGGGC  861
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCCACATGCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAGCTCCCAGGGTGCCATATTTCCCGGCACCTTCGTGGGC  888

Query  862  ACCACAGAGCCCGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCC  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCACAGAGCCCGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCC  962

Query  936  CTCTGTGGCCAGCCTGGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGA  1009
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTGTGGCCAGCCTGGCCCCTCCGGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGA  1036

Query 1010  CCCGCAAAGCTCGGGTGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTC  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCGCAAAGCTCGGGTGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTC  1110

Query 1084  ATCACTGTCTACAGCCTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGT  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCACTGTCTACAGCCTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGT  1184

Query 1158  CCCTGTCACCTACTTGGAACTGCTCAGC  1185
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCTGTCACCTACTTGGAACTGCTCAGC  1212