Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469605
• Subject: XM_011239078.1
• Aligned Length: 1243
• Identities: 942
• Gaps: 197

Alignment

Query    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA  74

Query   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA  148

Query  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222
            ||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG  222

Query  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296

Query  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370
            .||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  297  GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC  370

Query  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444
            ..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct  371  GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA  444

Query  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA  518

Query  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACG------------ACGGTGCCTGACTTTCAGG  580
            |||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||            |||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCACGTGTGAGGGCGATACGGTGCCTGACTTTCAGG  592

Query  581  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAG  654
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTATCGGCCAGCGCCTCCGCGCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAG  666

Query  655  CAGGAGCTCCGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAG  728
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  667  CAGGAGCTTCGAGTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAG  740

Query  729  TAGCACTCACGTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCT  802
            .||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  CAGTACTCATGTGAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCT  814

Query  803  ACCGCCACATGCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAG-------------------------------------  839
            ||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||                                     
Sbjct  815  ACCGCCACATGCTGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGGTGTGGCTGGACCCAGGTCTCTGAGGCCCCCTATCTC  888

Query  840  ---------ATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCCGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCA  904
                     ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  889  CCAGACCCAATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCTGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCTA  962

Query  905  CCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCCAGCCTGGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGC  978
            ||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||...|.||||||||||||..|||||..|.||||||
Sbjct  963  CCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCTGTCTTGGCCCCTCCAGAAGAGGCAGCCCTCTGC  1036

Query  979  CTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGCTCGGGTGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAG  1052
            |||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||      
Sbjct 1037  CTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGCCCGGGTGCTCTACGACTACGAGGCAGC------  1104

Query 1053  CAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGCCTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCA  1126
                                                                                      
Sbjct 1105  --------------------------------------------------------------------------  1104

Query 1127  TTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACCTACTTGGAACTGCTCAGC  1185
                                                                       
Sbjct 1105  -----------------------------------------------------------  1104