Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469627
- Subject:
- NM_001161839.1
- Aligned Length:
- 1241
- Identities:
- 1086
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGATTCTTCACAGATTAAAAGAAAGATTTCAGCTTTCCTTAAGACAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCA 74
||||||.||.||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATTATTTACAGGTTAAAAGAAAGGCTTCAGCTTTCCTTAAGACAAGATAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCA 74
Query 75 CCTATCGCCCATCACATTACAGCCAGCACTGTCCGAGGCAAAGACAGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGG 148
||||||.|||||..||...||||.|||||..||.|||||.|||||...|||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 75 CCTATCACCCATTGCACGGCAGCAAGCACAATCGGAGGCCAAGACGACCCACAGCATGGTCCAGCCCGATCAGG 148
Query 149 CCCCAAAGGTACTGAATGTTGTCGTGGACCCTCAAGGCCGAGGTGCTCCTGAGA-TCAAAGCTACCACCGCTAC 221
|.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||.|.|..||||||||| ||.||.| |.||||.|.||
Sbjct 149 CGCCAAAGGTGCTGAACGTGGTTGTGGACCCTCAAGGCCAATGCACTCCTGAGATTCGAAAC-AGCACCTCCAC 221
Query 222 CTCTGTTTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAAGCCCATAGGACTTCAAAAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTA 295
||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.||..||.||.||||.|||||.||||||||||
Sbjct 222 CTCTGTCTGCCCTTCTCCCTTCAGAATGAAGCCCATAGGACTCCAGGAGCGACGAGGTTCCAATGTATCTCTTA 295
Query 296 CATTGGACATGAGTAGCTTGGGGAACATTGAACCCTTTGT----GTCTATACCAACACCACGGGAGAAGGTAGC 365
|..||||||||||||||.||||.|...|.||||||||||| |||| ||||.||.||||||||||||||
Sbjct 296 CGCTGGACATGAGTAGCCTGGGCAGTGTGGAACCCTTTGTGGCCGTCT----CAACCCCCCGGGAGAAGGTAGC 365
Query 366 AATGGAGTATCTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTCACAAGGTCTCAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCACATT 439
.|||||.||.||||||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||..
Sbjct 366 CATGGAATACCTGCAGTCAGCCAGCCGAGTTCTCACACGGTCACAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCCCACC 439
Query 440 TACTCCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAACTTTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCGCGTCATGGA 513
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 440 TACTTCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAATTTTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCACGTCACGGA 513
Query 514 ACTAAAAATCGCTATAAGACCATTTTACCAAATCCCCTCAGCAGAGTGTGTTTAAGACCAAAAAATGTAACCGA 587
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct 514 ACTAAAAATCGTTATAAGACCATTTTGCCAAATCCCCTCAGCAGAGTGTGCTTAAGACCAAAAAATATAACCGA 587
Query 588 TTCATTGAGCACCTACATTAATGCTAATTATATTAGGGGCTACAGTGGCAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGC 661
|||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 588 TTCCTTGAGTACTTACATAAATGCTAACTATATTCGGGGCTACAGTGGTAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACCC 661
Query 662 AGGGCCCCATGATCAACACCGTGGATGATTTCTGGCAGATGGTTTGGCAGGAAGACAGCCCTGTGATTGTTATG 735
|||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 662 AGGGCCCCATGATCAACACTGTGAATGACTTCTGGCAGATGGTGTGGCAAGAAGACAGTCCCGTGATTGTGATG 735
Query 736 ATCACAAAACTCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTGTGCTATACTGGCCGGAAAAGAGAGGGATATATGGAAAAGT 809
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 736 ATCACGAAACTCAAAGAGAAAAATGAGAAATGTGTGCTCTACTGGCCAGAAAAGAGAGGGATTTACGGCAAGGT 809
Query 810 TGAGGTTCTGGTTATCAGTGTAAATGAATGTGATAACTACACCATTCGAAACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCC 883
||||||||||||.|.|.||||.|..||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 810 TGAGGTTCTGGTCACCGGTGTGACCGAATGTGATAACTACACCATCCGCAACCTCGTCTTAAAGCAAGGAAGTC 883
Query 884 ACACCCAACATGTGAAGCATTACTGGTACACCTCATGGCCTGATCACAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTC 957
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 884 ACACCCAACATGTGAAGCACTACTGGTACACTTCATGGCCGGATCATAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTT 957
Query 958 CTACAGCTCATGCTGGATGTAGAAGAAGACAGACTTGCTTCCCAGGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAG 1031
||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 CTGCAGCTCATGTTGGATGTGGAAGAAGACAGACTGGCCTCTGAAGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAG 1031
Query 1032 TGCAGGAATAGGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCTACATCCATTGGCTGTCAACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTG 1105
|||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct 1032 TGCGGGGATTGGGAGAACTGGGTGTTTCATCGCTACATCCATTGGCTGTCAACAATTGAAAGAAGAAGGAGTTG 1105
Query 1106 TGGATGCACTAAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTATGGATAGAGGTGGAATGGTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAA 1179
|.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1106 TAGACGCACTAAGTATTGTCTGCCAGCTTCGTGTAGACAGGGGTGGTATGGTCCAAACCAGCGAGCAGTATGAA 1179
Query 1180 TTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCAGACTTTCAGCAGAGACTGTCCAG 1236
|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||.||||.||||||.||
Sbjct 1180 TTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTTCGAGAGCAGACTTTCACCAGAAACTGTCGAG 1236