Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469635
• Subject: XM_011521012.2
• Aligned Length: 1806
• Identities: 1445
• Gaps: 357

Alignment

Query    1  ATGGATAGCAGGGTCTCAGGAGCAACCAGTAATGGAGAGACAAAACCAGTGTATCCAGTCATGGAAAAGAAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAAGATGGCACCCTGGAGCGGGGGCACTGGAACAACAAGATGGAGTTTGTGCTGTCAGTGGCTGGGGAGATCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGGCTTAGGCAACGTCTGGAGGTTTCCCTATCTCTGCTACAAAAATGGGGGAGGTGCCTTCTTCATCCCCTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCGTCTTCCTCTTTACCTGTGGCATTCCTGTCTTCCTTCTGGAGACAGCACTAGGCCAGTACACTAGCCAGGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGGCGTCACAGCCTGGAGGAAGATCTGCCCCATCTTTGAGGGCATTGGCTATGCCTCCCAGATGATCGTCATCC  370
                                                                         |||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------ATGATCGTCATCC  13

Query  371  TCCTCAACGTCTACTACATCATTGTGTTGGCCTGGGCCCTGTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCATCGACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   14  TCCTCAACGTCTACTACATCATTGTGTTGGCCTGGGCCCTGTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCATCGACCTG  87

Query  445  CCCTGGGGCGGCTGCTACCATGAGTGGAACACAGAACACTGTATGGAGTTCCAGAAGACCAACGGCTCCCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   88  CCCTGGGGCGGCTGCTACCATGAGTGGAACACAGAACACTGTATGGAGTTCCAGAAGACCAACGGCTCCCTGAA  161

Query  519  TGGTACCTCTGAGAATGCCACCTCTCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGCGGCGGGTCTTGAAGATCTCTGATGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  162  TGGTACCTCTGAGAATGCCACCTCTCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGCGGCGGGTCTTGAAGATCTCTGATGGGA  235

Query  593  TCCAGCACCTGGGGGCCCTGCGCTGGGAGCTGGCTCTGTGCCTCCTGCTGGCCTGGGTCATCTGCTACTTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  236  TCCAGCACCTGGGGGCCCTGCGCTGGGAGCTGGCTCTGTGCCTCCTGCTGGCCTGGGTCATCTGCTACTTCTGC  309

Query  667  ATCTGGAAGGGGGTGAAGTCCACAGGCAAGGTGGTGTACTTCACGGCCACATTTCCTTACCTCATGCTGGTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  310  ATCTGGAAGGGGGTGAAGTCCACAGGCAAGGTGGTGTACTTCACGGCCACATTTCCTTACCTCATGCTGGTGGT  383

Query  741  CCTGTTAATTCGAGGGGTGACGTTGCCTGGGGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCAAACCTCACGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  CCTGTTAATTCGAGGGGTGACGTTGCCTGGGGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCAAACCTCACGC  457

Query  815  GTCTGTGGGATCCCCAGGTGTGGATGGATGCAGGCACCCAGATATTCTTCTCCTTCGCCATCTGTCTTGGGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  GTCTGTGGGATCCCCAGGTGTGGATGGATGCAGGCACCCAGATATTCTTCTCCTTCGCCATCTGTCTTGGGTGC  531

Query  889  CTGACAGCCCTGGGCAGCTACAACAAGTACCACAACAACTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTCTGCTTCCTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  CTGACAGCCCTGGGCAGCTACAACAAGTACCACAACAACTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTCTGCTTCCTCAA  605

Query  963  CAGCGGCACCAGCTTTGTGGCCGGCTTTGCCATCTTCTCCATCCTGGGCTTAGGGTCTCAGGAGCAGGGGGTGC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||
Sbjct  606  CAGCGGCACCAGCTTTGTGGCCGGCTTTGCCATCTTCTCCATCCTGGGCTTCATGTCTCAGGAGCAGGGGGTGC  679

Query 1037  CCATTTCTGAGGTGGCCGAGTCAGGCCCTGGCCTGGCTTTCATCGCTTACCCGCGGGCTGTGGTGATGCTGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  CCATTTCTGAGGTGGCCGAGTCAGGCCCTGGCCTGGCTTTCATCGCTTACCCGCGGGCTGTGGTGATGCTGCCC  753

Query 1111  TTCTCTCCTCTCTGGGCCTGCTGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTGGATAGCCAGTTTGTGTGTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  TTCTCTCCTCTCTGGGCCTGCTGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTGGATAGCCAGTTTGTGTGTGT  827

Query 1185  AGAAAGCCTGGTGACAGCGCTGGTGGACATGTACCCTCACGTGTTCCGCAAGAAGAACCGGAGGGAAGTCCTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  AGAAAGCCTGGTGACAGCGCTGGTGGACATGTACCCTCACGTGTTCCGCAAGAAGAACCGGAGGGAAGTCCTCA  901

Query 1259  TCCTTGGAGTATCTGTCGTCTCCTTCCTTGTGGGGCTGATCATGCTCACAGAGGGCGGAATGTACGTGTTCCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  TCCTTGGAGTATCTGTCGTCTCCTTCCTTGTGGGGCTGATCATGCTCACAGAGGGCGGAATGTACGTGTTCCAG  975

Query 1333  CTCTTTGACTACTATGCGGCCAGTGGCATGTGCCTCCTGTTCGTGGCCATCTTCGAGTCCCTCTGTGTGGCTTG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  CTCTTTGACTACTATGCGGCCAGTGGCATGTGCCTCCTGTTCGTGGCCATCTTCGAGTCCCTCTGTGTGGCTTG  1049

Query 1407  GGTTTACGGAGCCAAGCGCTTCTACGACAACATCGAAGACATGATTGGGTACAGGCCATGGCCTCTTATCAAAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  GGTTTACGGAGCCAAGCGCTTCTACGACAACATCGAAGACATGATTGGGTACAGGCCATGGCCTCTTATCAAAT  1123

Query 1481  ACTGTTGGCTCTTCCTCACACCAGCTGTGTGCACAGCCACCTTTCTCTTCTCCCTGATAAAGTACACTCCGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  ACTGTTGGCTCTTCCTCACACCAGCTGTGTGCACAGCCACCTTTCTCTTCTCCCTGATAAAGTACACTCCGCTG  1197

Query 1555  ACCTACAACAAGAAGTACACGTACCCGTGGTGGGGCGATGCCCTGGGCTGGCTCCTGGCTCTGTCCTCCATGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  ACCTACAACAAGAAGTACACGTACCCGTGGTGGGGCGATGCCCTGGGCTGGCTCCTGGCTCTGTCCTCCATGGT  1271

Query 1629  CTGCATTCCTGCCTGGAGCCTCTACAGACTCGGAACCCTCAAGGGCCCCTTCAGAGAGAGAATCCGTCAGCTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272  CTGCATTCCTGCCTGGAGCCTCTACAGACTCGGAACCCTCAAGGGCCCCTTCAGAGAGAGAATCCGTCAGCTCA  1345

Query 1703  TGTGCCCAGCCGAGGACTTGCCCCAGCGGAACCCAGCAGGACCCTCGGCTCCCGCCACCCCCAGGACCTCACTG  1776
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346  TGTGCCCAGCCGAGGACCTGCCCCAGCGGAACCCAGCAGGACCCTCGGCTCCCGCCACCCCCAGGACCTCACTG  1419

Query 1777  CTCAGACTCACAGAGCTAGAGTCTCACTGC  1806
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420  CTCAGACTCACAGAGCTAGAGTCTCACTGC  1449