Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469635
• Subject: XM_017019844.1
• Aligned Length: 1806
• Identities: 1177
• Gaps: 624

Alignment

Query    1  ATGGATAGCAGGGTCTCAGGAGCAACCAGTAATGGAGAGACAAAACCAGTGTATCCAGTCATGGAAAAGAAGGA  74
            ||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATAGCAGGGTCTCAGGCACAACCAGTAATGGAGAGACAAAACCAGTGTATCCAGTCATGGAAAAGAAGGA  74

Query   75  GGAAGATGGCACCCTGGAGCGGGGGCACTGGAACAACAAGATGGAGTTTGTGCTGTCAGTGGCTGGGGAGATCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAAGATGGCACCCTGGAGCGGGGGCACTGGAACAACAAGATGGAGTTTGTGCTGTCAGTGGCTGGGGAGATCA  148

Query  149  TTGGCTTAGGCAACGTCTGGAGGTTTCCCTATCTCTGCTACAAAAATGGGGGAGGTGCCTTCTTCATCCCCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGGCTTAGGCAACGTCTGGAGGTTTCCCTATCTCTGCTACAAAAATGGGGGAGGTGCCTTCTTCATCCCCTAC  222

Query  223  CTCGTCTTCCTCTTTACCTGTGGCATTCCTGTCTTCCTTCTGGAGACAGCACTAGGCCAGTACACTAGCCAGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCGTCTTCCTCTTTACCTGTGGCATTCCTGTCTTCCTTCTGGAGACAGCACTAGGCCAGTACACTAGCCAGGG  296

Query  297  AGGCGTCACAGCCTGGAGGAAGATCTGCCCCATCTTTGAGGGCATTGGCTATGCCTCCCAGATGATCGTCATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCGTCACAGCCTGGAGGAAGATCTGCCCCATCTTTGAGGGCATTGGCTATGCCTCCCAGATGATCGTCATCC  370

Query  371  TCCTCAACGTCTACTACATCATTGTGTTGGCCTGGGCCCTGTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCATCGACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTCAACGTCTACTACATCATTGTGTTGGCCTGGGCCCTGTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCATCGACCTG  444

Query  445  CCCTGGGGCGGCTGCTACCATGAGTGGAACACAGAACACTGTATGGAGTTCCAGAAGACCAACGGCTCCCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTGGGGCGGCTGCTACCATGAGTGGAACACAGAACACTGTATGGAGTTCCAGAAGACCAACGGCTCCCTGAA  518

Query  519  TGGTACCTCTGAGAATGCCACCTCTCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGCGGCGGGTCTTGAAGATCTCTGATGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTACCTCTGAGAATGCCACCTCTCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGCGGCGGGTCTTGAAGATCTCTGATGGGA  592

Query  593  TCCAGCACCTGGGGGCCCTGCGCTGGGAGCTGGCTCTGTGCCTCCTGCTGGCCTGGGTCATCTGCTACTTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGCACCTGGGGGCCCTGCGCTGGGAGCTGGCTCTGTGCCTCCTGCTGGCCTGGGTCATCTGCTACTTCTGC  666

Query  667  ATCTGGAAGGGGGTGAAGTCCACAGGCAAGGTGGTGTACTTCACGGCCACATTTCCTTACCTCATGCTGGTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCTGGAAGGGGGTGAAGTCCACAGGCAAGGTGGTGTACTTCACGGCCACATTTCCTTACCTCATGCTGGTGGT  740

Query  741  CCTGTTAATTCGAGGGGTGACGTTGCCTGGGGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCAAACCTCACGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGTTAATTCGAGGGGTGACGTTGCCTGGGGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCAAACCTCACGC  814

Query  815  GTCTGTGGGATCCCCAGGTGTGGATGGATGCAGGCACCCAGATATTCTTCTCCTTCGCCATCTGTCTTGGGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCTGTGGGATCCCCAGGTGTGGATGGATGCAGGCACCCAGATATTCTTCTCCTTCGCCATCTGTCTTGGGTGC  888

Query  889  CTGACAGCCCTGGGCAGCTACAACAAGTACCACAACAACTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTCTGCTTCCTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGACAGCCCTGGGCAGCTACAACAAGTACCACAACAACTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTCTGCTTCCTCAA  962

Query  963  CAGCGGCACCAGCTTTGTGGCCGGCTTTGCCATCTTCTCCATCCTGGGCTTAGGGTCTCAGGAGCAGGGGGTGC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCGGCACCAGCTTTGTGGCCGGCTTTGCCATCTTCTCCATCCTGGGCTTCATGTCTCAGGAGCAGGGGGTGC  1036

Query 1037  CCATTTCTGAGGTGGCCGAGTCAGGCCCTGGCCTGGCTTTCATCGCTTACCCGCGGGCTGTGGTGATGCTGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATTTCTGAGGTGGCCGAGTCAGGCCCTGGCCTGGCTTTCATCGCTTACCCGCGGGCTGTGGTGATGCTGCCC  1110

Query 1111  TTCTCTCCTCTCTGGGCCTGCTGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTGGATAGCCAGTTTGTGTGTGT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1111  TTCTCTCCTCTCTGGGCCTGCTGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTGGATAGCC-------------  1171

Query 1185  AGAAAGCCTGGTGACAGCGCTGGTGGACATGTACCCTCACGTGTTCCGCAAGAAGAACCGGAGGGAAGTCCTCA  1258
            |||||||||||                                                               
Sbjct 1172  AGAAAGCCTGG---------------------------------------------------------------  1182

Query 1259  TCCTTGGAGTATCTGTCGTCTCCTTCCTTGTGGGGCTGATCATGCTCACAGAGGGCGGAATGTACGTGTTCCAG  1332
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1333  CTCTTTGACTACTATGCGGCCAGTGGCATGTGCCTCCTGTTCGTGGCCATCTTCGAGTCCCTCTGTGTGGCTTG  1406
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1407  GGTTTACGGAGCCAAGCGCTTCTACGACAACATCGAAGACATGATTGGGTACAGGCCATGGCCTCTTATCAAAT  1480
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1481  ACTGTTGGCTCTTCCTCACACCAGCTGTGTGCACAGCCACCTTTCTCTTCTCCCTGATAAAGTACACTCCGCTG  1554
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1555  ACCTACAACAAGAAGTACACGTACCCGTGGTGGGGCGATGCCCTGGGCTGGCTCCTGGCTCTGTCCTCCATGGT  1628
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1629  CTGCATTCCTGCCTGGAGCCTCTACAGACTCGGAACCCTCAAGGGCCCCTTCAGAGAGAGAATCCGTCAGCTCA  1702
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1703  TGTGCCCAGCCGAGGACTTGCCCCAGCGGAACCCAGCAGGACCCTCGGCTCCCGCCACCCCCAGGACCTCACTG  1776
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1777  CTCAGACTCACAGAGCTAGAGTCTCACTGC  1806
                                          
Sbjct 1183  ------------------------------  1182