Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469635
- Subject:
- XR_001748849.1
- Aligned Length:
- 1959
- Identities:
- 1462
- Gaps:
- 492
Alignment
Query 1 -----------------------------------------------------ATGGATAGCAGGGTCTCAGGA 21
||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 AGATAATTCTTCTCCCCTGACTGGACCTCTGGCAGCAGCTTCACTAAGGTGGGATGGATAGCAGGGTCTCAGGC 74
Query 22 GCAACCAGTAATGGAGAGACAAAACCAGTGTATCCAGTCATGGAAAAGAAGGAGGAAGATGGCACCCTGGAGCG 95
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACAACCAGTAATGGAGAGACAAAACCAGTGTATCCAGTCATGGAAAAGAAGGAGGAAGATGGCACCCTGGAGCG 148
Query 96 GGGGCACTGGAACAACAAGATGGAGTTTGTGCTGTCAGTGGCTGGGGAGATCATTGGCTTAGGCAACGTCTGGA 169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGGGCACTGGAACAACAAGATGGAGTTTGTGCTGTCAGTGGCTGGGGAGATCATTGGCTTAGGCAACGTCTGGA 222
Query 170 GGTTTCCCTATCTCTGCTACAAAAATGGGGGAGGTGCCTTCTTCATCCCCTACCTCGTCTTCCTCTTTACCTGT 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTTTCCCTATCTCTGCTACAAAAATGGGGGAGGTGCCTTCTTCATCCCCTACCTCGTCTTCCTCTTTACCTGT 296
Query 244 GGCATTCCTGTCTTCCTTCTGGAGACAGCACTAGGCCAGTACACTAGCCAGGGAGGCGTCACAGCCTGGAGGAA 317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCATTCCTGTCTTCCTTCTGGAGACAGCACTAGGCCAGTACACTAGCCAGGGAGGCGTCACAGCCTGGAGGAA 370
Query 318 GATCTGCCCCATCTTTGAGGGCATTGGCTATGCCTCCCAGATGATCGTCATCCTCCTCAACGTCTACTACATCA 391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GATCTGCCCCATCTTTGAGGGCATTGGCTATGCCTCCCAGATGATCGTCATCCTCCTCAACGTCTACTACATCA 444
Query 392 TTGTGTTGGCCTGGGCCCTGTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCATCGACCTGCCCTGGGGCGGCTGCTACCAT 465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGTGTTGGCCTGGGCCCTGTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCATCGACCTGCCCTGGGGCGGCTGCTACCAT 518
Query 466 GAGTGGAACACAGAACACTGTATGGAGTTCCAGAAGACCAACGGCTCCCTGAATGGTACCTCTGAGAATGCCAC 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGTGGAACACAGAACACTGTATGGAGTTCCAGAAGACCAACGGCTCCCTGAATGGTACCTCTGAGAATGCCAC 592
Query 540 CTCTCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGCGGCGGGTCTTGAAGATCTCTGATGGGATCCAGCACCTGGGGGCCCTGC 613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCTCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGCGGCGGGTCTTGAAGATCTCTGATGGGATCCAGCACCTGGGGGCCCTGC 666
Query 614 GCTGGGAGCTGGCTCTGTGCCTCCTGCTGGCCTGGGTCATCTGCTACTTCTGCATCTGGAAGGGGGTGAAGTCC 687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTGGGAGCTGGCTCTGTGCCTCCTGCTGGCCTGGGTCATCTGCTACTTCTGCATCTGGAAGGGGGTGAAGTCC 740
Query 688 ACAGGCAAGGTGGTGTACTTCACGGCCACATTTCCTTACCTCATGCTGGTGGTCCTGTTAATTCGAGGGGTGAC 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAGGCAAGGTGGTGTACTTCACGGCCACATTTCCTTACCTCATGCTGGTGGTCCTGTTAATTCGAGGGGTGAC 814
Query 762 GTTGCCTGGGGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCAAACCTCACGCGTCTGTGGGATCCCCAGGTGT 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTTGCCTGGGGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCAAACCTCACGCGTCTGTGGGATCCCCAGGTGT 888
Query 836 GGATGGATGCAGGCACCCAGATATTCTTCTCCTTCGCCATCTGTCTTGGGTGCCTGACAGCCCTGGGCAGCTAC 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGATGGATGCAGGCACCCAGATATTCTTCTCCTTCGCCATCTGTCTTGGGTGCCTGACAGCCCTGGGCAGCTAC 962
Query 910 AACAAGTACCACAACAACTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTCTGCTTCCTCAACAGCGGCACCAGCTTTGTGGC 983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACAAGTACCACAACAACTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTCTGCTTCCTCAACAGCGGCACCAGCTTTGTGGC 1036
Query 984 CGGCTTTGCCATCTTCTCCATCCTGGGCTTAGGGTCTCAGGAGCAGGGGGTGCCCATTTCTGAGGTGGCCGAGT 1057
||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGGCTTTGCCATCTTCTCCATCCTGGGCTTCATGTCTCAGGAGCAGGGGGTGCCCATTTCTGAGGTGGCCGAGT 1110
Query 1058 CAGGCCCTGGCCTGGCTTTCATCGCTTACCCGCGGGCTGTGGTGATGCTGCCCTTCTCTCCTCTCTGGGCCTGC 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGGCCCTGGCCTGGCTTTCATCGCTTACCCGCGGGCTGTGGTGATGCTGCCCTTCTCTCCTCTCTGGGCCTGC 1184
Query 1132 TGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTGGATAGCCAGTTTGTGTGTGTAGAAAGCCTGGTGACAGCGCT 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTGGATAGCCAGTTTGTGTGTGTAGAAAGCCTGGTGACAGCGCT 1258
Query 1206 GGTGGACATGTACCCTCACGTGTTCCGCAAGAAGAACCGGAGGGAAGTCCTCATCCTTGGAGTATCTGTCGTCT 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGTGGACATGTACCCTCACGTGTTCCGCAAGAAGAACCGGAGGGAAGTCCTCATCCTTGGAGTATCTGTCGTCT 1332
Query 1280 CCTTCCTTGTGGGGCTGATCATGCTCAC---------------------------------------------- 1307
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTTCCTTGTGGGGCTGATCATGCTCACAGAGGAACGACAAAGTAGGCAGGTCCCTCCTCTGGCCTTTGGGCAT 1406
Query 1308 ------------------------------------------------------AGAGGGCGGAATGTACGTGT 1327
||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGACCACCCACCTCCAGGGATGGGTGAGGAGCCATTTGGCTCCACAGTAAGTGAAGAGGGCGGAATGTACGTGT 1480
Query 1328 TCCAGCTCTTTGACTACTATGCGGCCAGTGGCATGTGCCTCCTGTTCGTGGCCATCTTCGAGTCCCTCTGTGTG 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCAGCTCTTTGACTACTATGCGGCCAGTGGCATGTGCCTCCTGTTCGTGGCCATCTTCGAGTCCCTCTGTGTG 1554
Query 1402 GCTTGGGTTTACGGAGCCAAGCGCTTCTACGACAACATCGAAGACATGATTGGGTACAGGCCATGGCCTCTTAT 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCTTGGGTTTACGGAGCCAAGCGCTTCTACGACAACATCGAAGACATGATTGGGTACAGGCCATGG-------- 1620
Query 1476 CAAATACTGTTGGCTCTTCCTCACACCAGCTGTGTGCACAGCCACCTTTCTCTTCTCCCTGATAAAGTACACTC 1549
Sbjct 1621 -------------------------------------------------------------------------- 1620
Query 1550 CGCTGACCTACAACAAGAAGTACACGTACCCGTGGTGGGGCGATGCCCTGGGCTGGCTCCTGGCTCTGTCCTCC 1623
Sbjct 1621 -------------------------------------------------------------------------- 1620
Query 1624 ATGGTCTGCATTCCTGCCTGGAGCCTCTACAGACTCGGAACCCTCAAGGGCCCCTTCAGAGAGAGAATCCGTCA 1697
Sbjct 1621 -------------------------------------------------------------------------- 1620
Query 1698 GCTCATGTGCCCAGCCGAGGACTTGCCCCAGCGGAACCCAGCAGGACCCTCGGCTCCCGCCACCCCCAGGACCT 1771
Sbjct 1621 -------------------------------------------------------------------------- 1620
Query 1772 CACTGCTCAGACTCACAGAGCTAGAGTCTCACTGC 1806
Sbjct 1621 ----------------------------------- 1620