Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469660
• Subject: XM_006533641.3
• Aligned Length: 959
• Identities: 771
• Gaps: 67

Alignment

Query   1  ATGGCCGACACCATCTTCGGCAGCGGGAATGATCAGTGGGTTTGCCCCAATGACCGGCAGCTTGCCCTTCGAGC  74
           |||||.||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||..||||
Sbjct   1  ATGGCTGACACCATCTTCAGCAGTGGAAATGATCAGTGGGTTTGCCCCAACGATCGGCAGCTTGCTCTGAGAGC  74

Query  75  CAAGCTGCAGACGGGCTGGTCCGTGCACACCTACCAGACGGAGAAGCAGAGGAGGAAGCAGCACCTCAGCCCGG  148
           |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||..|||.|||||.|
Sbjct  75  CAAGCTGCAGACGGGCTGGTCTGTGCACACGTACCAGACGGAGAAGCAGAGGAGGAGCCAGTGCCTGAGCCCCG  148

Query 149  CGGAGGTGGAGGCCATCCTGCAGGTCATCCAGAGGGCAGAGCGGCTCGACGTCCTGGAGCAGCAGAGAATCGGG  222
           ..|||.|||||..||||||.||||||||||||||.||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149  GAGAGCTGGAGATCATCCTTCAGGTCATCCAGAGAGCAGAGAGGCTAGACATCCTGGAGCAGCAGAGAATTGGG  222

Query 223  CGGCTGGTGGAGCGGCTGGAGACCATGAGGCGGAATGTGATGGGGAACGGCCTGTCCCAGTGTCTGCTCTGCGG  296
           |||||||||||||||||||||||.|||..|.||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CGGCTGGTGGAGCGGCTGGAGACAATGCAGAGGAACGTGATGGGCAACGGTCTCTCCCAGTGTCTGCTCTGCGG  296

Query 297  GGAGGTGCTGGGCTTCCTGGGCAGCTCGTCGGTGTTCTGCAAAGACTGCAGGAAGAAAGTCTGCACCAAATGTG  370
           ||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297  GGAGGTGCTGGGATTCCTGGGCAGCTCCTCCGTATTCTGCAAAGACTGCAGGAAGAAAGTCTGCACCAAGTGTG  370

Query 371  GGATCGAGGCCTCCCCTGGCCAGAAGCGGCCCCTGTGGCTGTGTAAGATCTGCAGTGAGCAAAGAGAGGTCTGG  444
           ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371  GGATCGAGGCTTCCCCCGGCCAGAAGCGGCCCCTGTGGCTGTGTAAGATCTGCAGTGAGCAGAGAGAGGTCTGG  444

Query 445  AAGAGGTCGGGGGCCTGGTTCTACAAAGGGCTCCCCAAGTATATCTTGCCCCTGAAGACCCCTGGCCGAGCTGA  518
           ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445  AAGAGGTCAGGGGCCTGGTTCTACAAAGGGCTCCCCAAGTACATCTTGCCCCTGAAAACCCCTGGCCGGGCTGA  518

Query 519  TGACCCCCACTTCCGACCTTTGCCCACGGAACCGGCAGAGCGAGAGCC-CAGAAGCTCTGAGACCAGCCGCATC  591
           |||.|||||||||||||||.||||...|||.||..||||...|.|||| |.| ||..||||.||||||||..||
Sbjct 519  TGATCCCCACTTCCGACCTCTGCCTGTGGAGCCCACAGAAACACAGCCTCCG-AGTGCTGAAACCAGCCGTGTC  591

Query 592  TACACGTGGGCCCGAGGAAGAGTGGTTTCCAGTGACAGTGACAGTGACTCGGATCTTAGCTCCTCCAGCCTAGA  665
           |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 592  TACACATGGGCCCGAGGGAGAGTGGTTTCCAGTGACAGTGACAGTGACTCAGATCTCAGCTCCTCCAGCCTGGA  665

Query 666  GGACAGACTCCCAT--CCACTGGGGTCAGGGACCGGAAAGGCGACAAACCCTGGA-AGGAGTCAGGTGGCAGCG  736
           |||||||  |||.|  ||.|||||||||.||.|...|||||.||| ||.|||.|| .|||.|||||||.||||.
Sbjct 666  GGACAGA--CCCTTGCCCTCTGGGGTCAAGGGCACAAAAGGTGAC-AAGCCTAGAGGGGACTCAGGTGCCAGCA  736

Query 737  TGGAGGCCCCCAGGATGGG--------GTTCACCCACCCGCCGGGCCACCTCTCTGGGTGCCAGAGCAGCCTGG  802
           |||||.|.||||||.||||        ||.||||||        ||||.|||||.||..|.|||||||||||.|
Sbjct 737  TGGAGTCACCCAGGCTGGGGCCTGCCCGTCCACCCA--------GCCATCTCTCGGGCAGTCAGAGCAGCCTAG  802

Query 803  CCAGTGGTGAGACGGGGACAGGCTCTGCTGACCCGCCAGG--GGGACCCCGCCCCGGGCTGACCCGAAGGGCCC  874
           .||   |||||.|.||||||||..||.|.||.|| .||||  ||.|||||..|||.|.||||.||.|.||..||
Sbjct 803  GCA---GTGAGGCTGGGACAGGTGCTACAGAGCC-ACAGGGAGGCACCCCAGCCCAGCCTGAGCCCAGGGTACC  872

Query 875  CGGTAAAAGACACACCTGGACGAGCCCCCGCTGCTGACGCAGCTCCAGCAGGCCCCTCCAGCTGCCTGGGC  945
           |||.|||||||||||.|||.|.|..|||||||.|                                     
Sbjct 873  CGGCAAAAGACACACATGGGCAACTCCCCGCTAC-------------------------------------  906