Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000469669
Subject:
NM_001346139.1
Aligned Length:
1419
Identities:
1416
Gaps:
3

Alignment

Query    1  ATGGGACAGTCAGGGAGGTCCCGGCACCAGAAGCGCGCCCGCGCCCAGGCGCAGCTCCGCAACCTCGAGGCCTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACAGTCAGGGAGGTCCCGGCACCAGAAGCGCGCCCGCGCCCAGGCGCAGCTCCGCAACCTCGAGGCCTA  74

Query   75  TGCCGCGAACCCGCACTCGTTCGTGTTCACGCGAGGCTGCACGGGTCGCAACATCCGGCAGCTCAGCCTGGACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCCGCGAACCCGCACTCGTTCGTGTTCACGCGAGGCTGCACGGGTCGCAACATCCGGCAGCTCAGCCTGGACG  148

Query  149  TGCGGCGGGTCATGGAGCCGCTCACTGCCAGCCGTCTGCAGGTTCGTAAGAAGAACTCGCTGAAGGACTGCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCGGCGGGTCATGGAGCCGCTCACTGCCAGCCGTCTGCAGGTTCGTAAGAAGAACTCGCTGAAGGACTGCGTG  222

Query  223  GCAGTGGCTGGGCCCCTCGGGGTCACACACTTTCTGATCCTGAGCAAAACAGAGACCAATGTCTACTTTAAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGTGGCTGGGCCCCTCGGGGTCACACACTTTCTGATCCTGAGCAAAACAGAGACCAATGTCTACTTTAAGCT  296

Query  297  GATGCGCCTCCCAGGAGGCCCCACCTTGACCTTCCAGGTCAAGAAGTACTCGCTGGTGCGTGATGTGGTCTCCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGCGCCTCCCAGGAGGCCCCACCTTGACCTTCCAGGTCAAGAAGTACTCGCTGGTGCGTGATGTGGTCTCCT  370

Query  371  CACTGCGCCGGCACCGCATGCACGAGCAGCAGTTTGCCCACCCACCCCTCCTGGTACTCAACAGCTTTGGCCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACTGCGCCGGCACCGCATGCACGAGCAGCAGTTTGCCCACCCACCCCTCCTGGTACTCAACAGCTTTGGCCCC  444

Query  445  CATGGTATGCATGTGAAGCTCATGGCCACCATGTTCCAGAACCTGTTCCCCTCCATCAACGTGCACAAGGTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGGTATGCATGTGAAGCTCATGGCCACCATGTTCCAGAACCTGTTCCCCTCCATCAACGTGCACAAGGTGAA  518

Query  519  CCTGAACACCATCAAGCGCTGCCTCCTCATCGACTACAACCCCGACTCCCAGGAGCTGGACTTCCGCCACTATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  519  CCTGAACACCATCAAGCGCTGCCTCCTCATCGACTACAACCCCGACTCCCAGGAGCTGGACTTCCGCCACTA--  590

Query  593  GCATCAAAGTTGTTCCTGTGGGCGCGAGTCGCGGGATGAAGAAGCTGCTCCAGGAGAAGTTCCCCAACATGAGC  666
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  -CATCAAAGTTGTTCCTGTGGGCGCGAGTCGCGGGATGAAGAAGCTGCTCCAGGAGAAGTTCCCCAACATGAGC  663

Query  667  CGCCTGCAGGACATCAGCGAGCTGCTGGCCACGGGCGCGGGGCTGTCGGAGAGCGAGGCAGAGCCTGACGGCGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  CGCCTGCAGGACATCAGCGAGCTGCTGGCCACGGGCGCGGGGCTGTCGGAGAGCGAGGCAGAGCCTGACGGCGA  737

Query  741  CCACAACATCACAGAGCTGCCTCAGGCTGTCGCTGGCCGTGGCAACATGCGGGCCCAGCAGAGTGCAGTGCGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  CCACAACATCACAGAGCTGCCTCAGGCTGTCGCTGGCCGTGGCAACATGCGGGCCCAGCAGAGTGCAGTGCGGC  811

Query  815  TCACCGAGATCGGCCCGCGGATGACACTGCAGCTCATCAAGGTCCAGGAGGGCGTCGGGGAGGGCAAAGTGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  TCACCGAGATCGGCCCGCGGATGACACTGCAGCTCATCAAGGTCCAGGAGGGCGTCGGGGAGGGCAAAGTGATG  885

Query  889  TTCCACAGTTTTGTGAGCAAGACGGAGGAGGAGCTGCAGGCCATCCTGGAAGCCAAGGAGAAGAAGCTGCGGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  TTCCACAGTTTTGTGAGCAAGACGGAGGAGGAGCTGCAGGCCATCCTGGAAGCCAAGGAGAAGAAGCTGCGGCT  959

Query  963  GAAGGCGCAGAGGCAGGCCCAGCAGGCCCAGAATGTGCAGCGCAAGCAGGAGCAGCGGGAGGCCCACAGAAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GAAGGCGCAGAGGCAGGCCCAGCAGGCCCAGAATGTGCAGCGCAAGCAGGAGCAGCGGGAGGCCCACAGAAAGA  1033

Query 1037  AGAGCCTGGAGGGCATGAAGAAGGCACGGGTCGGGGGTAGTGATGAAGAGGCCTCTGGGATCCCTTCAAGGACG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AGAGCCTGGAGGGCATGAAGAAGGCACGGGTCGGGGGTAGTGATGAAGAGGCCTCTGGGATCCCTTCAAGGACG  1107

Query 1111  GCGAGCCTGGAGTTGGGTGAGGACGATGATGAACAGGAAGATGATGACATCGAGTATTTCTGCCAGGCGGTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GCGAGCCTGGAGTTGGGTGAGGACGATGATGAACAGGAAGATGATGACATCGAGTATTTCTGCCAGGCGGTGGG  1181

Query 1185  CGAGGCGCCCAGTGAGGACCTGTTCCCCGAGGCCAAGCAGAAACGGCTTGCCAAGTCTCCAGGGCGGAAGCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CGAGGCGCCCAGTGAGGACCTGTTCCCCGAGGCCAAGCAGAAACGGCTTGCCAAGTCTCCAGGGCGGAAGCGGA  1255

Query 1259  AGCGGTGGGAAATGGATCGAGGCAGGGGTCGCCTTTGTGACCAGAAGTTTCCCAAGACCAAGGACAAGTCCCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  AGCGGTGGGAAATGGATCGAGGCAGGGGTCGCCTTTGTGACCAGAAGTTTCCCAAGACCAAGGACAAGTCCCAG  1329

Query 1333  GGAGCCCAGGCCAGGCGGGGGCCCAGAGGGGCTTCCCGGGATGGTGGGCGAGGCCGGGGCCGGGGCCGCCCAGG  1406
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Sbjct 1330  GGAGCCCAGGCCAGGCGGGGGCCCAGAGGGGCTTCCCGGGATGGTGGGCGAGGCCGGGGCCGGGGCCGCCCAGG  1403

Query 1407  GAAGAGAGTGGCC  1419
            |||||||||||||
Sbjct 1404  GAAGAGAGTGGCC  1416