Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469698
• Subject: XM_006540567.3
• Aligned Length: 954
• Identities: 729
• Gaps: 132

Alignment

Query   1  ATGTTACACCATCATTGTCGAAGGAACCCTGAGCTCCAGGAAGAGTTGCAGATTCAGGCCGCGGTGGCTGCTGG  74
           |||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct   1  ATGTTACACCACCACTGCCGGAGGAACCCTGAGCTTCAGGAAGAGTTGCAGATTCAGGCTGCAGTGGCAGCCGG  74

Query  75  GGATGTCCACACAGTGCGAAAGATGCTAGAACAAGGCTATTCCCCGAATGGCCGAGATGCGAATGGCTGGACTC  148
           ||||||.||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||..
Sbjct  75  GGATGTTCACACAGTACGAAAGATGTTGGAACAAGGCTATTCCCCAAATGGCCGAGATGCCAATGGCTGGACCT  148

Query 149  TGCTTCATTTCTCTGCAGCAAGAGGAAAGGAAAGATGTGTTCGGGTTTTTCTAGAACACGGAGCTGATCCTACA  222
           ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 149  TGCTCCATTTCTCTGCAGCAAGAGGAAAGGAGAGGTGTGTTCGAGTGTTTCTGGAACACGGAGCTGATCCCACG  222

Query 223  GTTAAAGACTTAATCGGAGGCTTCACGGCTCTTCACTATGCAGCCATGCATGGCCGGGCCCGCATTGCACGCTT  296
           |||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 223  GTTAAGGATTTAATCGGAGGCTTCACTGCTCTGCATTACGCTGCCATGCACGGCCGGGCCCGGATTGCACGCCT  296

Query 297  GATGTTAGAATCTGAATACAGGAGCGACATCATTAATGCAAAAAGCAATGACGGCTGGACTCCCCTCCATGTGG  370
           |||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GATGTTAGAGTCTGAGTACAGGAGTGACATTATTAATGCAAAAAGCAATGATGGCTGGACTCCCCTCCATGTGG  370

Query 371  CTGCCCACTACGGCAGGGACTCATTTGTCCGGCTCCTCCTGGAGTTCAAGGCTGAGGTTGACCCACTCAGTGAT  444
           |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 371  CTGCCCACTACGGTAGGGACTCATTTGTCCGGCTCCTCCTGGAGTTCAAGGCTGAAGTTGACCCGCTCAGTGAT  444

Query 445  AAAGGTACCACACCGCTTCAGCTCGCCATTATCCGAGAGAGGTCAAGCTGTGTGAAAATCCTCCTGGACCACAA  518
           ||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 445  AAAGGTACAACGCCACTTCAGCTTGCCATCATCCGAGAGCGGTCAAGCTGTGTGAAGATCCTTCTGGACCACAA  518

Query 519  TGCCAACATCGACATTCAGAATGGTTTCCTGTTGCGATACGCCGTGATCAAAAGCAATCACTCTTATTGCCGAA  592
           .||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 519  CGCCAACATCGACATCCAGAACGGATTCCTGCTGCGCTATGCTGTGATCAAAAGCAATCACTCTTACTGCCGCA  592

Query 593  TGTTCCTTCAGAGAGGGGCAGACACAAACTTGGGTCGCTTAGAAGACGGACAGACTCCTTTACACTTATCTGCC  666
           ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 593  TGTTTCTTCAGAGAGGAGCAGACACAAACTTAGGGCGTCTAGAAGACGGACAGACTCCTTTGCACTTGTCTGCC  666

Query 667  CTTAGGGATGATGTGCTGTGTGCACGGATGTTATATAATTACGGAGCAGACACGAACACACGGAACTATGAAGG  740
           ||..|.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 667  CTCCGTGATGACGTGCTCTGCGCACGGATGCTGTATAACTATGGAGCGGACACGAACACAAGGAACTATGAAGG  740

Query 741  ACAGACCCCATTGGCTGTTTCAATAAGTATTTCTGGAAGTAGTCGACCATGTTTGGATTTCTTACAAGAAGTCA  814
           .|||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741  TCAGACTCCACTGGCCGTTTCCATAAGTATTTCAGGAAGTAGTCGGCCGTGTTTGGATTTCTTACAAGACGTCA  814

Query 815  CAAGTATG------------------------------------------------------------------  822
           ||||...|                                                                  
Sbjct 815  CAAGACAGCCCAGAACCCTGCAGGACCTGTGCCGAATTAAAATTCGACAGTGTATAGGCCTTCAAAACCTGAAG  888

Query 823  ------------------------------------------------------------------  822
                                                                             
Sbjct 889  CTGCTTGATGAGCTACCAATTGCCAAGGTCATGAAAGACTACTTAAAACACAAATTTGATGATATC  954