Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469727
• Subject: XM_011520587.2
• Aligned Length: 883
• Identities: 779
• Gaps: 95

Alignment

Query   1  ATGATTGGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTG---TTTGG------TGATTCAAAGAAACT-TACAGCAC  64
                     |||    ||.||          ||||   |||||      .|||   ||||||.| |..||   
Sbjct   1  ----------ATG----AGCTT----------TTTGGATTTTGGAACTGTGGAT---AAGAAATTGTGGAG---  44

Query  65  ACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGT  138
                |||||.|..||||                      |||                            |||
Sbjct  45  -----AACTATATACAGA----------------------GAT----------------------------AGT  63

Query 139  TCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGA  212
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  64  TCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGA  137

Query 213  CAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCC  286
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 138  CAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCC  211

Query 287  TTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCT  360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212  TTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCT  285

Query 361  CCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACC  434
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286  CCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACC  359

Query 435  GAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTG  508
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360  GAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTG  433

Query 509  AATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACA  582
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434  AATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACA  507

Query 583  ATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCT  656
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508  ATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCT  581

Query 657  TAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTG  730
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582  TAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTG  655

Query 731  CACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGG  804
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656  CACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGG  729

Query 805  TCTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA  873
           .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730  ACTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA  798