Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469733
• Subject: XM_024446676.1
• Aligned Length: 1485
• Identities: 1359
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ----------------ATGGATGGATTTTATGACCAGCA--AG-------------------------------  25
                            |||||.||          |||||  ||                               
Sbjct    1  ATGAGTGGAAGAGGAGATGGAGGG----------CAGCAGCAGCTGCTGCACTCAAAGTTTTTGGCTGGGTTTG  64

Query   26  --TGCCTTACATGGTCACCAAT---AGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAAACCAACAAATGTCAGGAAAA  94
              ||||  ||||.|..|..|||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  TCTGCC--ACATTGAAAAGAATGAAAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAAACCAACAAATGTCAGGAAAA  136

Query   95  GAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTAAGTCAATTACAGGAAACA  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  GAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTAAGTCAATTACAGGAAACA  210

Query  169  TGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTT  242
            |||||||||||||                                                      |||||||
Sbjct  211  TGGCTTGCAGAAG------------------------------------------------------TGGCTTT  230

Query  243  TCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAG  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  231  TCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAG  304

Query  317  AACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTG  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305  AACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTG  378

Query  391  GGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTC  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  379  GGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTC  452

Query  465  AACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCT  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  453  AACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCT  526

Query  539  ACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCA  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  527  ACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCA  600

Query  613  AGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCA  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  AGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCA  674

Query  687  GGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTC  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  675  GGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTC  748

Query  761  TGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGG  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  TGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGG  822

Query  835  CAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGA  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  CAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGA  896

Query  909  TGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCA  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  TGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCA  970

Query  983  CATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCAT  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  CATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCAT  1044

Query 1057  TTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCAT  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  TTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCAT  1118

Query 1131  TCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTA  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  TCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTA  1192

Query 1205  TGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTT  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193  TGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTT  1266

Query 1279  CCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTC  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  CCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTC  1340

Query 1353  TCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACG  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  TCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACG  1414

Query 1427  TGTAT  1431
            |||||
Sbjct 1415  TGTAT  1419