Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469743
• Subject: NM_138580.2
• Aligned Length: 1143
• Identities: 972
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74
            ||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGTTGGTGATACCTCCGGGGCTGAGTGAAGAGGAAGAGGCACTGCAGAAGAAGTTCAACAAACTCAAGAAGAA  74

Query   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||.||.|.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAGAGCAGCAGCGGCCCAGCGAGCCAGGGCGGTGTCAAACGCTCAC  148

Query  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222
            |.||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCAGAGCAGCCTGTGGTGGACACTGCCACAGCAACAGAACAGGCCAAACAACTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222

Query  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGCCATCAAGGCTGAAACTAAGAACTCAGGCTTCAAACGTTCTCGGACCCTGGAAGGGAAGTTAAAGGACCC  296

Query  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370
            .||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||.|||
Sbjct  297  AGAGAAGGGGCCTGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATGTCTGCTGATGAGGACCTACAGGAGCCAT  370

Query  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGCTTTGTGTCTTCTAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||.|
Sbjct  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAAAGCTTTGTGTCTTCTAGTGATCGGCTTCGGGAACTGGGACAA  444

Query  445  GATGGAGAAGAGGCAGAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACG  518
            |||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||.||||||||||  |
Sbjct  445  GATGGAGAAGAAGCAGAGGCCCCCGGGGCTGGTGATGGCCCACCTCGAGGCTTTGACTGGAGCTATGAAGA--G  516

Query  519  CAGTGGT---GCCCACTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGG  589
            || ||||   ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||      ||||| 
Sbjct  517  CA-TGGTAGCGCCCGCTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCAGGGACCGAAGTCATG------ACCGG-  582

Query  590  ACAGAGACCGAGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGAT  663
              ||   |||||||.||||.|||||...|||..|.||..|||||.||||..||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  583  --AG---CCGAGATAGGGATCGGGACAAAGAGAGAGACAGAGACCGAGATCGAGATCGAGACAGAGACCGGGAT  651

Query  664  CGGGATCGAGATCGAGACCGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTT  737
            ...||...|||..||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  652  AAAGACAAAGACAGAGACCGGGATCGAGACAGAGACCGGGACCGAGATCGGGAACGAGACCGAGAGGGCCCTTT  725

Query  738  CCGCAGGTCGGATTCATTCCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACA  811
            |||||||||.||.||||||||.||||||.|.||||||.|.||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  726  CCGCAGGTCAGACTCATTCCCCGAACGGAGGGCCCCTCGAAAGGGGAACACACTGTATGTGTATGGAGAGGACA  799

Query  812  TGACACCCACCCTTCTCCGTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGA  885
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  TGACGCCCACCCTCCTCCGCGGGGCCTTCTCTCCCTTTGGAAATATCATCGACCTCTCCATGGACCCACCCAGA  873

Query  886  AACTGTGCCTTCGTCACCTATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGT  959
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  874  AACTGTGCCTTCGTCACCTACGAGAAGATGGAGTCTGCAGATCAGGCTGTTGCTGAGCTCAATGGGACCCAGGT  947

Query  960  GGAGTCTGTACAGCTCAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCT  1033
            |||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  948  GGAATCTGTGCAGCTTAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGACGCTGCTACTGGCAAATCTGTCT  1021

Query 1034  GGGGCTCCCTCGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGAT  1107
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1022  GGGGCTCCCTTGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCATCGAGACAAGAGGACCCAGATTGTGTACAGTGAC  1095

Query 1108  GACGTCTACAAGGAAAACCTTGTGGATGGCTTC  1140
            ||  ||||                         
Sbjct 1096  GA--TCTA-------------------------  1101