Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469743
• Subject: XM_006715205.3
• Aligned Length: 1140
• Identities: 1125
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74

Query   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148

Query  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222

Query  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296

Query  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370

Query  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGCTTTGTGTCTTCTAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAG---------------AGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCA  429

Query  445  GATGGAGAAGAGGCAGAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  GATGGAGAAGAGGCAGAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACG  503

Query  519  CAGTGGTGCCCACTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  CAGTGGTGCCCACTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA  577

Query  593  GAGACCGAGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGATCGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  GAGACCGAGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGATCGG  651

Query  667  GATCGAGATCGAGACCGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTTCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  GATCGAGATCGAGACCGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTTCCG  725

Query  741  CAGGTCGGATTCATTCCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  CAGGTCGGATTCATTCCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGA  799

Query  815  CACCCACCCTTCTCCGTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  CACCCACCCTTCTCCGTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAAC  873

Query  889  TGTGCCTTCGTCACCTATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  874  TGTGCCTTCGTCACCTATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGA  947

Query  963  GTCTGTACAGCTCAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948  GTCTGTACAGCTCAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGG  1021

Query 1037  GCTCCCTCGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  GCTCCCTCGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGAC  1095

Query 1111  GTCTACAAGGAAAACCTTGTGGATGGCTTC  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096  GTCTACAAGGAAAACCTTGTGGATGGCTTC  1125