Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469748
- Subject:
- NM_008149.3
- Aligned Length:
- 2493
- Identities:
- 2109
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGGATGAATATGCACTGACCCTTGGTACAATAGATGTTTCTTATCTGCCACA-TTCATCAGAATACAGTGTTG 73
|||||.||.|.|.||.||||..||||.||||||||.|||||||||||||| || ||||||.||||||||..|||
Sbjct 1 ATGGAGGAGTCTTCAGTGACAGTTGGCACAATAGACGTTTCTTATCTGCC-CAGTTCATCGGAATACAGCCTTG 73
Query 74 GTCGATGTAAGCACACAAGTGAGGAATGGGGTGAGTGTGGCTTTAGACCCACCATCTTCAGATCTGCAACTTTA 147
|.||||||||.|||||.||||||||.||||.|||.|||||.||.|.|||.|||.||||||||||||||||..|.
Sbjct 74 GCCGATGTAAACACACCAGTGAGGACTGGGTTGACTGTGGGTTCAAACCTACCTTCTTCAGATCTGCAACACTG 147
Query 148 AAATGGAAAGAAAGCCTAATGAGTCGGAAAAGGCCATTTGTTGGAAGATGTTGTTACTCCTGCACTCCCCAGAG 221
||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 148 AAATGGAAGGAGAGCCTTATGAGCCGGAAGAGGCCCTTCGTGGGAAGGTGCTGCTATTCCTGCACGCCACAGAG 221
Query 222 CTGGGACAAATTTTTCAACACCAGTATCCCGTCTTTGGGTTTGCGGAATGTTATTTATATCAATGAAACTCACA 295
||||||.|..|||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 222 CTGGGAAAGGTTTTTCAACCCCAGTATCCCATCTCTGGGTTTGCGGAATGTTATTTATATCAATGAAACGCACA 295
Query 296 CAAGACACCGCGGATGGCTTGCAAGACGCCTTTCTTACGTTCTTTTTATTCAAGAGCGAGATGTGCATAAGGGC 369
||||.|||.|.||||||||.||.|||||.||.||||||.|.||||||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 296 CAAGGCACAGAGGATGGCTGGCGAGACGGCTGTCTTACATCCTTTTTGTTCAAGAGCGAGACGTCCATAAGGGC 369
Query 370 ATGTTTGCCACCAATGTGACTGAAAATGTGCTGAACAGCAGTAGAGTACAAGAGGCAATTGCAGAAGTGGCTGC 443
|||||||||||||.|||.|||||.|||||.||||.||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 370 ATGTTTGCCACCAGTGTTACTGAGAATGTACTGAGCAGCAGCAGAGTCCAAGAGGCAATTGCTGAAGTGGCTGC 443
Query 444 TGAATTAAACCCTGATGGTTCTGCCCAGCAGCAATCAAAAGCCGTTAACAAAGTGAAAAAGAAAGCTAAAAGGA 517
.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||.|..|.||.|||||||.||||||.|..|.||
Sbjct 444 GGAGTTGAACCCAGATGGATCTGCCCAGCAGCAGTCCAAAGCCATCCAGAAGGTGAAAAGGAAAGCCAGGAAGA 517
Query 518 TTCTTCAAGAAATGGTTGCCACTGTCTCACCGGCAATGATCAGACTGACTGGGTGGGTGCTGCTAAAACTGTTC 591
|.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.|..||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.||.|||
Sbjct 518 TCCTCCAGGAGATGGTCGCCACCGTCTCCCCAGGGATGATCAGGCTGACTGGCTGGGTGTTACTAAAGCTCTTC 591
Query 592 AACAGCTTCTTTTGGAACATTCAAATTCACAAAGGTCAACTTGAGATGGTTAAAGCTGCAACTGAGACGAATTT 665
|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||..|
Sbjct 592 AACAGCTTCTTCTGGAACATTCAGATTCACAAGGGTCAACTCGAGATGGTCAAGGCTGCAACTGAGACGAACCT 665
Query 666 GCCGCTTCTGTTTCTACCAGTTCATAGATCCCATATTGACTATCTGCTGCTCACTTTCATTCTCTTCTGCCATA 739
||||||..|||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 666 GCCGCTCTTGTTTCTGCCGGTGCACAGATCCCACATTGACTACCTGTTGCTCACCTTCATCCTCTTTTGCCACA 739
Query 740 ACATCAAAGCACCATACATTGCTTCAGGCAATAATCTCAACATCCCAATCTTCAGTACCTTGATCCATAAGCTT 813
|||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 740 ACATCAAGGCGCCGTACATCGCCTCGGGCAATAATCTCAACATCCCCGTCTTCAGTACCTTGATTCACAAGCTT 813
Query 814 GGGGGCTTCTTCATACGACGAAGGCTCGATGAAACACCAGATGGACGGAAAGATGTTCTCTATAGAGCTTTGCT 887
||||||||.||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||||
Sbjct 814 GGGGGCTTTTTCATAAGACGGAGGCTCGATGAAACCCCAGATGGACGCAAAGACATTCTGTACAGAGCGTTGCT 887
Query 888 CCATGGGCATATAGTTGAATTACTTCGACAGCAGCAATTCTTGGAGATCTTCCTGGAAGGCACACGTTCTAGGA 961
||||||||||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||..|.|
Sbjct 888 CCATGGGCATGTAGTTGAACTCCTCCGACAGCAGCAGTTCCTGGAGATCTTCCTGGAAGGCACCCGCTCCCGCA 961
Query 962 GTGGAAAAACCTCTTGTGCTCGGGCAGGACTTTTGTCAGTTGTGGTAGATACTCTGTCTACCAATGTCATCCCA 1035
||||.||.|||||.|||||.||||||||.||..|.|||||.||.||.|||||||||||..||||...||||||.
Sbjct 962 GTGGCAAGACCTCCTGTGCCCGGGCAGGGCTCCTCTCAGTGGTAGTGGATACTCTGTCGTCCAACACCATCCCC 1035
Query 1036 GACATCTTGATAATACCTGTTGGAATCTCCTATGATCGCATTATCGAAGGTCACTACAATGGTGAACAACTGGG 1109
||||||.|..|.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||
Sbjct 1036 GACATCCTCGTCATACCCGTGGGCATCTCGTATGATCGCATAATCGAAGGTCACTACAATGGCGAACAGTTGGG 1109
Query 1110 CAAACCTAAGAAGAATGAGAGCCTGTGGAGTGTAGCAAGAGGTGTTATTAGAATGTTACGAAAAAACTATGGTT 1183
.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||.|.||.||||||||.||.|
Sbjct 1110 AAAGCCCAAGAAGAACGAGAGCCTCTGGAGTGTGGCGAGAGGCGTTATCAGAATGCTGCGGAAAAACTACGGCT 1183
Query 1184 GTGTCCGAGTGGATTTTGCACAGCCATTTTCCTTAAAGGAATATTTAGAAAGCCAAAGTCAGAAACCGGTGTCT 1257
..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1184 ACGTCCGAGTGGATTTTGCACAGCCATTTTCCTTGAAGGAATATTTAGAAGGCCAGAGTCAGAAACCTGTATCT 1257
Query 1258 GCTCTACTTTCCCTGGAGCAAGCGTTGTTACCAGCTATACTTCCTTCAAGACCCAGTGATGCTGCTGATGAAGG 1331
||.|..|||||.|||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|.|||||.||||||||||..
Sbjct 1258 GCCCCCCTTTCTCTGGAGCAAGCACTGTTACCAGCGATCCTTCCTTCAAGACCGAATGATGTTGCTGATGAACA 1331
Query 1332 TAGAGACACGTCCATTAATGAGTCCAGAAATGCAACAGATGAATCCCTACGAAGGAGGTTGATTGCAAATCTGG 1405
|..||||...||||.|||.|||||||||||..||.||||.|||.||.|.|||.|.|||.||||||||||.||||
Sbjct 1332 TCAAGACCTATCCAGTAACGAGTCCAGAAACCCAGCAGACGAAGCCTTCCGACGAAGGCTGATTGCAAACCTGG 1405
Query 1406 CTGAGCATATTCTATTCACTGCTAGCAAGTCCTGTGCCATTATGTCCACACACATTGTGGCTTGCCTGCTCCTC 1479
|||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1406 CTGAGCACATTCTCTTCACCGCCAGCAAGTCCTGCGCTATCATGTCCACCCACATTGTGGCCTGTCTGCTCCTC 1479
Query 1480 TACAGACACAGGCAGGGAATTGATCTCTCCACATTGGTCGAAGACTTCTTTGTGATGAAAGAGGAAGTCCTGGC 1553
||||||||||||||||||||..||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1480 TACAGACACAGGCAGGGAATCCATCTCTCCACGCTTGTGGAAGACTTCTTTGTGATGAAGGAGGAAGTCCTAGC 1553
Query 1554 TCGTGATTTTGACCTGGGGTTCTCAGGAAATTCAGAAGATGTAGTAATGCATGCCATACAGCTGCTGGGAAATT 1627
|||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1554 TCGCGATTTCGACCTAGGCTTCTCCGGGAATTCAGAAGATGTCGTCATGCATGCTATTCAGCTTCTGGGGAACT 1627
Query 1628 GTGTCACAATCACCCACACTAGCAGGAACGATGAGTTTTTTATCACCCCCAGCACAACTGTCCCATCAGTCTTC 1701
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1628 GTGTCACAATCACCCACACGAGCAGGAAAGATGAGTTTTTTATTACTCCCAGCACAACTGTCCCGTCAGTCTTT 1701
Query 1702 GAACTCAACTTCTACAGCAATGGGGTACTTCATGTCTTTATCATGGAGGCCATCATAGCTTGCAGCCTTTATGC 1775
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 1702 GAACTCAACTTCTACAGCAATGGCGTACTTCATGTGTTCATCATGGAAGCCATCATAGCTTGCAGCATCTATGC 1775
Query 1776 AGTTCTGAACAAGAGG-GGACTGGGGGGTCCCACT--AGCACCCCACCT----AACCTGATCAGCCAGGAGCAG 1842
|||.|||||.|||||| |..||||.|||| ||.|| || .||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 AGTCCTGAATAAGAGGTGCTCTGGAGGGT-CCGCTGGAG------GCCTCGGCAACCTGATCAGCCAGGAGCAG 1842
Query 1843 CTGGTGCGGAAGGCGGCCAGCCTGTGCTACCTTCTCTCCAATGAAGGCACCATCTCACTGCCTTGCCAGACATT 1916
||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1843 CTGGTGAGGAAGGCCGCCAGCCTGTGCTACCTTCTCTCTAACGAAGGTACCATTTCTCTGCCCTGCCAGACTTT 1916
Query 1917 TTACCAAGTCTGCCATGAAACAGTAGGAAAGTTTATCCAGTATGGCATTCTTACAGTGGCAGAGCACGATGACC 1990
|||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1917 TTACCAAGTTTGTCATGAGACAGTTGGCAAGTTCATCCAGTATGGCATTCTCACAGTGGCAGAGCAAGATGACC 1990
Query 1991 AGGAAGATATCAGTCCTAGTCTTGCTGAGCAGCAGTGGGACAAGAAGCTTCCAGAACCTTTGTCTTGGAGAAGT 2064
||||||||.||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||| ||...|||||||||
Sbjct 1991 AGGAAGATGTCAGTCCTGGCCTTGCAGAACAGCAGTGGGACAAGAAGCTTCCGGAAC---TGAACTGGAGAAGT 2061
Query 2065 GATGAAGAAGATGAAGACAGTGACTTTGGGGAGGAACAGCGAGATTGCTACCTGAAGGTGAGCCAATCCAAGGA 2138
||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2062 GACGAGGAAGATGAAGACAGTGACTTTGGTGAGGAGCAGCGAGATTGCTATCTCAAGGTGAGCCAGTCCAAGGA 2135
Query 2139 GCACCAGCAGTTTATCACC-TTCTTACAGAGACTCCTTGGGCCTTTGCTGGAGGCCTACAGCTCTGCTGCCATC 2211
|||||||||.||.|||||| ||||| |||||.||.||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2136 GCACCAGCAATTCATCACCTTTCTT-CAGAGGCTTCTAGGTCCCCTGCTAGAAGCCTACAGCTCTGCTGCCATC 2208
Query 2212 TTTGTTCACAACTTCAGTGGTCCTGTTCCAGAACCTGAGTATCTGCAAAAGTTGCACAAATACCTAATAACCAG 2285
|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||..|||||||.|||||.||..||||||..|||||.||.|||||
Sbjct 2209 TTTGTCCACAACTTCAGCGGTCCAGTTCCCGAGTCTGAGTACCTGCAGAAACTGCACAGGTACCTTATCACCAG 2282
Query 2286 AACAGAAAGAAATGTTGCAGTATATGCTGAGAGTGCCACATATTGTCTTGTGAAGAATGCTGTGAAAATGTTTA 2359
.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2283 GACGGAAAGGAACGTTGCCGTGTACGCTGAGAGTGCCACATACTGTCTCGTGAAGAACGCTGTGAAAATGTTTA 2356
Query 2360 AGGATATTGGGGTTTTCAAGGAGACCAAACAAAAGAGAGTGTCTGTTTTAGAACTGAGCAGCACTTTTCTACCT 2433
||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2357 AGGACATCGGGGTTTTCAAAGAGACCAAGCAAAAGCGAGTGTCTGTTCTAGAACTGAGCAGTACTTTCCTACCT 2430
Query 2434 CAATGCAACCGACAAAAACTTCTAGAATATATTCTGAGTTTTGTGGTGCTG 2484
||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431 CAGTGCAACCGGCAGAAACTCCTAGAGTATATTCTGAGTTTTGTGGTGCTG 2481