Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469771
- Subject:
- NM_175164.4
- Aligned Length:
- 2442
- Identities:
- 2061
- Gaps:
- 165
Alignment
Query 1 ATGGGGCTCCCAGCGCTCGAGTTCAGCGACTGCTGCCTCGATAGTCCGCACTTCCGAGAGACGCTCAAGTCGCA 74
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGGGGCTCCCGGCGCTCGAGTTCAGCGACTGCTGCCTCGACAGCCCTCACTTCCGAGAGACGCTCAAGTCACA 74
Query 75 CGAAGCAGAGCTGGACAAGACCAACAAATTCATCAAGGAGCTCATCAAGGACGGGAAGTCACTCATAAGCGCGC 148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 75 CGAAGCGGAGCTGGACAAGACCAACAAATTCATCAAGGAGCTCATCAAGGACGGGAAGTCGCTCATCAGCGCGC 148
Query 149 TCAAGAATTTGTCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGAT 222
||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TCAAGAATTTGTCTTCGGCAAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGTATAGGAGAT 222
Query 223 GCAGAAACAGATGATGAGATGTGTATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGA 296
||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCGAAACAGATGATGAGATGTGTATAGCGAGATCTTTGCAAGAATTTGCTGCTGTTCTCAGGAATCTTGAAGA 296
Query 297 TGAACGGATACGGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGA 370
.||.||||..||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 CGAGCGGAGTCGAATGATCGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACACCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAGCAGA 370
Query 371 TCGGGGCTGCCAAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACAC 444
|.|||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||.||||||||||||.
Sbjct 371 TTGGGGCCGCCAGGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACCGAGAAGTACTGCGGCACCTTAGAAAAACAT 444
Query 445 TTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCA 518
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 445 TTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAGGAATCCCAGCTACAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTTCGGCAACA 518
Query 519 TTTCTATGAAGTATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGG 592
||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TTTCTACGAAGTATCCCTGGAGTATGTCTTTAAGGTGCAGGAAGTGCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTAG 592
Query 593 AGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct 593 AGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTATGAGCTGGCCAAGGATTTTGGT 666
Query 667 GACTTCAAGACACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGA 740
|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 667 GACTTTAAGACACAGTTGACCATCAGCATACAAAATACAAGAAACCGCTTTGAAGGAACCAGGTCTGAGGTGGA 740
Query 741 ATCACTGATGAAAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACC 814
|||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 741 ATCGCTGATGAAGAAGATGAAGGAAAACCCCCTGGAGCACAAGACCATCAGCCCGTACACCATGGAAGGGTACC 814
Query 815 TCTACGTGCAGGAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAA 888
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 815 TGTACGTGCAGGAGAAGCGTCACTTTGGAACTTCCTGGGTGAAGCACTACTGTACCTACCAACGGGATTCCAAA 888
Query 889 CAAATCACCATGGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATC 962
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||
Sbjct 889 CAAATCACCATGGTTCCATTCGACCAAAAGTCAGGAGGAAAGGGGGGAGAAGACGAGTCCGTTACCCTCAAATC 962
Query 963 CTGCACACGGCGGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGG 1036
||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGCACACGGCGAAAGACAGACTCCATCGAGAAGCGATTCTGCTTTGACGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGG 1036
Query 1037 TTATCACCATGCAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTC 1110
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 TTATCACCATGCAGGCGTTGTCGGAAGAGGACCGTAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTG 1110
Query 1111 TACAACTCGAACAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAA 1184
||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 TACAACTCCAACAGAGACAGCCAGAGCGAAGGGACCGCACAATTGGACAGTATCGGCTTCAGCATAATAAGGAA 1184
Query 1185 ATGCATCCATGCTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAG 1258
||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 ATGCATCCATGCGGTGGAGACCAGAGGGATCAATGAGCAGGGGCTCTACCGAATCGTGGGGGTCAACTCCAGGG 1258
Query 1259 TGCAGAAGTTGCTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGG 1332
||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259 TGCAGAAGTTGCTGAGCGTCCTGATGGACCCCAAAGCAGCTTCTGAGACAGAAACTGATATCTGTGCCGAATGG 1332
Query 1333 GAGATAAAGACCATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTT 1406
||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGATAAAGACCGTCACCAGTGCTCTGAAGACCTACCTGAGAATGCTCCCAGGACCCCTCATGATGTACCAGTT 1406
Query 1407 TCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTC 1480
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||.||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1407 TCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAGCTGGAAAACCAAGAGACTCGAGTGTCTGAGATCCACAGTCTTGTCC 1480
Query 1481 ATCGGCTCCCAGAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCAC 1554
||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATCGGCTCCCGGAGAAGAATCGGCAGATGTTGCAGCTGCTCATGAACCACCTGGCCAATGTTGCTAACAACCAC 1554
Query 1555 AAGCAGAATTTGATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAAC 1628
|||||||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..||||..||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAGCAGAATCTGATGACTGTGGCAAACCTGGGCGTGGTGTTTGGACCCACCTTGCTTCGGCCTCAGGAAGAAAC 1628
Query 1629 AGTAGCAGCCATCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATAT 1702
.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1629 TGTGGCGGCCATCATGGACATCAAGTTTCAGAACATTGTCATCGAGATCTTAATCGAGAACCATGAGAAGATAT 1702
Query 1703 TTAACACCGTGCCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAG 1776
|.|||||.|||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703 TCAACACGGTGCCTGATGTGCCCCTCACCAACGCCCAGCTACACCTGTCCCGGAAGAAAAGCAGTGACTCCAAG 1776
Query 1777 CCCCCGTCCTGCAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAA 1850
|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||..|.||.|..||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1777 CCCCCATCCTGCAGCAAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCATGCTGTGCCATCCACAGAAAAACAGGAGCAGAGGAA 1850
Query 1851 CAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTAC 1924
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.|.||||||||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct 1851 CAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCGGTCTCCTCGAGTGCAAACAGCATCCTTAACTCTAGCAGCAGCCTGC 1924
Query 1925 AGCCCAACATGAACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAAT 1998
|||||||..||||.|||||.|||.||.||||||.||||||||||||.|..|||||||..|||||||||||||||
Sbjct 1925 AGCCCAATCTGAATTCCAGCGACTCAAACCTGGATGTGGTCAAACCTAGTCGGCCCAGTTCACTCCCCCCGAAT 1998
Query 1999 CCAAGCCCAACTTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATC 2072
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCAAGCCCAACTTCACCCCTCTCGCCATCATGGCCCATGTTCTCGGCACCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATC 2072
Query 2073 CACGTCCAGCGACTCATCCCCCGT-------------------------------------------------- 2096
||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2073 CACGTCCAGCGACTCATCCCCCATCAGGTCTGTGGCAGGGTTTGTTTGGTTTTCTGTTGCTGCCGTTGTTCTCT 2146
Query 2097 -------------------------------------------------------------------------- 2096
Sbjct 2147 CATTGGCTTGGTCCTCTCTTCATGCAGTGTTCAGCCTCCTCGTCAACTTTGTTCCCTGCCATCCAAACCTGCAC 2220
Query 2097 -----------------------------------------CAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTA 2129
|||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2221 TTGCTTTTTGACAGGCCAGAAGAAGCGGTCCGTGAAGACTCCAGCACACCATTCCGGAAGGCAAAGGCTTTGTA 2294
Query 2130 TGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAATGTTCACCCATCTC 2203
.||||||.|||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2295 CGCCTGCCAAGCTGAGCACGACTCGGAGCTCTCCTTCACAGCGGGCACCGTCTTCGATAATGTTCATCCATCTC 2368
Query 2204 AGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAACGGAAAGACTGGCCTCATCCCTGAGAATTACGTGGAGTTCCTC 2277
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 2369 AGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAATGGAAAGACTGGCCTCATCCCAGAGAACTACGTGGAATTCCTC 2442