Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469771
- Subject:
- XM_005268398.5
- Aligned Length:
- 2444
- Identities:
- 2158
- Gaps:
- 277
Alignment
Query 1 ATGGGGC--TCCCAGCGCTCGAGTTCAGCGACTGCTGCCTCGATAGTCCGCACTTCCGAGAGACGCTCAAGTCG 72
||||.|| .|||.|| |||| |.|.| |||||||| |.|||
Sbjct 1 ATGGAGCGTGCCCTGC---CGAG----GGGGC-GCTGCCTC---------CCCTT------------------- 38
Query 73 CACGAAGCAGAGCTGGACAAGACCAACAAATTCATCAAGGAGCTCATCAAGGACGGGAAGTCACTCATAAGCGC 146
||||| |||
Sbjct 39 ------------------------------------------------------GGGAA---------AAG--- 46
Query 147 GCTCAAGAATTTGTCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAG 220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 --------ATTTGTCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAG 112
Query 221 ATGCAGAAACAGATGATGAGATGTGTATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAA 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 ATGCAGAAACAGATGATGAGATGTGTATAGCAAGATCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAA 186
Query 295 GATGAACGGATACGGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACA 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 GATGAACGGATACGGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACA 260
Query 369 GATCGGGGCTGCCAAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAAC 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GATCGGGGCTGCCAAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAAC 334
Query 443 ACTTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAG 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 ACTTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAG 408
Query 517 CATTTCTATGAAGTATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGT 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 CATTTCTATGAAGTATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGT 482
Query 591 GGAGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCG 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 GGAGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCG 556
Query 665 GGGACTTCAAGACACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTG 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 GGGACTTCAAGACACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTG 630
Query 739 GAATCACTGATGAAAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATA 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 GAATCACTGATGAAAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATA 704
Query 813 CCTCTACGTGCAGGAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCA 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 CCTCTACGTGCAGGAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCA 778
Query 887 AACAAATCACCATGGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AACAAATCACCATGGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAA 852
Query 961 TCCTGCACACGGCGGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGG 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 TCCTGCACACGGCGGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGG 926
Query 1035 GGTTATCACCATGCAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 GGTTATCACCATGCAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTG 1000
Query 1109 TCTACAACTCGAACAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGG 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 TCTACAACTCGAACAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGG 1074
Query 1183 AAATGCATCCATGCTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAG 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1075 AAATGCATCCATGCTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGTGTCAACTCCAG 1148
Query 1257 AGTGCAGAAGTTGCTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAAT 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 AGTGCAGAAGTTGCTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAAT 1222
Query 1331 GGGAGATAAAGACCATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 GGGAGATAAAGACCATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAG 1296
Query 1405 TTTCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 TTTCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGT 1370
Query 1479 TCATCGGCTCCCAGAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACC 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 TCATCGGCTCCCAGAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACC 1444
Query 1553 ACAAGCAGAATTTGATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAA 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 ACAAGCAGAATTTGATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAA 1518
Query 1627 ACAGTAGCAGCCATCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGAT 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 ACAGTAGCAGCCATCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGAT 1592
Query 1701 ATTTAACACCGTGCCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCA 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 ATTTAACACCGTGCCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCA 1666
Query 1775 AGCCCCCGTCCTGCAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGG 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 AGCCCCCGTCCTGCAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGG 1740
Query 1849 AACAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTT 1922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AACAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTT 1814
Query 1923 ACAGCCCAACATGAACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGA 1996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 ACAGCCCAACATGAACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGA 1888
Query 1997 ATCCAAGCCCAACTTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCA 2070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1889 ATCCAAGCCCAACTTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCA 1962
Query 2071 TCCACGTCCAGCGACTCATCCCCCGT------------------------------------------------ 2096
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 TCCACGTCCAGCGACTCATCCCCCGTCAGGTCTGTTGCAGGGTTTGTTTGGTTTTCTGTTGCTGCCGTTGTTCT 2036
Query 2097 -------------------------------------------------------------------------- 2096
Sbjct 2037 CTCATTGGCTCGGTCCTCTCTTCATGCAGTGTTCAGCCTCCTCGTCAACTTTGTTCCCTGCCATCCAAACCTGC 2110
Query 2097 -------------------------------------------CAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTG 2127
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 ACTTGCTTTTTGACAGGCCAGAAGAAGCGGTACATGAAGACTCCAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTG 2184
Query 2128 TATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAATGTTCACCCATC 2201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2185 TATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAACGTTCACCCATC 2258
Query 2202 TCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAACGGAAAGACTGGCCTCATCCCTGAGAATTACGTGGAGTTCC 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2259 TCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAACGGAAAGACTGGCCTCATCCCTGAGAATTACGTGGAGTTCC 2332
Query 2276 TC 2277
||
Sbjct 2333 TC 2334