Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469771
• Subject: XM_006526269.3
• Aligned Length: 2277
• Identities: 1953
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCCAGCGCTCGAGTTCAGCGACTGCTGCCTCGATAGTCCGCACTTCCGAGAGACGCTCAAGTCGCA  74
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGGGCTCCCGGCGCTCGAGTTCAGCGACTGCTGCCTCGACAGCCCTCACTTCCGAGAGACGCTCAAGTCACA  74

Query   75  CGAAGCAGAGCTGGACAAGACCAACAAATTCATCAAGGAGCTCATCAAGGACGGGAAGTCACTCATAAGCGCGC  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  CGAAGCGGAGCTGGACAAGACCAACAAATTCATCAAGGAGCTCATCAAGGACGGGAAGTCGCTCATCAGCGCGC  148

Query  149  TCAAGAATTTGTCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGAT  222
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TCAAGAATTTGTCTTCGGCAAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGTATAGGAGAT  222

Query  223  GCAGAAACAGATGATGAGATGTGTATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGA  296
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCGAAACAGATGATGAGATGTGTATAGCGAGATCTTTGCAAGAATTTGCTGCTGTTCTCAGGAATCTTGAAGA  296

Query  297  TGAACGGATACGGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGA  370
            .||.||||..||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  CGAGCGGAGTCGAATGATCGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACACCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAGCAGA  370

Query  371  TCGGGGCTGCCAAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACAC  444
            |.|||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||.||||||||||||.
Sbjct  371  TTGGGGCCGCCAGGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACCGAGAAGTACTGCGGCACCTTAGAAAAACAT  444

Query  445  TTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCA  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  445  TTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAGGAATCCCAGCTACAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTTCGGCAACA  518

Query  519  TTTCTATGAAGTATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGG  592
            ||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TTTCTACGAAGTATCCCTGGAGTATGTCTTTAAGGTGCAGGAAGTGCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTAG  592

Query  593  AGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct  593  AGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTATGAGCTGGCCAAGGATTTTGGT  666

Query  667  GACTTCAAGACACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGA  740
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct  667  GACTTTAAGACACAGTTGACCATCAGCATACAAAATACAAGAAACCGCTTTGAAGGAACCAGGTCTGAGGTGGA  740

Query  741  ATCACTGATGAAAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACC  814
            |||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  741  ATCGCTGATGAAGAAGATGAAGGAAAACCCCCTGGAGCACAAGACCATCAGCCCGTACACCATGGAAGGGTACC  814

Query  815  TCTACGTGCAGGAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAA  888
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  TGTACGTGCAGGAGAAGCGTCACTTTGGAACTTCCTGGGTGAAGCACTACTGTACCTACCAACGGGATTCCAAA  888

Query  889  CAAATCACCATGGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATC  962
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||
Sbjct  889  CAAATCACCATGGTTCCATTCGACCAAAAGTCAGGAGGAAAGGGGGGAGAAGACGAGTCCGTTACCCTCAAATC  962

Query  963  CTGCACACGGCGGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGG  1036
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCACACGGCGAAAGACAGACTCCATCGAGAAGCGATTCTGCTTTGACGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGG  1036

Query 1037  TTATCACCATGCAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTC  1110
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  TTATCACCATGCAGGCGTTGTCGGAAGAGGACCGTAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTG  1110

Query 1111  TACAACTCGAACAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAA  1184
            ||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  TACAACTCCAACAGAGACAGCCAGAGCGAAGGGACCGCACAATTGGACAGTATCGGCTTCAGCATAATAAGGAA  1184

Query 1185  ATGCATCCATGCTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAG  1258
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  ATGCATCCATGCGGTGGAGACCAGAGGGATCAATGAGCAGGGGCTCTACCGAATCGTGGGGGTCAACTCCAGGG  1258

Query 1259  TGCAGAAGTTGCTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGG  1332
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259  TGCAGAAGTTGCTGAGCGTCCTGATGGACCCCAAAGCAGCTTCTGAGACAGAAACTGATATCTGTGCCGAATGG  1332

Query 1333  GAGATAAAGACCATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTT  1406
            ||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGATAAAGACCGTCACCAGTGCTCTGAAGACCTACCTGAGAATGCTCCCAGGACCCCTCATGATGTACCAGTT  1406

Query 1407  TCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTC  1480
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||.||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1407  TCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAGCTGGAAAACCAAGAGACTCGAGTGTCTGAGATCCACAGTCTTGTCC  1480

Query 1481  ATCGGCTCCCAGAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCAC  1554
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCGGCTCCCGGAGAAGAATCGGCAGATGTTGCAGCTGCTCATGAACCACCTGGCCAATGTTGCTAACAACCAC  1554

Query 1555  AAGCAGAATTTGATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAAC  1628
            |||||||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..||||..||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGCAGAATCTGATGACTGTGGCAAACCTGGGCGTGGTGTTTGGACCCACCTTGCTTCGGCCTCAGGAAGAAAC  1628

Query 1629  AGTAGCAGCCATCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATAT  1702
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1629  TGTGGCGGCCATCATGGACATCAAGTTTCAGAACATTGTCATCGAGATCTTAATCGAGAACCATGAGAAGATAT  1702

Query 1703  TTAACACCGTGCCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAG  1776
            |.|||||.|||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703  TCAACACGGTGCCTGATGTGCCCCTCACCAACGCCCAGCTACACCTGTCCCGGAAGAAAAGCAGTGACTCCAAG  1776

Query 1777  CCCCCGTCCTGCAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAA  1850
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||..|.||.|..||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1777  CCCCCATCCTGCAGCAAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCATGCTGTGCCATCCACAGAAAAACAGGAGCAGAGGAA  1850

Query 1851  CAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTAC  1924
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.|.||||||||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct 1851  CAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCGGTCTCCTCGAGTGCAAACAGCATCCTTAACTCTAGCAGCAGCCTGC  1924

Query 1925  AGCCCAACATGAACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAAT  1998
            |||||||..||||.|||||.|||.||.||||||.||||||||||||.|..|||||||..|||||          
Sbjct 1925  AGCCCAATCTGAATTCCAGCGACTCAAACCTGGATGTGGTCAAACCTAGTCGGCCCAGTTCACT----------  1988

Query 1999  CCAAGCCCAACTTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATC  2072
                                                                                      
Sbjct 1989  --------------------------------------------------------------------------  1988

Query 2073  CACGTCCAGCGACTCATCCCCCGTCAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAGCTGAAC  2146
                                       ||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.|
Sbjct 1989  ---------------------------CACACCATTCCGGAAGGCAAAGGCTTTGTACGCCTGCCAAGCTGAGC  2035

Query 2147  ATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAATGTTCACCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTG  2220
            |.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036  ACGACTCGGAGCTCTCCTTCACAGCGGGCACCGTCTTCGATAATGTTCATCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTG  2109

Query 2221  GAGGGGACTCTGAACGGAAAGACTGGCCTCATCCCTGAGAATTACGTGGAGTTCCTC  2277
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 2110  GAGGGGACTCTGAATGGAAAGACTGGCCTCATCCCAGAGAACTACGTGGAATTCCTC  2166