Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469771
• Subject: XM_017317985.1
• Aligned Length: 2497
• Identities: 1994
• Gaps: 272

Alignment

Query    1  ---------ATG------GGG--------------------CTCCCAGCGCTCGAGTTCAGCGACTGCTGCCTC  39
                     |||      |||                    ||||||| ||||                    |
Sbjct    1  ATGCTGGAAATGCTAAGCGGGATGCTTGACACAGTTGGTCACTCCCAG-GCTC--------------------C  53

Query   40  GATAGTCCGCACTTCCGAGAGACGCTCAAGTCGCACGAAGCAGA----GCTGGACAAGA---------CCAACA  100
            .|.|||||..||||||.|            ||.|||..||.|||    |.|..||||||         .||.|.
Sbjct   54  AAAAGTCCTGACTTCCCA------------TCTCACACAGAAGAAATTGGTTTACAAGAACATTACTCTCACCT  115

Query  101  AATTCATCAAGGAGCTCATCAAGGA--CGGGAA-----GTCACTCATAAGCGCGCTCAAGAATTTGTCTTCAGC  167
            |.||||     |||      |||.|  ||||.|     |.|     ||||   |..||.|.||||||||||.||
Sbjct  116  ACTTCA-----GAG------AAGAAAGCGGGTATTTTTGGC-----TAAG---GTACATGGATTTGTCTTCGGC  170

Query  168  GAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGATGATGAGA  241
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  171  AAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGTATAGGAGATGCCGAAACAGATGATGAGA  244

Query  242  TGTGTATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATACGGATGATT  315
            ||||||||||.||.||||||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||.||.||||..||.|||||.
Sbjct  245  TGTGTATAGCGAGATCTTTGCAAGAATTTGCTGCTGTTCTCAGGAATCTTGAAGACGAGCGGAGTCGAATGATC  318

Query  316  GAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCCAAGGAAGC  389
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||.||||||
Sbjct  319  GAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACACCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAGCAGATTGGGGCCGCCAGGGAAGC  392

Query  390  CAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTCTTCCAAAA  463
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  393  CAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACCGAGAAGTACTGCGGCACCTTAGAAAAACATTTGAATTTGTCTTCCAAAA  466

Query  464  AGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAGTATCCCTG  537
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  467  AGAAGGAATCCCAGCTACAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTTCGGCAACATTTCTACGAAGTATCCCTG  540

Query  538  GAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTGGCCTTCCT  611
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  541  GAGTATGTCTTTAAGGTGCAGGAAGTGCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTAGAGCCTCTGCTGGCCTTCCT  614

Query  612  GCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGACACAGTTAA  685
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  615  GCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTATGAGCTGGCCAAGGATTTTGGTGACTTTAAGACACAGTTGA  688

Query  686  CCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGAAAAAGATG  759
            ||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  689  CCATCAGCATACAAAATACAAGAAACCGCTTTGAAGGAACCAGGTCTGAGGTGGAATCGCTGATGAAGAAGATG  762

Query  760  AAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAGGAGAAACG  833
            |||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  763  AAGGAAAACCCCCTGGAGCACAAGACCATCAGCCCGTACACCATGGAAGGGTACCTGTACGTGCAGGAGAAGCG  836

Query  834  TCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCATGGTACCAT  907
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  837  TCACTTTGGAACTTCCTGGGTGAAGCACTACTGTACCTACCAACGGGATTCCAAACAAATCACCATGGTTCCAT  910

Query  908  TTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGCGGAAAACA  981
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  911  TCGACCAAAAGTCAGGAGGAAAGGGGGGAGAAGACGAGTCCGTTACCCTCAAATCCTGCACACGGCGAAAGACA  984

Query  982  GACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATGCAAGCTTT  1055
            ||||||||.||||||.|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  985  GACTCCATCGAGAAGCGATTCTGCTTTGACGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATGCAGGCGTT  1058

Query 1056  GTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAACAAAGACA  1129
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||
Sbjct 1059  GTCGGAAGAGGACCGTAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTGTACAACTCCAACAGAGACA  1132

Query 1130  GCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATGCTGTGGAA  1203
            |||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1133  GCCAGAGCGAAGGGACCGCACAATTGGACAGTATCGGCTTCAGCATAATAAGGAAATGCATCCATGCGGTGGAG  1206

Query 1204  ACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTGCTGAGTGT  1277
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1207  ACCAGAGGGATCAATGAGCAGGGGCTCTACCGAATCGTGGGGGTCAACTCCAGGGTGCAGAAGTTGCTGAGCGT  1280

Query 1278  CCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGACCATCACTA  1351
            |||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1281  CCTGATGGACCCCAAAGCAGCTTCTGAGACAGAAACTGATATCTGTGCCGAATGGGAGATAAAGACCGTCACCA  1354

Query 1352  GTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTTTCATCAAA  1425
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355  GTGCTCTGAAGACCTACCTGAGAATGCTCCCAGGACCCCTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTTTCATCAAA  1428

Query 1426  GCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCAGAGAAAAA  1499
            ||||||||.|||||.|||||.|||.||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1429  GCAGCAAAGCTGGAAAACCAAGAGACTCGAGTGTCTGAGATCCACAGTCTTGTCCATCGGCTCCCGGAGAAGAA  1502

Query 1500  TCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTTGATGACGG  1573
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 1503  TCGGCAGATGTTGCAGCTGCTCATGAACCACCTGGCCAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATCTGATGACTG  1576

Query 1574  TGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCATCATGGAC  1647
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||..||||..||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1577  TGGCAAACCTGGGCGTGGTGTTTGGACCCACCTTGCTTCGGCCTCAGGAAGAAACTGTGGCGGCCATCATGGAC  1650

Query 1648  ATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTGCCCGATAT  1721
            |||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||.|
Sbjct 1651  ATCAAGTTTCAGAACATTGTCATCGAGATCTTAATCGAGAACCATGAGAAGATATTCAACACGGTGCCTGATGT  1724

Query 1722  GCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTGCAGCGAGA  1795
            |||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1725  GCCCCTCACCAACGCCCAGCTACACCTGTCCCGGAAGAAAAGCAGTGACTCCAAGCCCCCATCCTGCAGCAAGA  1798

Query 1796  GGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCAACTCCAGT  1869
            |||||||||||||||||||..|.||.|..||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799  GGCCCCTGACGCTCTTCCATGCTGTGCCATCCACAGAAAAACAGGAGCAGAGGAACAGCATCATCAACTCCAGT  1872

Query 1870  TTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATGAACTCCAG  1943
            ||||||||.|||||.||.|.|.||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||..||||.|||||
Sbjct 1873  TTGGAATCGGTCTCCTCGAGTGCAAACAGCATCCTTAACTCTAGCAGCAGCCTGCAGCCCAATCTGAATTCCAG  1946

Query 1944  TGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAACTTCACCCC  2017
            .|||.||.||||||.||||||||||||.|..|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1947  CGACTCAAACCTGGATGTGGTCAAACCTAGTCGGCCCAGTTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAACTTCACCCC  2020

Query 2018  TCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCGACTCATCC  2091
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2021  TCTCGCCATCATGGCCCATGTTCTCGGCACCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCGACTCATCC  2094

Query 2092  CCCGT---------------------------------------------------------------------  2096
            |||.|                                                                     
Sbjct 2095  CCCATCAGGTCTGTGGCAGGGTTTGTTTGGTTTTCTGTTGCTGCCGTTGTTCTCTCATTGGCTTGGTCCTCTCT  2168

Query 2097  --------------------------------------------------------------------------  2096
                                                                                      
Sbjct 2169  TCATGCAGTGTTCAGCCTCCTCGTCAACTTTGTTCCCTGCCATCCAAACCTGCACTTGCTTTTTGACAGGCCAG  2242

Query 2097  ----------------------CAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAGCTGAACAT  2148
                                  |||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.
Sbjct 2243  AAGAAGCGGTCCGTGAAGACTCCAGCACACCATTCCGGAAGGCAAAGGCTTTGTACGCCTGCCAAGCTGAGCAC  2316

Query 2149  GACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAATGTTCACCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGA  2222
            |||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2317  GACTCGGAGCTCTCCTTCACAGCGGGCACCGTCTTCGATAATGTTCATCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGA  2390

Query 2223  GGGGACTCTGAACGGAAAGACTGGCCTCATCCCTGAGAATTACGTGGAGTTCCTC  2277
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 2391  GGGGACTCTGAATGGAAAGACTGGCCTCATCCCAGAGAACTACGTGGAATTCCTC  2445