Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469808
- Subject:
- NM_001178030.1
- Aligned Length:
- 2019
- Identities:
- 1634
- Gaps:
- 375
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGGTAAGCTGGGCCCCCCCGGGCTGCCCCCGCTCCCCGGGCCCAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGGAGGCTTCGAGCCGGGCCCTCCGCCTGCACCCGGGCCTGGGGCGGGGCTGCTGGCTCCCGGGCCGCCGCCGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCCCGCCCGTGGGCTCGATGGGGGCCCTGACCGCGGCCTTCCCCTTCGCGGCGCTGCCTCCGCCGCCTCCGCCG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCGCCCCCTCCGCCTCCCCAGCAGCCGCCGCCGCCTCCACCGCCACCGTCCCCCGGCGCCTCGTACCCGCCGCC 296
Query 1 ------------------------------------ATGGCGACCGGAGCGAACGCCAC----GCCGTTG---- 30
.|.||..|||.|||...|||||| ||||..|
Sbjct 297 GCAGCCGCCCCCTCCGCCGCCGCTCTACCAGCGCGTGTCGCCGCCGCAGCCGCCGCCACCCCAGCCGCCGCGTA 370
Query 31 -----------------------------------GACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAAC 69
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGACCAGCAGCCGGGCCCGGCCGGCGGCGGAGGAGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAAC 444
Query 70 CAAGACACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACA 143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGACACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACA 518
Query 144 AGAAAGAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCC 217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAAAGAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCC 592
Query 218 CCCCTAACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGA 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCCTAACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGA 666
Query 292 GAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGA 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGA 740
Query 366 TTTCAAGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGT 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTCAAGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGT 814
Query 440 ACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGC 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGC 888
Query 514 AATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTT 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTT 962
Query 588 GCCAGGAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAAC 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCAGGAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAAC 1036
Query 662 AGATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGG 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGG 1110
Query 736 GAGTTGGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGAC 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGTTGGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGAC 1184
Query 810 CCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCC 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCC 1258
Query 884 AAAGGCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAA 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAGGCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAA 1332
Query 958 CTGGGTGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACC 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGGGTGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACC 1406
Query 1032 TCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGA 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGA 1480
Query 1106 TGAATTCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGC 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAATTCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGC 1554
Query 1180 CCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAA 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAA 1628
Query 1254 TGGACCCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATG 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGGACCCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATG 1702
Query 1328 GCCCTCCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAA 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCCCTCCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAA 1776
Query 1402 GGTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCC 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCC 1850
Query 1476 TCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTA 1549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTA 1924
Query 1550 TGGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAGATCCCTCCCCGCGGCGGCGATGGCCCGAGCCATGAGAGTG 1623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAGATCCCTCCCCGCGGCGGCGATGGCCCGAGCCATGAGAGTG 1998
Query 1624 AGGACTTTCCGCGCCCATTGG 1644
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGGACTTTCCGCGCCCATTGG 2019